さまざまな公衆衛生サーベイランスおよび微生物研究アプリケーションを可能にする、柔軟で合理化されたNGSライブラリー調製キット。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Illumina Microbial Amplicon Prep (iMAP)は、COVIDSeqと同じケミストリーで構築されたアンプリコンベースのライブラリー調製キットです。ライブラリー調製は高速かつシンプルで、ほぼすべてのIlluminaシーケンスシステムと互換性のあるライブラリーが備わっています。キットは、ウイルス全ゲノムシーケンス、抗菌薬耐性マーカー解析、細菌や真菌の同定など、さまざまな感染症、公衆衛生サーベイランス、微生物研究のアプリケーションに使用できます。
ハンズオンタイムを短くして、あらゆる規模で卓越したデータ品質と精度でシーケンス結果を得ることができます。
このキットは、カスタム、公開済み、または市販のプライマーセット（プライマーオリゴは含まれません）と併用でき、培養、スワブ（鼻咽頭、皮膚、鼻）、廃水などのソースから抽出されたRNAまたはDNAと互換性があります。解析は、事前にロードされたターゲットを備えたBasespace Sequence Hub上のDRAGEN Targeted Microbial Appを使用して実施できます。カスタム解析用にファイルを簡単にアップロードすることもできます。
*プロトコールは情報提供のみを目的としています。これは、プロトコールがイルミナによって検証またはサポートされていることを意味するものではありません。
1. Illumina. Accessed September 8, 2023, from Illumina Microbial Amplicon Prep for viral surveillance
2. DengueSeq: A pan-serotype whole genome amplicon sequencing protocol for dengue virus V.2. Accessed September 8, 2023, from https://www.protocols.io/view/dengueseq-a-pan-serotype-whole-genome-amplicon-seq-kqdg39xxeg25/v2
3. Bhatt L, Bhoyar RC, Jolly B, Israni R, Vignesh H, Scaria V, Sivasubbu S. The genome sequence of lumpy skin disease virus from an outbreak in India suggests a distinct lineage of the virus. Arch Virol. 2023 Feb 5;168(3):81. doi: 10.1007/s00705-023-05705-w.
4. Monkeypox virus multiplexed PCR amplicon sequencing (PrimalSeq) V.4. Accessed September 8, 2023, from https://www.protocols.io/view/monkeypox-virus-multiplexed-pcr-amplicon-sequencin-5qpvob1nbl4o/v4?step=2
5. Whole-Genome Amplification of Respiratory Syncytial Virus (RSV) using Illumina CovidSeq reagents for Next-Generation Sequencing V.2. Accessed September 8, 2023, from https://www.protocols.io/view/whole-genome-amplification-of-respiratory-syncytia-eq2lyjzbrlx9/v2
6. SARS-CoV-2 version 5.3.2 scheme release. Accessed September 12, 2023, from https://community.artic.network/t/sars-cov-2-version-5-3-2-scheme-release/462
7. Rabies Virus Bat-Clade Sequencing. Accessed October 30, 2023, from https://www.protocols.io/view/rabies-virus-bat-clade-sequencing-8epv5x3bng1b/v1
| アッセイ時間 | <9時間 |
|---|---|
| Automation capability | Liquid handling robots |
| 説明 | Illumina Microbial Amplicon Prep（IMAP）は、RT-PCR、ライブラリー調製、48サンプル用のインデックスを含むアンプリコンベースのライブラリー調製ソリューションです。COVIDSeqと同じケミストリーに基づいて構築されており、DNAおよびRNAのサンプルに使用できます。オリゴプライマーはキットに同梱されておらず、別途ご購入いただく必要があります。 |
| ハンズオンタイム | 48サンプルで約3時間 |
| インプット量 | サンプル源によって異なります |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System |
| 作用機序 | マルチプレックスPCR法 |
| 手法 | Amplicon sequencing |
| Nucleic acid type | DNA, RNA |
| サンプルタイプの詳細 | 鼻腔スワブから廃水まで、幅広い種類のサンプルに対応 |
| Species category | Other, Yeast, Virus, Bacteria |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| バリアントクラス | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Single nucleotide variants (SNVs) |
Illumina Microbial Amplicon Prep
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Illumina Microbial Amplicon Prep
20097857
cDNA変換、ライブラリー調製、インデックスを含む48サンプルアンプリコンキット。プライマーは含まれません。
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進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
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幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス配列ライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフロー。
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