高感度で包括的な呼吸器病原体の同定と抗菌剤耐性に関する洞察を提供するライブラリー調製および濃縮キット。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel（RPIP）キットは、次世代シーケンサー（NGS）をベースとした呼吸器病原体パネルおよびライブラリー調製と濃縮キットで、1回のアッセイで280種類を超える呼吸器病原体と2000種類を超える抗菌剤耐性（AMR）マーカーをターゲットとし、病原体の同定と関連するAMR情報の両方を提供します。
DRAGEN Microbial Enrichment Plusとともに、柔軟でスケーラブルなサンプルから結果までのワークフローは、臨床研究環境での気道感染に関連する病原体を同定するための迅速で費用対効果の高いソリューションを提供します。
| アッセイ時間 | ライブラリー調製時間<9時間 |
|---|---|
| 自動化機能 | 自動液体分注システム |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る |
| コンテンツ仕様 | 呼吸器病原体のDNAとRNAを同時に検出し、抗菌薬耐性（AMR）遺伝子発現を同時にプロファイリングします。 |
| 説明 | 呼吸器感染症と複数感染を同定し、抗菌薬耐性マーカーを検出し、重要な病原体（SARS-CoV-2およびインフルエンザA/Bウイルス）の系統タイピングを実行して、ウイルスの進化と伝播を研究します。 |
| ハンズオンタイム | ライブラリー調製時間<2時間 |
| インプット量 | 容量に基づく（濃度に依存しない） |
| システム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, MiniSeq System, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム |
| 作用機序 | オンビーズタグメンテーションとそれに続くシングルハイブリダイゼーションステップ |
| 手法 | ターゲットDNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 |
| マルチプレックス | ユニークデュアルインデックスで1回のランで最大384サンプル |
| 核酸の種類 | DNA, RNA |
| 生物種カテゴリー | 真菌, ウイルス, 細菌 |
| 生物種詳細 | 呼吸器病原体（180以上の細菌、50以上の真菌、SARS-CoV-2を含む40以上のウイルス）および抗菌薬耐性アリル（1200以上）を検出します。 |
| テクノロジー | シーケンス |
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kitに加えて、ドキュメントセクションのユーザーガイドに記載されているシーケンス装置、対応するシーケンス試薬、および追加の製品が必要です。
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| MiniSeqシステム | MiniSeqラピッドキット：サンプルあたり1Mシングルリードに基づき、ランあたり20サンプル。MiniSeq高出力キット：サンプルあたり1Mシングルリードに基づき、ランあたり25サンプル。 |
ラピッドキット：1 x 100 bp 高出力キット：1 × 75 bp |
| MiSeqシステム | MiSeq v3キット：サンプルあたり2Mペアエンドリードに基づく25サンプル/ラン。MiSeq v2 Kit：サンプルあたり2Mペアエンドリードに基づき、ランあたり15サンプル。 |
MiSeq v3キット：2 x 75 bp MiSeq v2キット：2 x 150 bp |
| NextSeq 550システム | NextSeq 550 High-Output Kit：1サンプルあたり2M0万ペアエンドリードに基づくランあたり384サンプル（利用可能なインデックス）。 NextSeq 550 Mid-Output Kit：サンプルあたり2Mペアエンドリードに基づくランあたり130サンプル。 |
NextSeq 550高出力キット：2 x 75 bp NextSeq 550高出力キット：2 x 150 bp NextSeq 550中間出力キット：2 x 75 bp NextSeq 550中間出力キット：2 x 150 bp |
NGSは、新型コロナウイルスのバリアントの同定、COVID-19伝播トラッキングなどを可能にします。コロナウイルスシーケンスの様々な目的に応じたNGS法を比較してください。
NGSは、コロナウイルスやその他の新たな感染症病原体の新規株を特定することにより、効果的なゲノムサーベイランス戦略をサポートします。
| Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit | Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit | |
|---|---|---|
| アッセイ時間 | ライブラリー調製時間<9時間 | ライブラリー調製時間9時間未満 |
| 自動化機能 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る |
| コンテンツ仕様 | 呼吸器病原体のDNAとRNAを同時に検出し、抗菌薬耐性（AMR）遺伝子発現を同時にプロファイリングします。 | SARS-CoV-2、インフルエンザA型およびB型ウイルス、アデノウイルス、ライノウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、およびその他の一般的な呼吸器系ウイルスを含む、約40の一般的な呼吸器系ウイルスをターゲットとし、特性を明らかにします。 |
| 説明 | 呼吸器感染症と複数感染を同定し、抗菌薬耐性マーカーを検出し、重要な病原体（SARS-CoV-2およびインフルエンザA/Bウイルス）の系統タイピングを実行して、ウイルスの進化と伝播を研究します。 | SARS-CoV-2およびその他の一般的な呼吸器系ウイルスを検出および解析するための合理化されたワークフロー。アグノスティックなデザインにより、関心のある複数のサンプルタイプにわたる病原性ウイルスの広範な同定が可能です。 |
| ハンズオンタイム | ライブラリー調製時間<2時間 | ライブラリー調製時間<2時間 |
| インプット量 | 容量に基づく（濃度に依存しない） | 10～100 ng |
| システム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, MiniSeq System, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, MiniSeq System, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム |
| 作用機序 | オンビーズタグメンテーションとそれに続くシングルハイブリダイゼーションステップ | オンビーズタグメンテーションとそれに続くシングルハイブリダイゼーションステップ |
| 手法 | ターゲットDNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 | ターゲットDNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 |
| マルチプレックス | ユニークデュアルインデックスで1回のランで最大384サンプル | ユニークデュアルインデックスで1回のランで最大384サンプル |
| 核酸の種類 | DNA, RNA | DNA, RNA |
| 生物種カテゴリー | 真菌, ウイルス, 細菌 | ヒト, ウイルス |
| 生物種詳細 | 呼吸器病原体（180以上の細菌、50以上の真菌、SARS-CoV-2を含む40以上のウイルス）および抗菌薬耐性アリル（1200以上）を検出します。 | 最近のインフルエンザウイルス株やSARS-CoV-2を含む一般的な呼吸器系ウイルスを検出します。このパネルには、品質機能としてヒトターゲットへのプローブが含まれているため、アッセイに使用したすべてのサンプルでヒトターゲットを検出できます。 |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス |
ターゲットエンリッチメントプローブとRespiratory Pathogen ID/AMR Panel Kitワークフローは、プローブで完全にタイル状にされたパネル内の2つのウイルスを均一にカバーします。
Respiratory Pathogen ID/AMR Panel Kitを用いて、A. fumigatusを除き100ゲノムコピー以上の病原体を検出しました。インフルエンザAの検出感度は高く、10のゲノムコピーに対して検出されました。
Respiratory Pathogen ID/AMR Panel Kitは、スパイクインコントロールを使用した病原体レベルの定量と、その後のExplify RPIP Data Analysis Appを使用した解析を可能にします。この図は、qPCRとNGSによって測定された臨床研究サンプルにおけるSARS-CoV-2ウイルス量の比較を示しています。この2つの手法は、Spearman r = 0.87の有意な相関を示しています。重要なのは、このNGSアプローチではqPCRのような検量線の生成が不要である点です。
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set A (RUO) (96 indexes, 96 samples)
20047050
96サンプルからライブラリーを調製し、その後32回の3プレックス濃縮反応を行う、イルミナRNA Prep with Enrichmentキット試薬、イルミナDNA/RNA UDインデックスセットAのIDT、呼吸器病原体ID/AMRパネルなど、ライブラリー調製と濃縮に必要なすべての試薬が含まれます。
List Price:
Discounts:
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set B (RUO) (96 indexes, 96 samples)
20046969
96サンプルからライブラリーを調製し、その後32の3プレックス濃縮反応を行うため、イルミナRNA Prep with Enrichmentキット試薬、イルミナDNA/RNA UD Indexes Set B用IDT、呼吸器病原体ID/AMRパネルなど、ライブラリー調製と濃縮に必要なすべての試薬が含まれます。
List Price:
Discounts:
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set C (RUO) (96 indexes, 96 Samples)
20047051
96サンプルからライブラリーを調製し、その後32の3プレックス濃縮反応を行う、イルミナRNA Prep with Enrichmentキット試薬、イルミナDNA/RNA UD Indexes Set C、呼吸器病原体ID/AMRパネルなど、ライブラリー調製と濃縮に必要なすべての試薬が含まれます。
List Price:
Discounts:
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set D (RUO) (96 indexes, 96 Samples)
20047052
96サンプルからライブラリーを調製し、その後32の3プレックス濃縮反応を行うため、イルミナRNA Prep with Enrichmentキット試薬、イルミナDNA/RNA UD Indexes Set D、呼吸器病原体ID/AMRパネルなど、ライブラリー調製と濃縮に必要なすべての試薬が含まれます。
List Price:
Discounts:
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製品名
数量
単価
製品名
カタログ番号
量
単価
通常、最低1 x 100 bpまたは2 x 75 bpのシーケンス手法を使用して、サンプルごとに1Mシングルリードまたは2Mペアエンドリードから開始することを推奨しています。これらの数値は出発点であり、サンプルタイプやターゲット量に基づいて最適化する必要があります。
このロースループット～ミッドスループットのNGSアッセイにより、あらゆる規模のラボで、新しいSARS-CoV-2変異株の出現および有病率を特定して追跡することができます。
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
このロースループット～ミッドスループットのNGSアッセイにより、あらゆる規模のラボで、新しいSARS-CoV-2変異株の出現および有病率を特定して追跡することができます。
Reagent v2.5 Kitは、初期の蛍光強度を維持する耐久性のあるフローセルを使用しており、以前のバージョンと比較して安定性と性能が向上しています。
MiniSeqシステム試薬キットは、2チャンネルのSBSケミストリーを備えたすぐに使えるカートリッジで、サンプル数が少ない場合でもコスト効率の高いシーケンスが可能です。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
このハイスループットのNGSアッセイにより、ラボは新しいSARS-CoV-2変異株の出現および有病率を特定して追跡することができます。
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