NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
COVIDSeq テスト（RUO版）は、研究者がSARS-CoV-2の新規バリアントを検出し、特徴づけることができる次世代シーケンサー（NGS）アッセイです。
COVIDSeqテスト（RUO版）
このハイスループットのNGSアッセイにより、ラボは新しいSARS-CoV-2変異株の出現および有病率を特定して追跡することができます。
本製品は研究専用（RUO）です。本製品の臨床検査用バージョンは、各国の許認可機関の下で日本、フィリピン、および米国でご利用いただけます。
概要
迅速でスケーラブルなシーケンス
Illumina COVIDSeqテスト（RUO版）は、スループットのニーズに応じて384～3072のサンプルに対応します。
均一なゲノムカバレッジ
カバレッジは特にスパイクタンパク質座位合わせています。詳細なシーケンスでは、オプションのARTIC v4プライマープールにより、新バリアントの詳細な特性評価が可能です。
統合ソリューション
キットには、cDNA変換、増幅、ライブラリー調製に必要な試薬がすべて含まれています。PCR中の63°Cのアニール温度は、バリアント解析と洞察を向上させます。
合理化されたデータ解析
BaseSpace Sequence HubのイルミナDRAGEN COVID Lineageアプリを含むオープンソフトウェアツールで系統を評価し、変異に注釈を付けます。
仕様
| 自動化機能 | 自動液体分注システム |
|---|---|
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る |
| コンテンツ仕様 | スパイクタンパク質座位全体で均一なウイルスゲノムカバレッジ |
| 説明 | COVIDSeq テスト（RUO版）は、研究アプリケーション用のスケーラブルなハイスループットNGSアッセイ（最大3,072サンプル）です。 |
| システム | MiSeq System, iSeq 100システム, NextSeq 550 System, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, MiniSeq System, 研究（RUO）モードのNextSeq 550Dx システム, 研究（RUO）モードのNovaSeq 6000Dx システム, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000システム |
| 手法 | アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス |
| マルチプレックス | NextSeqの384プレックス NovaSeqの384プレックス |
| 核酸の種類 | RNA |
| サンプルタイプの詳細 | 鼻咽頭、中咽頭、中鼻甲介の鼻腔スワブサンプル |
| 生物種カテゴリー | ヒト, ウイルス |
| 生物種詳細 | SARS-CoV-2（SARS-CoV-2_ MN908947v3） |
| ストランド特異性 | ストランド情報なし |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
必要な製品
Illumina COVIDSeq テスト (3072 Samples)に加えて、以下が必要です。
IDT for Illumina PCR Indexes Sets 1–4（384インデックス、384サンプル）
シーケンスシステム用のフローセル
シーケンスシステム用のシーケンス試薬キット
ウイルスRNA抽出キット（例：QIAamp Viral RNA Mini Kit）
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件
アプリケーション
COVIDSeq テスト（RUO版）は、SARS-CoV-2の検出と特性評価のための統合NGS研究ソリューションです。診断手順や患者管理には使用できません。
ワークフローの例
ワークフローの管理
ライブラリー調製
Illumina COVIDSeqテスト（RUO版）
アプリケーションノート
関連するアプリケーションとメソッド
NGSは、新型コロナウイルスのバリアントの同定、COVID-19伝播トラッキングなどを可能にします。コロナウイルスシーケンスの様々な目的に応じたNGS法を比較してください。
仮説の不要なメソッドとして、NGSは、わずか1つのSNPだけ異なる感染症株を区別し、複数の検査の必要性に置き換えることができます。
SARS-CoV-2ウイルスに対する宿主の遺伝的差異と個々の免疫応答を研究することで、COVID-19の発病しやすさと重症度を明らかにすることができます。
ドキュメント
製品資料
サポートドキュメント
- Infinium Global Clinical Research Array Documentation
- Illumina Adapter Sequences
- イルミナDRAGEN COVIDSeqテストパイプラインソフトウェアガイド（RUO）
- イルミナDRAGEN COVIDSeqテストアプリガイド（RUO）
- Illumina COVIDSeq RUO Kits Reference Guide
- Index Adapters Pooling Guide
- イルミナDRAGEN COVIDパイプラインソフトウェアガイド
- イルミナアダプター配列
- All Illumina COVIDSeq テストRUO Support
- All Illumina COVIDSeq テストRUOドキュメント Support
比較する
| COVIDSeqテスト（RUO版） | COVIDSeq Assay (96サンプル) | Pan-Coronavirus Panel | Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit | |
|---|---|---|---|---|
| 自動化機能 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | |
| コンテンツ仕様 | スパイクタンパク質座位全体で均一なウイルスゲノムカバレッジ | Whole viral genome coverage including the spike protein locus | 呼吸器病原体のDNAとRNAを同時に検出し、抗菌薬耐性（AMR）遺伝子発現を同時にプロファイリングします。 | |
| 説明 | COVIDSeq テスト（RUO版）は、研究アプリケーション用のスケーラブルなハイスループットNGSアッセイ（最大3,072サンプル）です。 | COVIDSeq Assay（96サンプル）は、研究アプリケーション用のイルミナのベンチトップシーケンスシステムで処理することを目的とした、ロースループット～ミッドスループットのNGSアッセイです。 | Pan-Coronavirus Panelは、さまざまな動物宿主における200を超える既知および新型コロナウイルス株の検出と全ゲノムシーケンスを可能にする統合ワークフローの一部です。 | 呼吸器感染症と複数感染を同定し、抗菌薬耐性マーカーを検出し、重要な病原体（SARS-CoV-2およびインフルエンザA/Bウイルス）の系統タイピングを実行して、ウイルスの進化と伝播を研究します。 |
| システム | MiSeq System, iSeq 100システム, NextSeq 550 System, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, MiniSeq System, 研究（RUO）モードのNextSeq 550Dx システム, 研究（RUO）モードのNovaSeq 6000Dx システム, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000システム | MiSeq System, iSeq 100システム, NextSeq 550 System, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, MiniSeq System, 研究（RUO）モードのNextSeq 550Dx システム, 研究（RUO）モードのNovaSeq 6000Dx システム, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000システム | MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, MiniSeq System | MiSeq System, NextSeq 550 System, MiniSeq System |
| 手法 | アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス | アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス | 全ゲノムシーケンス, ターゲット濃縮 | ターゲットDNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 |
| マルチプレックス | NextSeqの384プレックス NovaSeqの384プレックス | iSeqシステム上の8プレックス MiSeqシステムの30～48プレックス MiniSeqシステムの48プレックス | ユニークデュアルインデックスで1回のランで最大384サンプル | ユニークデュアルインデックスで1回のランで最大384サンプル |
| 核酸の種類 | RNA | RNA | RNA | DNA, RNA |
| サンプルタイプの詳細 | 鼻咽頭、中咽頭、中鼻甲介の鼻腔スワブサンプル | 鼻咽頭、中咽頭、中鼻甲介の鼻腔スワブサンプル | ||
| 生物種カテゴリー | ヒト, ウイルス | ウイルス | ウイルス | 真菌, ウイルス, 細菌 |
| 生物種詳細 | SARS-CoV-2（SARS-CoV-2_ MN908947v3） | SARS-CoV-2（SARS-CoV-2_ MN908947v3） | 呼吸器病原体（180以上の細菌、50以上の真菌、SARS-CoV-2を含む40以上のウイルス）および抗菌薬耐性アリル（1200以上）を検出します。 | |
| ストランド特異性 | ストランド情報なし | ストランド情報なし | ストランド情報なし | |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングでき、キットの比較や共有も可能です。
図
ゲノムカバレッジ性能
リード長と深度の関数としてのヒートマッププロット性能は、シングルリードよりもペアエンドリードで大幅に改善しています。確実に0.99を超えるゲノムの割合が示されており、1に近い値はSARS-CoV-2ゲノムのより完全なカバレッジを表します。
よくある質問（FAQ）
COVIDSeqテスト（RUO版）はNovaSeq 6000 システムを対象としています。また、iSeq 100、MiniSeq、MiSeq、MiSeqDx in Research Mode、NextSeq 500、NextSeq 550、NextSeq 550Dx in Research Mode、NextSeq 1000、またはNextSeq 2000システムで実行することもできます。
主な違いは、各アッセイで実行できるサンプル数です。COVIDSeq Assay（96サンプル）は、イルミナのベンチトップシーケンスシステムで96サンプルを実行できるため、小規模の基礎研究室に対応します。一方、COVIDSeqテスト（RUO）は、NovaSeq 6000 システムまたはNextSeqシーケンスシステムのラインで最大3,072のサンプルを実行できます。
はい。体 外診断（IVD）検査は 、各国の認可機関の下で認可国（日本、フィリピン、米国）で使用できます。
ARTIC v3プライマープールは、COVIDSeq テスト（RUO）キットに含まれています。SARS-CoV-2の原株に対して設計された98のアンプリコンと11のヒト遺伝子用のプライマーが含まれています。オプションのARTIC v4プールには、99アンプリコンが含まれており、Deltaバリアントに対して設計されたヒトコントロールは含まれません。スパイクタンパク質座位全体のゲノムカバレッジを改善し、SARS-CoV-2バリアント検出の分析感度を向上させます。テクニカルノートを読む
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件
MiSeq Reagent Kit v3
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。
COVIDSeq Assay (96サンプル)
このロースループット～ミッドスループットのNGSアッセイにより、あらゆる規模のラボで、新しいSARS-CoV-2変異株の出現および有病率を特定して追跡することができます。
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
高感度で包括的な呼吸器病原体の同定と抗菌剤耐性に関する洞察を提供するライブラリー調製および濃縮キット。
Pan-Coronavirus Panel
このパネルは、ヒトおよび動物のリザーバーから得られた既知および新規のコロナウイルス225種の特性評価とゲノムサーベイランスをサポートします。
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