感染症のためのNGS

ゲノミクスは、感染症、病原体の進化、病気の伝播、宿主と病原体の相互作用、抗生物質耐性についての私たちの理解を変えています。そのため、公衆衛生の専門家は、インフルエンザ、結核、エボラ、そして最近ではコロナウイルスなどの有名な感染症の流行とパンデミックを調査および監視するために使用するメソッドを変更しています。

感染性因子を評価する従来のメソッドには、抗体ベースの検査、リアルタイムPCR、パルスフィールドゲル電気泳動、多遺伝子座シーケンスタイピングが含まれます。これらの方法は通常、少数の定義された数の生物に対してのみ有用であり、データ分析は主観的となる可能性があります。対照的に、次世代シーケンス（NGS）は、ウイルス、細菌、真菌、寄生虫で使用できる感染症の特性評価とサーベイランスのための普遍的で培養の不要な方法を実現し、複数の検査の必要性を置き換えることができます。