宿主-病原体相互作用解析
宿主-病原体相互作用の遺伝学
感染症との闘いと治療法の発見の両方に不可欠なのは、疾患の病因、病原体の病原性、さらにはヒトの微生物叢が病原体や治療法に対する奏功にどのように影響するかを理解することです。次世代シーケンサー（NGS）は、研究者が宿主-病原体相互作用を研究し、病原体がどのように疾患を引き起こすかを明らかにし、病原体感染メカニズムを探索するのに役立ちます。これらの要因を理解することで、情報に基づく公衆衛生上の意思決定ができるようになり、将来の潜在的な治療ターゲットを特定するのに役立ちます。
NGSは、宿主の微生物叢が免疫、ワクチンの有効性、または治療応答に影響を与えるかどうかを調査する臨床研究で、病原体と宿主遺伝子発現の両方の影響と、これが疾患または治療に対する宿主応答にどのように影響するかを調べるためにも使用できます。Illumina NGSを使用して宿主と病原体の相互作用の遺伝学を研究する主な利点は、以下のとおりです。
- 多様なサンプルセットをスクリーニングする拡張性
- 宿主、病原体、微生物叢の機能解析を行い、結果を宿主反応に相関させるためのマルチオミクスアプローチを促進するソリューション
- プロジェクト規模に合わせた解析ソリューション
宿主-病原体トランスクリプトーム解析
NGSベースのRNAシーケンスは、宿主および病原体の遺伝子と転写産物の活性化/不活性化、さらに発現レベルに関する貴重な情報を明らかにすることができます。これらの結果は、病原性プロセスにおける宿主と病原体の相互作用の役割と、疾患伝播に関与する生物学的経路を明らかにすることができます。さらに、メタトランスクリプトーム解析は、宿主、病原体、微生物群集のメンバー間の複雑な相互作用を明らかにすることができます。
注目の宿主-病原体相互作用解析ワークフロー
関連ソリューション
マイクロバイオーム解析
ヒトの体内外にある微生物群集を研究することにより、研究者は健康や疾患における微生物の役割を理解することができます。
ショットガンメタゲノミクス
特定の複雑なサンプルに含まれるすべてのゲノムコンテンツを解析します。微生物群集の機能の可能性を予測し、抗菌薬耐性と病原性遺伝子を検出し、微生物の多様性を評価し、微生物を培養なしで解析します。
微生物トランスクリプトミクス
RNAシーケンスは、細菌・ウイルス・その他の微生物の転写産物を解析および定量化するための偏りのないアプローチを提供します。
感染症とNGS
NGS は、新しい病原体を特定し、わずか1つのSNPだけが異なる感染症株を区別します。アッセイを複数回行う必要もありません。
COVID-19宿主リスクと反応
SARS-CoV-2ウイルスに対する宿主の遺伝的リスク因子と免疫系の反応を研究する方法を探ります。