呼吸器ウイルスオリゴパネル

包括的で迅速なターゲットエンリッチメントシーケンスにより、COVID-19株を含む一般的な呼吸器系ウイルスの高感度な検出と特性評価を行います。 続きを読む...
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パネル

Respiratory Virus Oligos Panel V2

20044311

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ライブラリー調製

Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation(16サンプル)

20040536

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Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation(96サンプル)

20040537

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インデックスアダプター

IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96インデックス、96サンプル)

20027213

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation(96インデックス、96サンプル)

20027214

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製品のハイライト

Respiratory Virus Oligo Panel with Illumina RNA Prep with Enrichmentを使用すると、研究者はSARS-CoV-2の存在を確認し、バリアント解析研究を進めることができる次世代シーケンス(NGS)データを取得できます。アグノスティックなデザインにより、病原性呼吸器系ウイルスの広範な同定が可能です。

呼吸器系ウイルス検出のためのターゲットエンリッチメント

ハイブリッドキャプチャー法によるターゲットエンリッチメントにより、ショットガンメタゲノミクスシーケンスに必要となるような高いリード深度がなくとも、高感度な検出が可能です。さらに、この方法ではターゲットのほぼ完全なシーケンスデータが得られ、ウイルスの進化やウイルスサーベイランスのためのバリアント解析などのアプリケーションが開かれます。1

アンプリコンシーケンスなどの他のターゲットリシーケンス手法と比較して、ハイブリッドキャプチャーによるエンリッチメントでは、ターゲット領域のより包括的なプロファイリングにより、大幅に大規模なプローブパネルを作成することが可能です。さらに、ハイブリッドキャプチャープロトコールに使用されるオリゴプローブは、高度に変異原性の領域内であっても効果的であり、RNAウイルスなどの急速に進化するウイルスをターゲットにすることができます。

合理化されたワークフロー

この包括的なワークフローは、サンプル調製、ライブラリー調製、ターゲットエンリッチメント、シーケンス、データ解析を統合します。このワークフローは、全核酸抽出からウイルスターゲットを濃縮することを目的としています。

抽出されたRNAの逆転写とライブラリー調製は、Illumina RNA Prep with Enrichmentを使用して行い、その後Illumina Respiratory Virus Oligo Panelで濃縮します。イルミナのNGSシステムでシーケンスした後、DRAGEN Pathogen DetectionパイプラインとIDbyDNA Explifyプラットフォームを使用してデータ解析が進められます。

  1. Gaudin M and Desnues C. Hybrid Capture-Based Next Generation Sequencingとそのヒト感染症への応用。前面の微生物。2018; 9:2924。

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仕様

製品比較

呼吸器ウイルスオリゴパネル Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit

ワークフローの例

 

サポートデータと図

 

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