Respiratory Virus Oligo Panel v2（RVOP v2、20044311）は、パネル、ライブラリー調製試薬および濃縮試薬、インデックスアダプターを含む包括的なキット（セットA～D）で販売されています。RVOPまたはその他の個別のコンポーネントを注文する必要がある場合は、MyIlluminaから購入できます。
Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit
包括的で迅速なターゲットエンリッチメントシーケンスにより、SARS-CoV-2株を含む一般的な呼吸器系ウイルスの高感度な検出と特性評価を行います。
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パネル
ライブラリー調製
インデックスアダプター
合計：
製品のハイライト
Illumina Respiratory Virus Enrichment Kitでは、SARS-CoV-2やインフルエンザA/Bウイルスなど、40を超える重要な呼吸器系ウイルスの全ゲノム次世代シーケンス（NGS）データを取得できます。このキットは、存在するターゲットウイルスの同定、バリアントの同定と追跡、および幅広い種類のサンプルにおけるウイルスサーベイランスを可能にします。1
呼吸器系ウイルス検出のためのターゲットエンリッチメント
ハイブリッドキャプチャー法によるターゲットエンリッチメントにより、ショットガンメタゲノムシーケンスに必要な高いリード深度を必要とせずに高感度な検出が可能になります。さらに、この方法では、ウイルスターゲットのほぼ完全な全ゲノムシーケンスデータを取得でき、さまざまな異なるアプリケーションに対応する柔軟なソリューションを提供します。アンプリコンシーケンスなどの他のターゲットリシーケンス法と比較して、エンリッチメントベースのハイブリッドキャプチャーは、1回の実験で多くの異なるウイルスターゲットのより包括的なプロファイリングを行う、劇的に大きなプローブパネルを可能にします。さらに、ハイブリッドキャプチャーに使用されるオリゴプローブは、高度に変異原性の領域内であっても効果的であり、インフルエンザウイルスやその他のRNAウイルスなどの急速に進化するウイルスをターゲットにすることができます。
合理化されたワークフロー
この包括的なワークフローは、ライブラリー調製、ターゲットエンリッチメント、シーケンス、データ解析を統合します。このワークフローは、RNAとDNAの両方のウイルスがこのエンリッチメントパネルでターゲットにされているため、抽出された全核酸からウイルスターゲットをエンリッチすることを目的としています。
抽出されたRNAの逆転写、ライブラリー調製、および濃縮は、キット内のRespiratory Virus Oligo Panel v2と併せて、定評のある堅牢なIllumina RNA Prep with Enrichment試薬およびプロトコールを使用して行われます。イルミナNGSシステムでシーケンスした後、BaseSpace Sequence HubのDRAGEN Microbial Enrichmentアプリを使用してデータ解析を行うことができます。
- Gaudin M and Desnues C. Hybrid Capture-Based Next Generation Sequencingとそのヒト感染症への応用。前面の微生物。2018; 9:2924。
よく一緒に購入される製品
仕様
製品比較
| Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit | Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit | |
|---|---|---|
| システム互換性 | MiniSeq, MiSeq, NextSeq 550 | MiniSeq, MiSeq, NextSeq 550 |
| 生物種カテゴリー | ウイルス, ヒト | 細菌, ウイルス |
| 自動化に関する互換性 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
Respiratory Virus Oligo Panelによって検出されたウイルス
- ヒトコロナウイルス229E
- ヒトコロナウイルスNL63
- ヒトコロナウイルスOC43
- ヒトコロナウイルスHKU1
- SARS-CoV-2
- ヒトアデノウイルスB1
- ヒトアデノウイルスC2
- ヒトアデノウイルスE4
- ヒトボカウイルス1型（霊長目ボカパルボウイルス1型分離株st2）
- ヒトボカウイルス2c型PK分離株PK-5510
- ヒトボカウイルス3型
- ヒトパラインフルエンザウイルス1型
- ヒトパラインフルエンザウイルス2型
- ヒトパラインフルエンザウイルス3型
- ヒトパラインフルエンザウイルス4a型
- ヒトメタニューモウイルス（CAN97-83）
- 呼吸器合胞体ウイルス（タイプA）
- ヒトRSウイルス9320（タイプB）
- A型インフルエンザウイルス（A/Puerto Rico/8/1934（H1N1））
- A型インフルエンザウイルス（A/Korea/426/1968（H2N2））
- A型インフルエンザウイルス（A/New York/392/2004（H3N2））
- A型インフルエンザウイルス（A/goose/Guangdong/1/1996（H5N1））
- ヒトボカウイルス4型NI株HBoV4-NI-385
- KIポリオーマウイルスストックホルム60
- WUポリオーマウイルス
- ヒトパレコウイルス1型PicoBank/HPeV1/a
- ヒトパレコウイルス6型
- ヒトライノウイルスA89
- ヒトライノウイルスC（024株）
- ライノウイルスB14
- ヒトエンテロウイルスC104株：AK11
- ヒトエンテロウイルスC109分離株NICA08-4327
- A型インフルエンザウイルス（A/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013（H7N9））
- A型インフルエンザウイルス（A/Hong Kong/1073/99（H9N2））
- A型インフルエンザウイルス（A/Texas/50/2012（H3N2））
- A型インフルエンザウイルス（A/Michigan/45/2015（H1N1））
- B型インフルエンザウイルス（B/Lee/1940）
- B型インフルエンザウイルス（B/Wisconsin/01/2010）
- B型インフルエンザウイルス（B/Brisbane/60/2008）
- B型インフルエンザウイルス（B/Colorado/06/2017）
- B型インフルエンザウイルス（B/Washington/02/2019）
- 人間制御遺伝子
Illumina RNA Prep with Enrichmentを用いた高感度SARS-CoV-2検出
ヒト唾液RNAにスパイクされたウイルスの2コピーまでの1,000の滴定実験では、Illumina RNA Prep with Enrichmentにより、SARS-CoV-2の2コピーという低いウイルスリードが検出されました。
Illumina Respiratory Virus Enrichment Kitでの使用が推奨されるシーケンスシステム
| システム | サイクル数 | リード（M） | ランタイム（時間） | ランあたりのサンプル数（サンプルあたり100万リード） |
|---|---|---|---|---|
| NextSeq 550システム（高出力） | 150 | 400 | 18 | 最大400a |
| NextSeq 550システム（中出力） | 150 | 130 | 15 | 130 |
| MiSeqシステム（v3ケミストリー | 150 | 25 | 21 | 25 |
| MiniSeqシステム（高出力） | 150 | 25 | 17 | 25 |
| a. ランあたりのサンプル数が利用可能なインデックス数を超えていることを示します。 | ||||
製品資料
Application Note | PDF < 1 MB
Surveillance of infectious disease through wastewater sequencing
Application Note | PDF < 1 MB
Application Note | PDF < 1 MB
NextSeq 1000/2000試薬
NextSeq 1000/2000試薬キットには、試薬カートリッジ、フローセル、およびTween 20含有懸濁バッファーが含まれます。複数のフローセル構成により、プロジェクトのニーズに合わせた出力が調整可能です。
TruSeq RNA Exome
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織やその他の低品質のサンプルからRNAをシーケンスするための再現性と経済性を兼ね備えたソリューションを提供します。わずか10 ngのトータルRNAから得られる精度
Illumina DNA Prep with Enrichment
カスタムパネル、固定パネル、全エクソーム濃縮のためのターゲットリシーケンスを提供する幅広いアプリケーションに対応した迅速な統合ワークフロー。