Illumina Respiratory Virus Enrichment Kitでは、SARS-CoV-2やインフルエンザA/Bウイルスなど、40を超える重要な呼吸器系ウイルスの全ゲノム次世代シーケンス(NGS)データを取得できます。このキットは、存在するターゲットウイルスの同定、バリアントの同定と追跡、および幅広い種類のサンプルにおけるウイルスサーベイランスを可能にします。1
ハイブリッドキャプチャー法によるターゲットエンリッチメントにより、ショットガンメタゲノムシーケンスに必要な高いリード深度を必要とせずに高感度な検出が可能になります。さらに、この方法では、ウイルスターゲットのほぼ完全な全ゲノムシーケンスデータを取得でき、さまざまな異なるアプリケーションに対応する柔軟なソリューションを提供します。アンプリコンシーケンスなどの他のターゲットリシーケンス法と比較して、エンリッチメントベースのハイブリッドキャプチャーは、1回の実験で多くの異なるウイルスターゲットのより包括的なプロファイリングを行う、劇的に大きなプローブパネルを可能にします。さらに、ハイブリッドキャプチャーに使用されるオリゴプローブは、高度に変異原性の領域内であっても効果的であり、インフルエンザウイルスやその他のRNAウイルスなどの急速に進化するウイルスをターゲットにすることができます。
この包括的なワークフローは、ライブラリー調製、ターゲットエンリッチメント、シーケンス、データ解析を統合します。このワークフローは、RNAとDNAの両方のウイルスがこのエンリッチメントパネルでターゲットにされているため、抽出された全核酸からウイルスターゲットをエンリッチすることを目的としています。
抽出されたRNAの逆転写、ライブラリー調製、および濃縮は、キット内のRespiratory Virus Oligo Panel v2と併せて、定評のある堅牢なIllumina RNA Prep with Enrichment試薬およびプロトコールを使用して行われます。イルミナNGSシステムでシーケンスした後、BaseSpace Sequence HubのDRAGEN Microbial Enrichmentアプリを使用してデータ解析を行うことができます。
Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit | Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit | |
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システム互換性 | MiniSeq, MiSeq, NextSeq 550 | MiniSeq, MiSeq, NextSeq 550 |
生物種カテゴリー | ウイルス, ヒト | 細菌, ウイルス |
自動化に関する互換性 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
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Surveillance of infectious disease through wastewater sequencing
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