製品

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit

SARS-CoV-2株を含む一般的な呼吸器系ウイルスを高感度で検出し、特性評価を提供する合理的なワークフロー。

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit

SARS-CoV-2株を含む一般的な呼吸器系ウイルスを高感度で検出し、特性評価を提供する合理的なワークフロー。

ライブラリー調製時間9時間未満

アッセイ時間

ライブラリー調製時間<2時間

ハンズオンタイム

10～100 ng

インプット量

仕様タブで詳細を確認する

Respiratory Virus Oligos Panel v2 (RVOP v2、カタログ番号：20044311) は、Respiratory Virus Oligos Panel V2、ライブラリー調製および濃縮試薬、インデックスアダプターを含む包括的なキット（セットA～D）で販売されています。スタンドアロンRVOP v2製品または個々のコンポーネントは、 MyIlluminaから購入できます。

概要

以前はRespiratory Virus Oligo Panel（RVOP）と呼ばれたIllumina Respiratory Virus Enrichment Kitは、SARS-CoV-2 やインフルエンザ A/B などの一般的な呼吸器系ウイルスを検出するための効果的で合理化された方法を提供します。

  • ウイルス進化またはウイルスサーベイランスのためのバリアント解析を理解する1

  • ウイルス感染パターンを特定し、ウイルスの再流行を予測する

  • 複雑な疾患における複数感染とその役割の同定と特徴付け

呼吸器系ウイルス検出のためのターゲットエンリッチメント

ハイブリッドキャプチャー法によるターゲットエンリッチメントにより、ショットガンメタゲノミクスシーケンスに必要となるような高いリード深度がなくとも、高感度な検出が可能です。さらに、この方法では、アンプリコンシーケンスと比較して、包括的なプロファイリングのための劇的に大型化したプローブパネルが可能になり、ターゲットウイルスの全ゲノムシーケンスデータを生成できます。

ウイルスアプリケーション向けの合理化されたソリューション

この包括的なワークフローは、ライブラリー調製・ターゲットエンリッチメント・シーケンス・データ解析を統合しており、研究者や公衆衛生サイエンティストは、1つのワークフローで複数のウイルスやバリアントをモニタリングする能力を提供します。

仕様

アッセイ時間 ライブラリー調製時間9時間未満
自動化機能 自動液体分注システム
自動化の詳細 利用可能な自動化方法を見る
コンテンツ仕様 SARS-CoV-2、インフルエンザA型およびB型ウイルス、アデノウイルス、ライノウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、およびその他の一般的な呼吸器系ウイルスを含む、約40の一般的な呼吸器系ウイルスをターゲットとし、特性を明らかにします。
説明 SARS-CoV-2およびその他の一般的な呼吸器系ウイルスを検出および解析するための合理化されたワークフロー。アグノスティックなデザインにより、関心のある複数のサンプルタイプにわたる病原性ウイルスの広範な同定が可能です。
ハンズオンタイム ライブラリー調製時間<2時間
インプット量 10～100 ng
システム MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, MiniSeq System, MiSeq i100 Plusシステム, MiSeq i100システム
作用機序 オンビーズタグメンテーションとそれに続くシングルハイブリダイゼーションステップ
手法 ターゲットDNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮
マルチプレックス ユニークデュアルインデックスで1回のランで最大384サンプル
核酸の種類 DNA, RNA
サンプルタイプの詳細 鼻腔用綿棒、洗浄液、廃水など
生物種カテゴリー ヒト, ウイルス
生物種詳細 最近のインフルエンザウイルス株やSARS-CoV-2を含む一般的な呼吸器系ウイルスを検出します。このパネルには、品質機能としてヒトターゲットへのプローブが含まれているため、アッセイに使用したすべてのサンプルでヒトターゲットを検出できます。
テクノロジー シーケンス
バリアントクラス 1塩基変異多型（SNP）, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）

必要な製品

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kitsには、Respiratory Virus Oligo Panel（RVOP）v2、Illumina RNA Prep with Enrichment、および4種類のユニークデュアルインデックスプレートのいずれかが含まれています。384サンプルを一度にランするには、4セット（A、B、C、D）すべてをご注文ください。追加で必要なイルミナ試薬には、イルミナシーケンサー、適切なクラスター形成試薬およびシーケンス試薬が含まれます。
/ 件

アプリケーション

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit、イルミナシーケンス、およびDRAGEN二次解析は、40種類以上の一般的なヒト呼吸器系ウイルスの検出と特性評価を可能にする合理化されたワークフローを提供します。

ワークフローの例

1
ライブラリー調製

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit

2
シーケンス
3
解析

プロジェクトの推奨事項

装置 推奨サンプル数 リード長
MiniSeqシステム ラピッド：20サンプル、1Mクラスター、サンプルあたり最低1Mのシングルエンドリード 1 × 100 bp
MiSeqシステム v3試薬：～20サンプル、1Mクラスター、サンプルあたり最低1Mのシングルエンドリード 1 x 150 bp
NextSeq 550システム 高出力：384サンプル、1Mクラスター、サンプルあたり最低1Mのシングルエンドリード 1 × 150 bp

関連するアプリケーションと手法

ターゲット濃縮

ターゲットエンリッチメントは、ハイブリダイゼーションを使用して目的のゲノム領域を捕捉します。ターゲットエンリッチメントについて、また、複数サンプルを一度に評価するためにどのように使用できるかについて学ぶ。

コロナウイルスのシーケンス

NGSは、新型コロナウイルスのバリアントの同定、COVID-19伝播トラッキングなどを可能にします。コロナウイルスシーケンスの様々な目的に応じたNGS法を比較してください。

感染症研究

仮説の不要なメソッドとして、NGSは、わずか1つのSNPだけ異なる感染症株を区別し、複数の検査を置き換えることができます。

ドキュメント

製品資料
サポートドキュメント

比較する

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
アッセイ時間 ライブラリー調製時間9時間未満 ライブラリー調製時間<9時間
自動化機能 自動液体分注システム 自動液体分注システム
自動化の詳細 利用可能な自動化方法を見る 利用可能な自動化方法を見る
コンテンツ仕様 SARS-CoV-2、インフルエンザA型およびB型ウイルス、アデノウイルス、ライノウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、およびその他の一般的な呼吸器系ウイルスを含む、約40の一般的な呼吸器系ウイルスをターゲットとし、特性を明らかにします。 呼吸器病原体のDNAとRNAを同時に検出し、抗菌薬耐性（AMR）遺伝子発現を同時にプロファイリングします。
説明 SARS-CoV-2およびその他の一般的な呼吸器系ウイルスを検出および解析するための合理化されたワークフロー。アグノスティックなデザインにより、関心のある複数のサンプルタイプにわたる病原性ウイルスの広範な同定が可能です。 呼吸器感染症と複数感染を同定し、抗菌薬耐性マーカーを検出し、重要な病原体（SARS-CoV-2およびインフルエンザA/Bウイルス）の系統タイピングを実行して、ウイルスの進化と伝播を研究します。
ハンズオンタイム ライブラリー調製時間<2時間 ライブラリー調製時間<2時間
インプット量 10～100 ng 容量に基づく（濃度に依存しない）
システム MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, MiniSeq System, MiSeq i100 Plusシステム, MiSeq i100システム MiSeqシステム, NextSeq 550システム, MiniSeq System, MiSeq i100 Plusシステム, MiSeq i100システム
作用機序 オンビーズタグメンテーションとそれに続くシングルハイブリダイゼーションステップ オンビーズタグメンテーションとそれに続くシングルハイブリダイゼーションステップ
手法 ターゲットDNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 ターゲットDNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮
マルチプレックス ユニークデュアルインデックスで1回のランで最大384サンプル ユニークデュアルインデックスで1回のランで最大384サンプル
核酸の種類 DNA, RNA DNA, RNA
サンプルタイプの詳細 鼻腔用綿棒、洗浄液、廃水など
生物種カテゴリー ヒト, ウイルス 真菌, ウイルス, 細菌
生物種詳細 最近のインフルエンザウイルス株やSARS-CoV-2を含む一般的な呼吸器系ウイルスを検出します。このパネルには、品質機能としてヒトターゲットへのプローブが含まれているため、アッセイに使用したすべてのサンプルでヒトターゲットを検出できます。 呼吸器病原体（180以上の細菌、50以上の真菌、SARS-CoV-2を含む40以上のウイルス）および抗菌薬耐性アリル（1200以上）を検出します。
テクノロジー シーケンス シーケンス
バリアントクラス 1塩基変異多型（SNP）, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）

選択ツール

ライブラリー調製とアレイキットセレクター

ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。

遺伝子パネルとアレイファインダー

目的の遺伝子（複数可）をターゲットとするシーケンスパネルまたはマイクロアレイを特定します。

図

呼吸器系ウイルス検出のためのエンリッチメントワークフロー

呼吸器系ウイルス検出のための合理化されたNGSワークフローは、サンプル調製、ライブラリー調製、ターゲット濃縮、シーケンス、およびデータ解析を統合します。

高感度SARS-CoV-2検出

ヒト唾液RNAに規定量のウイルスコピーを添加した滴定実験では、Illumina Respiratory Virus Enrichment Kitにより、SARS-CoV-2ウイルスRNAの2コピー程度のウイルスリードを検出できました。

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kitで検出されたウイルス

Respiratory Virus Oligo Panelには、一般的な呼吸器系ウイルス、最近のインフルエンザ株、SARS-CoV-2を決定する7,800種類のプローブと、陽性対照として機能するヒトプローブが含まれています。すべてのプローブは80merのオリゴが、非常に接近して配置されたもので、パネル内のすべてのウイルスの完全なゲノムカバレッジを提供します。

ヒトコロナウイルス229E ヒトパラインフルエンザウイルス1型 ヒトボカウイルス4型NI株HBoV4-NI-385 A型インフルエンザウイルス（A/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013（H7N9））
ヒトコロナウイルスNL63 ヒトパラインフルエンザウイルス2型 KIポリオーマウイルスストックホルム60 A型インフルエンザウイルス（A/Hong Kong/1073/99（H9N2））
ヒトコロナウイルスOC43 ヒトパラインフルエンザウイルス3型 WUポリオーマウイルス A型インフルエンザウイルス（A/Texas/50/2012（H3N2））
ヒトコロナウイルスHKU1 ヒトパラインフルエンザウイルス4a型 ヒトパレコウイルス1型PicoBank/HPeV1/a A型インフルエンザウイルス（A/Michigan/45/2015（H1N1））
SARS-CoV-2 ヒトメタニューモウイルス（CAN97-83） ヒトパレコウイルス6型 B型インフルエンザウイルス（B/Lee/1940）
ヒトアデノウイルスB1 呼吸器合胞体ウイルス（タイプA） ヒトライノウイルスA89 B型インフルエンザウイルス（B/Wisconsin/01/2010）
ヒトアデノウイルスC2 ヒトRSウイルス9320（タイプB） ヒトライノウイルスC（024株） B型インフルエンザウイルス（B/Brisbane/60/2008）
ヒトアデノウイルスE4 A型インフルエンザウイルス（A/Puerto Rico/8/1934（H1N1）） ライノウイルスB14 B型インフルエンザウイルス（B/Colorado/06/2017）
ヒトボカウイルス1型（霊長目ボカパルボウイルス1型分離株st2） A型インフルエンザウイルス（A/Korea/426/1968（H2N2）） ヒトエンテロウイルスC104株：AK11 B型インフルエンザウイルス（B/Washington/02/2019）
ヒトボカウイルス2c型PK分離株PK-5510 A型インフルエンザウイルス（A/New York/392/2004（H3N2）） ヒトエンテロウイルスC109分離株NICA08-4327 人間制御遺伝子
ヒトボカウイルス3型 A型インフルエンザウイルス（A/goose/Guangdong/1/1996（H5N1））    

Illlumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set A (96 indexes, 96 samples)

20100469

イルミナRNA Prep with Enrichmentライブラリー調製およびハイブリダイゼーション試薬、Respiratory Virus Oligo Panel v2、IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set Aを含む、ハイブリダイゼーションベースのエンリッチメントキット一式。各キットには、ハイブリダイゼーション反応1回につき3ライブラリーの32ハイブリダイゼーション反応で96サンプルに十分な試薬が入っています。SARS-CoV-2やインフルエンザを含む40の一般的なヒト呼吸器系ウイルスの濃縮を可能にし、各ターゲットウイルスの全ゲノムシーケンスを生成します。

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Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set B (96 indexes, 96 samples)

20100470

Illumina RNA Prep with Enrichmentライブラリー調製およびハイブリダイゼーション試薬、Respiratory Virus Oligo Panel v2、IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set Bを含む、ハイブリダイゼーションベースのエンリッチメントキット一式。各キットは、ハイブリダイゼーション反応ごとに3つのライブラリーを含む32のハイブリダイゼーション反応で96サンプルに十分な試薬を提供します。SARS-CoV-2やインフルエンザを含む40の一般的なヒト呼吸器系ウイルスの濃縮を可能にし、各ターゲットウイルスの全ゲノムシーケンスを生成します。

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Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set C (96 indexes, 96 samples)

20100471

イルミナRNA Prep with Enrichmentライブラリー調製およびハイブリダイゼーション試薬、Respiratory Virus Oligo Panel v2、IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set Cを含むハイブリダイゼーションベースのエンリッチメントキット一式。各キットは、ハイブリダイゼーション反応ごとに3つのライブラリーを含む32のハイブリダイゼーション反応で96サンプルに十分な試薬を提供します。SARS-CoV-2やインフルエンザを含む40の一般的なヒト呼吸器系ウイルスの濃縮を可能にし、各ターゲットウイルスの全ゲノムシーケンスを生成します。

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Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set D (96 indexes, 96 samples)

20100472

イルミナRNA Prep with Enrichmentライブラリー調製およびハイブリダイゼーション試薬、Respiratory Virus Oligo Panel v2、IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set Dを含むハイブリダイゼーションベースのエンリッチメントキット一式。各キットは、ハイブリダイゼーション反応ごとに3つのライブラリーを含む32のハイブリダイゼーション反応で96サンプルに十分な試薬を提供します。SARS-CoV-2やインフルエンザを含む40の一般的なヒト呼吸器系ウイルスの濃縮を可能にし、各ターゲットウイルスの全ゲノムシーケンスを生成します。

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よくある質問（FAQ）

Respiratory Virus Enrichment Kitは、ホルマリン固定・鼻腔スワブ・鼻腔洗浄・廃水サンプルなど、幅広いサンプルソースに対応しています。

Respiratory Virus Enrichment Kitのライブラリー調製と濃縮プロトコールにかかる時間は、ハンズオンタイムが2時間未満で、合計9時間未満です。

MiniSeq Rapid Reagent Kit、MiniSeq Sequencing System、DRAGEN RNA Pathogen Detectionアプリと併用すれば、全プロセスを24時間以内に完了できます。fast detection of respiratory viruses（呼吸器系ウイルスの迅速な検出）の詳細はこちら。

はい。このキットはハイブリダイゼーションベースのエンリッチメントを使用し、40種類以上の異なるウイルスのプローブが含まれているため、複数のウイルスを検出できます。Illumina RNA Prep with Enrichmentによる呼吸器系ウイルスの検出と特性評価の詳細はこちら。

イルミナのRespiratory Virus Enrichment Kitには、 DRAGEN RNA Pathogen Detectionアプリ とDRAGEN Microbial Enrichment Plusの無料使用が含まれており、どちらも病原体データを解析し、コンセンサスシーケンスを生成します。

/ 件

NovaSeq Xシリーズのご購入

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。

Viral Surveillance Panel

SARS-CoV-2、インフルエンザ、アルボウイルス、肝炎を含む200種類を超えるウイルスおよび亜型の全ゲノムシーケンスと特性評価。

MiniSeq試薬キット

MiniSeqシステム試薬キットは、2チャンネルのSBSケミストリーを備えたすぐに使えるカートリッジで、サンプル数が少ない場合でもコスト効率の高いシーケンスが可能です。

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