TruSeq DNA Nano

全ゲノムシーケンス用ライブラリーを調整し、限られた量のDNAサンプルでも効率的な解析を実現します。

約6時間

アッセイ時間

~4時間

ハンズオンタイム

100 ng ゲノムDNA

インプット量

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Illumina DNA Prep と Illumina DNA PCR-Free Prep をご利用いただけます。これらのライブラリー調製ソリューションは、TruSeq DNA Nanoと比較して、ターンアラウンドタイムとハンズオンタイムを短縮する一方、より優れた性能を実現しました。

概要

TruSeq DNA Nanoでは、利用可能なDNAが限られたサンプルを効率的に解析できます。 機械的断片化とライゲーションケミストリーに基づくローインプット手法により、高品質なカバレッジと低バイアスを実現し、幅広いアプリケーションに対応します。

主な特長

  • ローサンプルインプット用の設計

  • 高品質なカバレッジ

  • ライブラリー調製の促進

高品質ライブラリーを一日以内にマニュアル調製

TruSeq DNA Nanoは、従来のゲルベースのサイズ選択をビーズベースのサイズ選択に置き換えることでワークフローを効率化し、1日以内での高品質なライブラリー調製を実現しました。さらに、2×101 bpから2×151 bpまでの幅広いリード長に対応するよう最適化されています。

限られたDNAサンプルとの併用

TruSeq DNA Nanoは、従来必要とされていた数マイクログラムのDNAを必要せず、わずか100 ngのインプットから高品質な結果が取得できます。これにより、腫瘍サンプルなどDNA量が限られたサンプルに対応できるだけでなく、貴重なサンプルを将来の研究のために温存できるようになりました。さらに、ビーズベースのサイズ選択によりワークフローを迅速化し、ゲルベースのサイズ選択で生じやすいサンプルロスを低減しています。

ライブラリーバイアスとカバレッジギャップの低減

TruSeq DNA Nanoは、PCR由来のカバレッジギャップの数と平均サイズを低減します。さらに、最適化されたワークフローにより、ライブラリーバイアスを低減し、ゲノム全体で優れたカバレッジ均一性を実現します。さらに、GCリッチ領域やプロモーター、反復領域など、従来は解析が困難だったゲノム領域も幅広くカバーしているため、各シーケンスランから得られる情報量が向上します。Truseq DNA Nanoは、多様な次世代シーケンサー(NGS)アプリケーションで高品質のゲノムカバレッジを提供することが実証されています。

柔軟なスループットオプションへのアクセス

  • シングルインデックスを含んだTruSeq DNA Nanoは、ロースループット(LT)研究向けの24サンプルのマニュアル処理をサポートします。
  • 96件のCDインデックスを備えたTruSeq DNA Nanoは、ハイスループット(HT)研究向けの96サンプルの処理をサポートしており、自動分注機で自動化できます(マニュアル処理も可能です)。
  • IDT for Illumina Unique Dual (UD) Indexes (24または96)により、リードの正確な割り当てとフローセルの効率的な使用が実現します。

自動化に適した迅速なワークフロー

イルミナシーケンサー用ライブラリーを1日で調製できます。Illumina Qualified Methodは、 イルミナ認定パートナーの各種自動化プラットフォームで利用できます。

仕様

必要な製品

イルミナは、ワークフローに応じて柔軟に選択できる、モジュール型オーダー方式を採用しています。以下のインデックスを含むライブラリー調製製品をご注文いただけます。

Illumina Advantageの大規模シーケンス製品は、最高水準のサービスとサポートを通じて、オペレーションを成功に導きます。ロットごとの出荷検査、長期の有効期限、製品変更に関する事前通知により、研究室の効率的な運用を実現します。 

Illumina Free Adapter Blocking Reagentは、ライブラリープールで結合していないフリーのアダプターをブロックし、インデックスホッピングのリスクを最小限に抑えるよう設計された酵素処理ソリューションです。

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アプリケーション

ワークフローの例

プロジェクトの推奨事項

装置 推奨サンプル数 リード長
NextSeq 550 System

1ランあたり1サンプル(ヒトゲノムの30×カバレッジに基づく)

350 bpインサート:≤ 2 × 100 bp
550 bpインサート:≤ 2 × 150 bp

関連するアプリケーションおよび手法

本製品の用途例

製品比較

TruSeq DNA Nano TruSeq DNA PCR-Free Illumina DNA Prep
アッセイ時間 合計アッセイ時間約6時間 アッセイの合計所要時間は5時間 約3~4時間(DNA抽出からライブラリーのノーマライズまで)
自動化機能 Liquid handling robot(s) Liquid handling robot(s) Liquid handling robot(s)
自動化の詳細 利用可能な自動化方法を見る 利用可能な自動化方法を見る 利用可能な自動化方法を見る
説明 高いゲノムカバレッジ品質とバイアスの低減を実現するローインプット研究法。 ゲノムの困難な領域を配列解析できる、全ゲノムシーケンスのためのシンプルで包括的なPCR-Free Prep。 さまざまなサンプルタイプとDNAインプット量に対応する迅速で柔軟なライブラリー調製ワークフローにより、ヒトから微生物の全ゲノムシーケンスまで、幅広いアプリケーションにアクセスできます。 
ハンズオンタイム ~4時間 4時間 1〜1.5時間
インプット量 100 ng ゲノムDNA DNA 1 ug 小さなゲノム(微生物など)の場合はDNA 1~500 ng、大きなゲノム(ヒトなど)の場合はDNA 100~500 ng。(血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください)。
システム MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System, MiSeq i100 Plusシステム, MiSeq i100システム
作用機序 メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローでは、低バイアスPCRを使用し、ゲルフリーです。 メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローはPCRフリー、ゲルフリー。 ビーズ結合トランスポソーム
手法 シーケンスによるジェノタイピング, 全ゲノムシーケンス, ショットガンシーケンス シーケンスによるジェノタイピング, 全ゲノムシーケンス, ショットガンシーケンス アンプリコンシーケンス, 全ゲノムシーケンス, de novoシーケンス, ショットガンシーケンス
マルチプレックス 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル(CD)、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル(UD)の組み合わせ 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル(CD)、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル(UD)の組み合わせ 最大384のユニークデュアル(UD)の組み合わせと96のコンビナトリアルデュアル(CD)の組み合わせ
核酸の種類 DNA DNA DNA
対応サンプルタイプ FFPE非対応, 少量インプットサンプル FFPE非対応 血液, FFPE非対応, 唾液
生物種カテゴリー その他, 哺乳類, マウス, ヒト, ラット, 植物 その他, 哺乳類, マウス, ヒト, ラット, 植物 ショウジョウバエ, Any species, 哺乳類, マウス, 酵母, ゼブラフィッシュ, ヒト, ラット, 植物, ウイルス, 線形動物, 細菌
生物種詳細 ほとんどの大きなDNAゲノムに対応。 ほとんどの大きなDNAゲノムに対応。 任意の種に対応
ターゲットインサートサイズ 350 bpまたは550 bp 350 bpまたは550 bp ~350 bp
テクノロジー シーケンス シーケンス シーケンス
バリアントクラス 1塩基変異多型(SNP), 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失(LOH), 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV) 1塩基変異多型(SNP), 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失(LOH), 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV) 1塩基変異多型(SNP), 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失(LOH), 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV)

選択ツール:

ライブラリー調製 (1)

TruSeq Nano DNA Low Throughput Library Prep Kit (24 samples)

20015964

24ライブラリー調製用の試薬とSample Purification Beadsが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。

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Discounts:

TruSeq Nano DNA High Throughput Library Prep Kit (96 samples)

20015965

24ライブラリー調製用の試薬とSample Purification Beadsが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。

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インデックスアダプター (1)

IDT for Illumina – TruSeq DNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040870

96サンプルの標識に十分な96、8 bpのインデックスを含み、TruSeq NanoおよびTruSeq PCR-Free Library Prep Kitと互換性があります。バージョン2では、プレート20022370内の192のインデックスオリゴのうち8つが改善され、残りの184には変更されていません。ライブラリー調製およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina Advantage 製品 (3)

TG TruSeq® Nano DNA LT Sample Prep Kit, Set A (24 Samples)

TG-202-1001

シングルリード、ペアエンドおよびマルチプレックスシーケンスのために、合計24のDNAサンプル調製に用いられる試薬キット。このキットには12ユニークシングルインデックスが含まれます(インデックス2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19)

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Discounts:

TG TruSeq® Nano DNA LT Sample Prep Kit, Set B (24 Samples)

TG-202-1002

シングルリード、ペアエンドおよびマルチプレックスシーケンス向けの、合計24のDNAサンプル調製に用いられる試薬キット。このキットには12ユニークシングルインデックスが含まれています。(インデックス1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27)

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TG Truseq® Nano DNA Accessory Kit

TG-280-1001

TruSeq Nano DNA LT Kit AおよびBとcfDNAワークフローと一緒に使用するアクセサリーキット。アクセサリーキット1つで、cfDNAワークフローを介して16サンプルバッチを4回追加するのに十分なEPM試薬を提供します。

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製品名

数量

単価

NovaSeq Xシリーズのご購入

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。

TruSight Oncology 500 v2

FFPE組織から、すべての主要バリアントクラスに加え、重要なバイオマーカー(TMB、MSI、HRD)を網羅する大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現します。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションに対応するライブラリー調製を実現する、高速で統合されたワークフローです。

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