TruSeq DNA Nano

全ゲノムシーケンスのライブラリーを生成し、少量のDNAしか得られないサンプルを効率的に調べます。

合計アッセイ時間約6時間

アッセイ時間

約4時間

ハンズオンタイム

100 ng ゲノムDNA

インプット量

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Illumina DNA Prep および Illumina DNA PCR-Free Prep が利用可能です。これらのライブラリー調製ソリューションは、TruSeq DNA Nanoと比較して、ターンアラウンドタイムとハンズオンタイムを低減しつつ、より高い性能を提供します。

概要

TruSeq DNA Nanoでは、利用できるDNAが限られた状態のサンプルで効率的に精査ができます。 機械的な断片化ライゲーション化学にもとづいた、このローインプット手法は、高品質なカバレッジと、バイアスの低下により、実質的にあらゆる用途に適用できます。

主な特長

  • ローサンプルインプットのための設計

  • 高品質なカバレッジ

  • ライブラリー調製の促進

高品質ライブラリーを一日以内で手動調製

TruSeq DNA Nanoは、ゲルベースのサイズ選択をビーズベースのサイズ選択に置き換えることで合理化され、研究者は一日以内で高品質のライブラリーを調製することができるようになりました。この製品は2×101 bpから2×151 bpまでの様々なリード長に対応できるよう最適化されています。

限られたDNAサンプルとの併用

TruSeq DNA Nanoはわずか100 ngのインプットですばらしい結果をもたらし、一般的な要件(数マイクログラムのDNA)を不要にします。これにより、研究者は利用可能なDNAが限られたサンプル(例:腫瘍サンプル)を研究できるようになり、将来または別の研究で使用できるようにサンプルを保存することができます。ビーズベースのサイズ選択は、ワークフローの迅速化に加え、ゲルベースのサイズ選択で起こりがちなサンプルロスを防ぐことができます。

ライブラリーバイアスとカバレッジのギャップを減らす

TruSeq DNA Nanoは、PCRでよく見られるカバレッジギャップの数と平均的サイズを低減します。ワークフローが強化されることでライブラリーバイアスが減り、ゲノム全体でカバレッジ均一性が向上します。またこれらのキットは、従来は操作が困難とされたゲノムの領域(GCリッチ領域、プロモーター、反復領域など)を幅広く対象とします。これにより研究者は各シーケンスランからより多くの情報にアクセスできるようになります。Truseq DNA Nano製品は、ほぼ全ての次世代シーケンサー(NGS)アプリケーションにおいて、高品質のゲノムカバレッジを実現することが検証されています。

柔軟なスループットオプションへのアクセス

  • シングルインデックスを含んだTruSeq DNA Nanoは、ロースループット(LT)研究を実現するため24のサンプルの手動処理をサポートします。
  • 96件のCDインデックスを備えたTruSeq DNA Nanoはハイスループット(HT)研究実現のために96サンプルの処理をサポートしており、自動液体分注システムで自動化できます(手動処理も可能です)。
  • IDT for Illumina Unique Dual (UD) Indexes (24または96)により、リードを正確に割り当て、フローセルを効率的に使用することができるようになります。

高速で自動化に適したワークフロー

イルミナシーケンス用のライブラリーを1日で調製します。イルミナの認定メソッドは、 当社のパートナーを通じて、さまざまな自動化プラットフォームで利用できます。


仕様


必要な製品

イルミナは、お客様のワークフローを柔軟にするモジュラー式の注文製品方式を採用しています。以下のインデックス付きのライブラリー調製製品をご注文いただけます。 

イルミナのアドバンテージ の大規模シーケンス製品は、最高レベルのサービスとサポートを提供し、オペレーションの成功を確実にします。ロット固有の出荷と検査、保管期間の延長、高度な変更通知により、ラボの効率が向上します。 

イルミナのFree Adapter Blocking Reagentは、オプションの酵素ソリューションで、フリーアダプターをライブラリープールからブロックして インデックスホッピングのリスクを最小限に抑えるように設計されています。

/ 結果

アプリケーション

ワークフローの例


プロジェクトの推奨事項

装置 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

1 sample per run (based on 30× coverage of a human genome)

350 bpインサート:≤ 2 × 100 bp
550 bpインサート:≤ 2 × 150 bp


関連するアプリケーションとメソッド

本製品の用途例

比較する

TruSeq DNA Nano TruSeq DNA PCR-Free Illumina DNA Prep
アッセイ時間

合計アッセイ時間約6時間

合計アッセイ時間5時間 約3~4時間(DNA抽出からライブラリーのノーマライズまで)
Automation capability Liquid handling robots Liquid handling robots Liquid handling robots
自動化の詳細 利用可能な自動化方法を見る 利用可能な自動化方法を見る 利用可能な自動化方法を見る
説明 高いゲノムカバレッジ品質とバイアスの低減を実現するローインプット研究法。 ゲノムの困難な領域を配列解析できる、全ゲノムシーケンスのためのシンプルで包括的なPCR-Free Prep。

さまざまなサンプルタイプとDNAインプット量に対応する迅速で柔軟なライブラリー調製ワークフローにより、ヒトから微生物の全ゲノムシーケンスまで、幅広いアプリケーションにアクセスできます。 

ハンズオンタイム 約4時間 4時間 1〜1.5時間
インプット量 100 ng ゲノムDNA DNA 1 ug 小さなゲノム(微生物など)の場合はDNA 1~500 ng、大きなゲノム(ヒトなど)の場合はDNA 100~500 ng。(血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください)。
システム MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
作用機序 メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローでは、低バイアスPCRを使用し、ゲルフリーです。 メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローはPCRフリー、ゲルフリー。 ビーズ結合トランスポソーム
手法 Genotyping by sequencing, Whole-genome sequencing, Shotgun sequencing Genotyping by sequencing, Whole-genome sequencing, Shotgun sequencing Amplicon sequencing, Whole-genome sequencing, De novo sequencing, Shotgun sequencing
マルチプレックス 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル(CD)、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル(UD)の組み合わせ 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル(CD)、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル(UD)の組み合わせ 最大384のユニークデュアル(UD)の組み合わせと96のコンビナトリアルデュアル(CD)の組み合わせ
Nucleic acid type DNA DNA DNA
サンプルタイプ Not FFPE-Compatible, Low-Input Samples Not FFPE-Compatible Blood, Not FFPE-Compatible, Saliva
Species category Other, Mammalian, マウス, ヒト, ラット, Plant Other, Mammalian, マウス, ヒト, ラット, Plant Drosophila, すべて, Mammalian, マウス, Yeast, Zebrafish, ヒト, ラット, Plant, Virus, Nematode, Bacteria
生物種詳細 ほとんどの大きなDNAゲノムに対応。 ほとんどの大きなDNAゲノムに対応。 任意の種に対応
ターゲットインサートサイズ 350 bpまたは550 bp 350 bpまたは550 bp 約350 bp
テクノロジー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー
バリアントクラス Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)

選択ツール:

ライブラリー調製 (1)

TruSeq Nano DNA Low Throughput Library Prep Kit (24 samples)

20015964

24ライブラリー調製用の試薬とサンプル精製ビーズが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。

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Discounts:

TruSeq Nano DNA High Throughput Library Prep Kit (96 samples)

20015965

24ライブラリー調製用の試薬とサンプル精製ビーズが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。

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インデックスアダプター (1)

IDT for Illumina – TruSeq DNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040870

96サンプルのラベリングに十分な96個の8 bpのインデックスを含み、TruSeq NanoおよびTruSeq PCR-Free Library Prep Kitと互換性があります。バージョン2には、プレート20022370内の192のインデックスオリゴのうち8つの改善が含まれており、残りの184は変更されていません。ライブラリー調製およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina Advantage 製品 (3)

TG TruSeq® Nano DNA LT Sample Prep Kit, Set A (24 Samples)

TG-202-1001

シングルリード、ペアエンドおよびマルチプレックスシーケンス向けの、合計24のDNAサンプル調製に用いられる試薬キット。このキットには12のユニークシングルインデックスが含まれます(インデックス2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19)

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TG TruSeq® Nano DNA LT Sample Prep Kit, Set B (24 Samples)

TG-202-1002

シングルリード、ペアエンドおよびマルチプレックスシーケンス向けの、合計24のDNAサンプル調製に用いられる試薬キット。このキットには12のユニークシングルインデックスが含まれています。(インデックス1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27)

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TG Truseq® Nano DNA Accessory Kit

TG-280-1001

TruSeq Nano DNA LT Kit AおよびBとcfDNAワークフローと一緒に使用する付属キット。1つの付属キットで、cfDNAワークフローを介して4つの追加の16サンプルバッチ用として十分な追加のEPM試薬を提供します。

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選択中の製品一覧

製品名

数量

Unit Price

NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

製品情報のリクエスト

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