より柔軟にライブラリー調製用の単一コンポーネントを注文していただけるよう、イルミナはモジュール構成品に移行してします。これまでのTruSeq Nano DNA Library Prep Kit（カタログ番号FC-121-4001、FC-121-4002、FC-121-4003）はTruSeq DNA Nano（カタログ番号20015964（24サンプル）、カタログ番号20015965（サンプル数96））に移行します。インデックスアダプターはTruSeq DNA Single Indexes（カタログ番号20015960（Set A）、カタログ番号20015961（Set B））およびTruSeq DNA CD（デュアルの組み合わせ）Indexes（カタログ番号20015949）として別売されます。
TruSeq DNA Nanoは利用量の限られたDNAサンプルでも効率良く実験を行えます。機械的断片化–ライゲーションケミストリーに基づいた、この低インプット量サンプル用の方法により、高品質カバレッジが達成され、ほぼすべてのシーケンスアプリケーションでバイアスが低下します。
ゲルによるサイズ選択をビーズによる選択に変更することで、TruSeq DNA Nanoの効率が高まり、高品質ライブラリーを1日で調製することが可能になりました。2 × 101 bp～2 × 151 bpというさまざまなリード長で最適化されています。
TruSeq DNA Nanoでは、わずか100 ngのDNAから優れた結果が得られるため、一般的に必要とされるマイクログラムレベルのDNAが不要になりました。この結果、DNA量の限られたサンプル（腫瘍サンプルなど）の解析が可能になり、将来の研究や別の研究で使用するためのサンプルを保存することが可能になりました。ワークフローの加速化に加え、ビーズによるサイズ選択ではゲルを用いた選択の際に一般的にみられるサンプルの損失が回避されます。
TruSeq DNA Nanoでは、カバレッジ内で一般的なPCRによるギャップの数と平均サイズが低減します。ワークフローが強化されたことにより、ゲノム全体でライブラリーバイアスが低減し、カバレッジ均一性が向上しています。さらにこれらのキットでは、これまでは解析が困難であったGCリッチ領域、プロモーター領域、およびリピート領域などのゲノムコンテンツにおいても優れたカバレッジを実現しています。その結果、各シーケンスランからより多くの情報が得られるようになります。Truseq DNA Nano製品は、ほぼあらゆる次世代シーケンサーアプリケーションで高品質ゲノムカバレッジを達成できることが検証されています。
96サンプルワークフローをサポートするロボットシステムを備えた自動化ベンダーの最新リストをご覧ください。
*96 UD Indexes はまもなく利用可能となります。
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | 1 sample per run (based on 30× coverage of a human genome) | 350 bp insert: ≤ 2 × 100 bp 550 bp insert: ≤ 2 × 150 bp |
| HiSeq 2500 System | 2–10 samples per run (dual flow cell; based on 30× coverage of a human genome) | Rapid run, 350 bp insert: ≤ 2 × 100 bp Rapid run, 550 bp insert: ≤ 2 × 250 bp High output, 350 bp insert: ≤ 2 × 100 bp High output, 550 bp insert: ≤ 2 × 125 bp |
| Specification | TruSeq DNA Nano | TruSeq DNA PCR-Free |
|---|---|---|
| Kit type | TruSeq DNA Nano LT & HT | TruSeq DNA PCR-Free LT & HT |
| Description | Based upon widely adopted TruSeq library prep, with lower input and improved data quality | Superior genomic coverage with radically reduced library bias and gaps |
| Workflow | LT kits: Manual workflow
HT kits: Automation-friendly; manual protocols also available |
LT kits: Manual workflow
HT kits: Automation-friendly; manual protocols also available |
| Input quantity | 100–200 ng
|
1–2 μg |
| Includes PCR | Yes | No |
| Assay time | 5.5 hours | ~5 hours |
| Hands-on time | 4 hours | ~4 hours |
| Target insert size | 350 bp or 550 bp | 350 bp or 550 bp |
| Gel-free | Yes | Yes |
| Number of samples supported | 24 (LT) or 96 (HT) samples | 24 (LT) or 96 (HT) samples |
| Size-selection beads | Included | Included |
| Applications | Whole-genome sequencing applications, including whole-genome resequencing, de novo assembly, and metagenomics studies | |
| Sample multiplexing | Up to 24 single, 96 combinatorial (CD) dual, 24 unique dual and 96 unique dual (UD) combinations | |
| Compatible Illumina sequencers | MiniSeq, MiSeq, NextSeq, HiSeq, NovaSeq, HiSeq X, HiScanSQ, and Genome Analyzer systems | |
Comparison of TruSeq Sample Preparation Kits
Technical Note | PDF< 1 MB
Mechanical DNA Fragmentation with the Q800R2 Sonicator
Technical Note | PDF4 MB
Data Sheet | PDF11 MB
TruSeq HT Dual Index Quick Reference Card Documentation
TruSeq Nano DNA Library Prep User-Supplied Consumables and Equipment Documentation
TruSeq DNA Nano Reference Guide Documentation
TruSeq DNA Nano Checklist Documentation
TruSeq Nano DNA Library Prep Checklist Documentation
Illumina Experiment Manager User Guide Documentation
TruSeq Nano DNA Library Prep Reference Guide Documentation
TruSeq DNA Nano Consumables & Equipment Documentation
カスタムプロトコルセレクタ
Generates customized, end-to-end instructions
Simple, all-inclusive whole-genome sequencing (WGS) library preparation that provides accurate and comprehensive coverage of complex genomes.
少量のDNAインプットで、小さなゲノム、PCRアンプリコン、およびプラスミドのシーケンスライブラリーを90分以内で調製できます。
A fast, integrated workflow for a wide range of applications, from human whole-genome sequencing to amplicons, plasmids, and microbial species.
