Illumina DNA PrepとIllumina DNA PCR-Free Prepが入手可能です。これらのライブラリー調製ソリューションは、TruSeq DNA Nanoと比較して、ターンアラウンドタイムとハンズオンタイムを低減しつつ、より高い性能を提供します。
TruSeq DNA Nanoを使うことで、少量のDNAしか得られないサンプルを効率的に調べます。機械的断片化やライゲーションケミストリーに基づいたこのローインプットの手法はほぼ全てのシーケンスアプリケーションにおいて、高品質なカバレッジを実現し、バイアスを減らしました。
TruSeq DNA Nanoは、ゲルベースのサイズ選択をビーズベースのサイズ選択に置き換えることで合理化され、研究者は一日以内で高品質のライブラリーを調製することができるようになりました。この製品は2×101 bpから2×151 bpまでの様々なリード長に対応できるよう最適化されています。
TruSeq DNA Nanoはわずか100 ngのインプットで素晴らしい結果をもたらし、一般的な要件(数マイクログラムのDNA)を不要にします。これにより、研究者は利用可能なDNAが限られたサンプル(例:腫瘍サンプル)を研究できるようになり、将来または別の研究で使用できるようにサンプルを保存することができます。ビーズベースのサイズ選択は、ワークフローの迅速化に加え、ゲルベースのサイズ選択で起こりがちなサンプルロスを防ぐことができます。
TruSeq DNA Nanoは、PCRでよく見られるカバレッジギャップの数と平均的サイズを低減します。ワークフローが強化されることでライブラリーバイアスが減り、ゲノム全体でカバレッジ均一性が向上します。またこれらのキットは、従来は操作が困難とされたゲノムの領域(GCリッチ領域、プロモーター、反復領域など)を幅広く対象とします。これにより研究者は各シーケンスランからより多くの情報にアクセスできるようになります。Truseq DNA Nano製品は、ほぼ全ての次世代シーケンサー(NGS)アプリケーションにおいて、高品質のゲノムカバレッジを実現することが検証されています。
装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
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NextSeq 550 System | 1 sample per run (based on 30× coverage of a human genome) | 350 bp insert: ≤ 2 × 100 bp 550 bp insert: ≤ 2 × 150 bp |
HiSeq 2500 System | 2–10 samples per run (dual flow cell; based on 30× coverage of a human genome) | Rapid run, 350 bp insert: ≤ 2 × 100 bp Rapid run, 550 bp insert: ≤ 2 × 250 bp High output, 350 bp insert: ≤ 2 × 100 bp High output, 550 bp insert: ≤ 2 × 125 bp |
TruSeq DNA Nano | TruSeq DNA PCR-Free | Illumina DNA Prep |
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BaseSpace Sequence Hub helps the Biotechnology Resource Center Sequencing Core (BRC-Seq) at the University of British Columbia deliver high-quality sequencing data and additional value to its customers.
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Comparison of TruSeq Sample Preparation Kits
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TruSeq Nano DNA Library Prep Reference Guide Documentation
TruSeq DNA Nano Consumables & Equipment Documentation
TruSeq DNA Nano Checklist Documentation
TruSeq Nano DNA Library Prep Checklist Documentation
TruSeq Nano DNA Library Prep User-Supplied Consumables and Equipment Documentation
Illumina Experiment Manager User Guide Documentation
TruSeq HT Dual Index Quick Reference Card Documentation
TruSeq DNA Nano Reference Guide Documentation
カスタムプロトコルセレクタ
Generates customized, end-to-end instructions