イルミナDNA PCR-Free Prep が利用可能になりました。このライブラリー調製キットは、TruSeq DNA PCR-Freeと同等の性能を実現し、ターンアラウンドタイムとハンズオンタイムを削減します。
TruSeq DNA PCR-Freeは、全ゲノムシーケンスアプリケーションのためのシンプルで包括的なライブラリー調製を提供します。研究者は、細菌などの小さなゲノムからヒトの全ゲノムまで、さまざまな生物のシーケンスを行うことができます。ワークフローは以下を提供します。
TruSeq DNA PCR-Freeは、GCリッチな領域、プロモーター、反復的なコンテンツなど、従来シーケンスが困難な領域を優れたレベルでカバーします。
ワークフローはさまざまなリード長に調整可能で、イルミナのすべてのシーケンス装置でサポートされています。これにより、研究者は各ランを実験のニーズに合わせて調整することができます。
PCRフリーは、ライブラリーのバイアスとギャップを低減することを意味します。その結果、ゲノム全体で高いデータ品質と最適なバリアント検出が得られます。優れたゲノムカバレッジ品質は、ギャップがほとんどなく、GCが豊富な領域を良好にカバーできることを意味します。
PCRの除去は時間を節約し、PCRステップに関連するゲノムカバレッジバイアスを取り除きます。ビーズベースのサイズ選択によりワークフローが短縮されます。イルミナのシーケンスシステムと並行して、TruSeq DNA PCR-Freeは、広く採用されているライブラリー調製ワークフローに幅広い機能強化を提供します。
イルミナシーケンス用のライブラリーを1日で調製します。Illumina Qualified Methodは、当社のパートナーを通じてさまざまな自動化プラットフォームで利用できます。
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | 1ランあたり1サンプル（ヒトゲノムの30倍カバレッジに基づく） | 350 bpインサート：≤ 2 × 100 bp 550 bp挿入：≤ 2 × 150 bp |
| NovaSeq 6000 System | ランごとのサンプル（デュアルフローセル）：S1：8、S2：16、S4：48（ヒトゲノムの30×カバレッジに基づく） | 350 bp挿入：≤ 2 × 150 bp 550 bp挿入：≤ 2 × 150 bp |
| TruSeq DNA PCR-Free | Illumina DNA PCR-Free Prep | Illumina DNA Prep | TruSeq DNA Nano | |
|---|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | 合計アッセイ時間5時間 | 合計アッセイ時間約6時間 | ||
| インプット量 | DNA 1 ug | 100 ng ゲノムDNA | ||
| ターゲットインサートサイズ | 350 bpまたは550 bp | 350 bpまたは550 bp | ||
| ハンズオンタイム | 4時間 | 約4時間 | ||
| マルチプレックス | 最大24のシングル、96のコンビナトリアル（CD）デュアル、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル（UD）の組み合わせ（近日発売） | 最大24のシングル、96のコンビナトリアル（CD）デュアル、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル（UD）の組み合わせ（近日発売） | ||
| 作用機序 | メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローはPCRフリー、ゲルフリー。 | メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローでは、低バイアスPCRを使用し、ゲルフリーです。 | ||
| 方法 | シーケンスによるジェノタイピング, ショットガンシーケンス, 全ゲノムシーケンス | De Novoシーケンス, 全ゲノムシーケンス | ショットガンシーケンス, De Novoシーケンス, 全ゲノムシーケンス, アンプリコンシーケンス | シーケンスによるジェノタイピング, ショットガンシーケンス, 全ゲノムシーケンス |
| 生物種カテゴリー | その他, 哺乳類, ヒト | ヒト | ショウジョウバエ, ゼブラフィッシュ, 線虫, 酵母, 哺乳類, 細菌, ウイルス, ヒト | その他, 哺乳類, ヒト |
| 生物種詳細 | ほとんどの大きなDNAゲノムに対応。 | ほとんどの大きなDNAゲノムに対応。 | ||
| 自動化に関する互換性 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
Data Sheet | PDF | 5 versions
Mechanical DNA Fragmentation with the Q800R2 Sonicator
Technical Note | PDF 4 MB
Comparison of TruSeq Sample Preparation Kits
Technical Note | PDF < 1 MB
TruSeq DNA PCR-Free Consumables & Equipment Documentation
TruSeq DNA PCR-Free Library Prep User-Supplied Consumables and Equipment Documentation
TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Checklist Documentation
TruSeq DNA PCR-Free Reference Guide Documentation
Illumina Experiment Manager User Guide Documentation
TruSeq HT Dual Index Quick Reference Card Documentation
A high-performing, fast, and integrated workflow for sensitive applications such as human whole-genome sequencing.
