より柔軟にライブラリー調製用の単一コンポーネントを注文していただけるよう、イルミナは構成品単位での販売に移行してします。従来のTruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kits（カタログ番号FC-121-3001、FC-121-3002、FC-121-3003）はTruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit（カタログ番号20015962（サンプル数24）、カタログ番号20015963（サンプル数96））に移行します。インデックスアダプターはTruSeq DNA Single Indexes（カタログ番号20015960（Set A）、カタログ番号20015961（Set B））およびTruSeq DNA CD（デュアルの組み合わせ）Indexes（カタログ番号20015949（インデックス数96））として別売されます。
TruSeq DNA PCR-Freeは、全ゲノムシーケンスアプリケーション用のシンプルですべての試薬を含むライブラリー調製キットです。細菌などの小さなゲノムからヒト全ゲノムまで、多種多様な生物のシーケンスが可能になります。ワークフローの特長：
全ゲノムシーケンスワークフローにおいて、TruSeq DNA PCR-Freeは、GCリッチ領域、プロモーター領域、リピート領域などの従来ではシーケンスが困難だった領域においても優れたカバレッジを実現します。
このワークフローは、さまざまなリード長に対応しており、全てのイルミナシーケンサーでご利用いただけます。こうしたキットの適応性により、研究者は実験の内容に合わせてラン設定を行うことができます。
PCRフリーにより、ライブラリーのバイアスやギャップを低減します。その結果として、卓越したデータ品質を得ることができます。これにより、より多くの変異を検出することが可能となります。優れたゲノムカバレッジとは、得られた結果に含まれるギャップ（読めない領域）を最小にすると同時に、GCリッチ領域のカバレッジを改善することを意味します。
PCRに費やす時間を省き、PCRステップに伴うゲノムカバレッジのバイアスを排除します。ビーズを用いたサイズ選択により、ワークフローが短縮されます。TruSeq DNA PCR-Freeは、イルミナのシーケンサーと併用することで、広く使用されているライブラリー調製ワークフローをさまざまな面で強化します。
HTワークフローをサポートするロボットシステムを備えた自動化ベンダーの最新リストをご覧ください。
*96 UD Indexes はまもなく利用可能となります。
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | 1 sample per run (based on 30× coverage of a human genome) | 350 bp insert: ≤ 2 × 100 bp 550 bp insert: ≤ 2 × 150 bp |
| HiSeq 2500 System | 2–10 samples per run (dual flow cell; based on 30× coverage of a human genome) | 350 bp insert: ≤ 2 × 100 bp (rapid run) 550 bp insert: ≤ 2 × 250 bp (rapid run) 350 bp insert: ≤ 2 × 100 bp (high output) 550 bp insert: ≤ 2 × 125 bp (high output) |
| NovaSeq 6000 System | Samples per run (dual flow cell): S1: 8, S2: 16, S4: 48 (based on 30× coverage of a human genome) | 350 bp insert: ≤ 2 × 150 bp 550 bp insert: ≤ 2 × 150 bp |
Researchers from the Max Planck Institute and the University of Pennsylvania crowdfunded the genome sequencing of Lil Bub, using the NextSeq 500 System to uncover the genetic causes of the cat’s rare diseases.
Read MoreTGen researchers are combining crowd-sourcing and single-cell RNA sequencing on HiSeq Systems to adequately power genetic studies of memory.
Read More| Product | TruSeq DNA PCR-Free | TruSeq DNA Nano |
|---|---|---|
| Product versions | Low-Throughput (LT) and High-Throughput (HT) | LT and HT |
| Description | Comprehensive genomic coverage with reduced library bias and coverage gaps (compared to PCR-based options) | Based upon widely adopted TruSeq library prep, with lower input and improved data quality (compared to prior TruSeq kit versions) |
| Automation options | LT kits: Manual workflow HT kits: Automation-friendly; manual protocols also available |
LT kits: Manual workflow HT kits: Automation-friendly; manual protocols also available |
| Input quantity | 1–2 μg | 100–200 ng |
| Includes PCR | No | Yes |
| Assay time | ~5 hours | 5.5 hours |
| Hands-on time | ~4 hours | 4 hours |
| Target insert size | 350 bp or 550 bp | 350 bp or 550 bp |
| Gel-free | Yes | Yes |
| Number of samples supported | 24 (LT) or 96 (HT) samples | 24 (LT) or 96 (HT) samples |
| Size-selection beads | Included | Included |
| Applications | Whole-genome sequencing applications, including whole-genome resequencing, de novo assembly, and metagenomics studies | |
| Sample multiplexing | Up to 24 single, 96 combinatorial (CD) dual, 24 unique dual and 96 unique dual (UD) combinations | |
| Compatible Illumina sequencers | MiniSeq, MiSeq, NextSeq, HiSeq, NovaSeq, HiSeq X, and HiScanSQ systems | |
Comparison of TruSeq Sample Preparation Kits
Technical Note | PDF< 1 MB
Mechanical DNA Fragmentation with the Q800R2 Sonicator
Technical Note | PDF4 MB
Data Sheet | PDF | 5 versions
TruSeq DNA PCR-Free Library Prep User-Supplied Consumables and Equipment Documentation
TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Checklist Documentation
TruSeq HT Dual Index Quick Reference Card Documentation
Illumina Experiment Manager User Guide Documentation
TruSeq DNA PCR-Free Reference Guide Documentation
TruSeq DNA PCR-Free Consumables & Equipment Documentation
TruSeq DNA PCR-Free Checklist Documentation
カスタムプロトコルセレクタ
Generates customized, end-to-end instructions
Generate whole-genome sequencing libraries and efficiently interrogate samples with limited available DNA.
ヒト全ゲノムシーケンスからアンプリコン、プラスミド、微生物ゲノムまで、幅広いアプリケーションに対応した短時間の完結したワークフロー。
このライブラリー調製キットは、業界で最も少ないDNAインプット量で最長12 kbまでのメイトペアライブラリーをゲルフリーの手法で作製できます。
