マルチプレックスシーケンス

より多くのサンプルをより短時間で処理

1ランあたりのサンプル数を増やし、ハイスループットシーケンスを最適化

サンプルマルチプレックス概要

サンプルマルチプレックスは、マルチプレックスシーケンスとも呼ばれ、イルミナ機器での1回のランで多数のライブラリーをプールし、シーケンスを同時に行うことができます。サンプルのマルチプレックスは、特定のゲノム領域をターゲットとした場合や、より小さなゲノムを扱う場合に有効です。サンプルのプーリングにより、コストや時間の大幅な増加なしに、1回のランで分析できるサンプル数を飛躍的に増やせます。

マルチプレックスシーケンスの場合、次世代シーケンサー(NGS)ライブラリー調製時に、それぞれのDNA断片に個別の「バーコード」シーケンスを付加するため、最終データ解析前に各リードを同定、分類することが可能です。これらのバーコード(インデックス付きアダプター)は、ライブラリー調製キットやアプリケーションに応じて、2つの主要なインデックス戦略のうちの1つに従うことができます。

サンプルマルチプレックスの概念図

マルチプレックスシーケンスのハイライト

  • 高速ハイスループット戦略:1回の実験で大量のサンプルを同時にシーケンスすることができます
  • 費用対効果の高い手法:サンプルのプーリングにより、時間と試薬の使用量を削減し、生産性を向上させます。
  • 解析の簡略化:"イルミナデータ解析ソフトウェアを用いた「バーコード」によるサンプルの自動識別
サンプルのマルチプレックスにより微生物研究を促進

研究者たちは、イルミナシーケンサーのスピードとマルチプレックスシーケンス機能を活用し、ミシシッピ川沿いの微生物を同定しています。

インタビューを読む

マルチプレックスシーケンスの関連トピック

デュアルインデックスされたシーケンス

マルチプレックス用のライブラリーを準備する場合、ユニークデュアルインデックスの使用を推奨します。ユニークデュアルインデックスにより、他のインデックス戦略と比較して、1回のランでシーケンスするサンプル数を増やし、サンプルあたりのコストを削減することができます。

詳細はこちら
分子バーコード(UMI

分子バーコード(UMI)は、分子バーコーディングの一種で、シーケンス時にエラー補正を行って精度を向上させることができます。UMIを用いたシーケンスにより、偽陽性バリアントコールを減らし、バリアント検出の感度を向上させることができます。

詳細はこちら
インデックスホッピングの最小化

マルチプレックスの場合、使用するライブラリ調製方法や使用するシーケンスシステムに関係なく、インデックスホッピングの可能性が存在します。インデックスホッピングの影響を最小限にするためのベストプラクティスを学ぶ。

詳細はこちら
Chan Zuckerberg BiohubとNovaSeq 6000システム

Chan Zuckerberg Biohubの研究者たちは、ゲノミクスの分野で革新的な実験を行い、新たな協力関係を築くために活動しています。NovaSeq 6000システムにより、多くのサンプルを束ねて、人々の健康増進に役立つ医学研究を行うことができるようになりました。

動画を視聴

関連コンテンツ

  • ハイスループットシーケンス法:シングルセル解析や空間解析など、新しいデータ豊富な手法をコスト効率よく実行し、より多くのサンプルを処理して統計学的検出力を向上させることができます。
  • ライブラリー調製の自動化:シーケンスライブラリーの大量調製を支援するために設計された自動リキッドハンドリングソリューションをご紹介します。
  • プーリングカルキュレーター:ライブラリーのプールをマルチプレックスシーケンスに適した濃度に希釈する。
柔軟で拡張性のあるシーケンサー

NovaSeq 6000システムは、拡張性のあるスループットと柔軟性により、すべてのゲノム、シーケンス手法、およびプロジェクト規模に対応します。

システムを見る
イルミナからご研究分野に応じたニュースレター、研究事例や情報などをお送りいたします。

ご登録はこちらから。

関連ソリューション

ライブラリー調製とアレイキットセレクター

ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。

シーケンス

イルミナのシーケンスでは、あらゆる生物のゲノム、トランスクリプトーム、エピゲノムに関連するあらゆる質問をバーチャルでおこなうことができます。

イルミナのシーケンスプラットフォーム

ベンチトップシーケンサーと生産規模のシーケンサーを表示し、適切なプラットフォームの選択に役立つリソースを見つけてください。