Small RNAシーケンス
Small RNAシーケンスのご紹介
Small RNAノンコーディングRNAは、遺伝子発現の遺伝子サイレンシングと転写後制御に作用します。Small RNAシーケンス（RNA-Seq）は、microRNA（miRNA）などの小さなRNA種を分離し、シーケンスするための技術です。Small RNA-Seqは、これまでにない感度とダイナミックレンジで、数千もの小さなRNAとmiRNAシーケンスを解析できます。
Small RNA-Seqでは、新規miRNAやその他の小さなノンコーディングRNAを探索し、あらゆるサンプル中のすべての低分子RNAの発現差異を調べることができます。isomiR などのバリエーションを単一塩基分解能で特徴付けることができ、事前の配列情報や二次構造情報がなくても、Small RNAやmiRNAを解析することができます。
Small RNAシーケンスの利点
ノンコーディングRNAの役割を理解するために、トータルRNAから直接miRNAシーケンスライブラリーを生成します。
- 転写後の制御が表現型にどのように寄与するかを理解する
- 新規バイオマーカーの同定
- あらゆるSmall RNAおよびmiRNA種をキャプチャー
エピジェネティック解析とSmall RNA-Seq
イルミナは、エピジェネティックな修飾やSmall RNA遺伝子制御の研究に関心のある研究者向けに、エピジェネティック解析ツールの幅広いポートフォリオを提供しています。
詳細はこちらRNA シーケンス検討事項
遺伝子発現プロファイリング、ターゲットRNA発現、small RNA解析、など、それぞれのRNA-Seq実験によって、必要とされるリード長や深度は異なります。このページでは、実験において考慮すべき点をレビューしています。実験計画にご活用ください。
詳細はこちら
Partek FlowによるSmall RNA-Seqデータの解析と視覚化
Partek Flowソフトウェアは、使いやすいバイオインフォマティクスプラットフォームで、ビジュアルユーザーインターフェースで次世代シーケンサーと大規模マルチオミクスデータの解析を簡素化します。
Partekソフトウェアは、microRNA-Seqデータを解析して発現差異のあるmicroRNAを検出し、同じ組織内で定量化された発現差異のあるメッセンジャーRNAとの統合を実現します。これにより、microRNAが細胞機能に広範な変化をもたらす全体像を把握することができます。
Partek Flowの詳細はこちらSmall RNA-Seq ワークフロー
イルミナのSequence by Synthesis（SBS）ケミストリーは、最も広く採用されている次世代シーケンサー（NGS）テクノロジーで、世界中のシーケンスデータの約90%を生成しています。*
イルミナは、業界をリードするデータ品質に加えて、ライブラリー調製からデータ解析、生物学的解釈まで、プロセス全体を簡素化する、small RNAおよびmiRNA シーケンスのシンプルなワークフローを提供します。
MiniSeqベンチトップシーケンサーでイルミナ品質NGSにアクセス
ベンチトップ、予算、ワークフローに適したシーケンスソリューションで、Small RNA-Seqを実行します。新しいmiRNAを探索し、以前のシーケンスや二次構造の情報なしに小さなノンコーディングRNAを解析します。
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関連ソリューション
がん研究 バリアント検出
Small RNAシーケンスにより、がんトランスクリプトーム内に存在するmiRNAやその他の小さなノンコーディングRNAの探索プロファイリングを非常に高いカバレッジで行うことができます。がんトランスクリプトーム研究の詳細はこちら。
複雑な疾患 RNA編集
NGSベースのプロファイリングは、miRNAトランスクリプトームの高速でハイスループットな解析を可能にし、複雑な疾患関連RNA編集プロセスや変異イベントに関する洞察を提供します。複雑な疾患研究の詳細はこちら。
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Additional Resources
Small RNAシーケンスのベストプラクティスに関するウェビナー
Small RNAライブラリー調製、シーケンス、および基礎データ解析の考慮事項。
タッチパネル操作のインフォマティクス
NGSデータを容易に解析、保管、共有できるユーザーフレンドリーなツールにアクセスしてください。
TruSeq Small RNA Library Kit の FAQ
Small RNA-Seq についてよくある質問に対する回答をご覧ください。
RNA-Seq と NextSeq シリーズ
NextSeqシリーズのシーケンスシステムはコスト効率的なRNA-Seqソリューションを手軽に手にすることができます。
*社内計算データ Illumina, Inc., 2015