はじめに： Small RNAシーケンス
次世代シーケンサーが進化を続けるなか、イルミナのSmall RNAシーケンス（Small RNA-Seq）のマルチプレックス性能も向上し、スループットも高くなりました。Small RNA-Seqは、低分子RNAの探索およびプロファイリングの両アプリケーションにおける優れた感度とダイナミックレンジを備えており、数千の低分子RNAおよびmiRNAシーケンスを明らかにすることができます。
Small RNA-Seqでは、新規miRNAおよび他の低分子ノンコーディングRNAの探索、1塩基の解像度をもとにしたisomiR変異の特徴づけ、既知配列および構造情報を必要としない低分子RNAまたはmiRNA解析が可能です。TruSeq Small RNA Library Prep Kitはサイズ選択のカスタム化に対応しており、17～35ヌクレオチドのSmall RNAの検討や、あらゆるサンプル中の全Small RNAの差異的遺伝子発現解析が可能です。
Small RNAシーケンスの利点
トータルRNAから直接miRNAシーケンスライブラリーを調製し、ノンコーディングRNAの役割を解析できます。
- 転写後制御の表現型に対する寄与の把握
- 新規バイオマーカーの同定
- 低分子RNAおよびmiRNA全範囲のキャプチャー
エピジェネティクス解析とSmall RNA-Seq
エピジェネティクスは、DNAシーケンスの変化を伴わずに生じる、遺伝子制御における遺伝性変化を研究する領域です。この研究領域では、DNAとタンパク質の相互作用、DNAメチル化、Small RNAによる遺伝子制御などが検討されます。イルミナは、エピジェネティックな変化や遺伝子制御の検討のために、頑健で使いやすくコスト効率に優れたソリューションをもたらす幅広いエピジェネティクス解析ツールを提供しています。
Small RNAシーケンスのワークフロー
イルミナは、ライブラリー調製からデータ解析および生物学的解釈までのプロセス全体を容易にする、シンプルな低分子RNAシーケンスワークフローを提供します。
ワークフローが合理化かつ統合されているだけでなく、イルミナの1塩基合成反応（SBS：sequencing by synthesis）ケミストリーは最も広く採用されているNGSテクノロジーであり、世界中のシーケンスデータの約90%以上がこのテクノロジーを利用して産出されています。*
下のをクリックしてワークフローの各ステップで利用できる製品をご覧ください。
TruSeq Small RNA Library Prep Kit
トータルRNAから直接miRNAシーケンスライブラリーを調製できるシンプルかつコスト効率に優れたソリューション。
ライブラリー調製キット選択ツール
プロジェクトの種類、スタート物質、分析法またはアプリケーションに基づき、ニーズに最適なキットをお探しください。
MiSeqシリーズ
特化に関する性能。ターゲットシーケンスと小さいゲノム解析のためのスピードと簡易性1ランあたり低分子RNAサンプル1～5を実現。
NextSeqシリーズ自由度の高い性能。一般的なゲノム解析向きのスピードと使いやすさ。1ランあたり低分子RNAサンプル25～80を実現。
HiSeqシリーズ生産性に優れた性能。低コストかつ大容量で多彩なアプリケーションに対応する高スループットシーケンサー。1ランあたり低分子RNAサンプル60～792を実現。
プラットフォーム比較ツール
シーケンスプラットフォームを比較し、研究室およびアプリケーションに最適なシステムをお探しください。
シーケンス試薬イルミナのシーケンスシステム用のシーケンス試薬、フローセル、バッファーが同梱されているキットをご覧ください。
MiSeq ReporterおよびBaseSpaceでは、Small RNAアプリを使用できます。
miRNAs Analysisアプリ2つの条件下で差異的遺伝子発現が認められるmiRNAを検出可能です。アダプタートリミング、リードカウントなどを実行します。
Broad IGVMITおよびハーバード大学によって開発された、NGSによる複雑な多型解析データを表示するゲノムブラウザー。
Genomatix Pathway System (GePS)単一遺伝子または遺伝子のリストに、パスウェイ、疾患、組織、低分子に関するアノテーションデータを関連付けます。
iPathway Guide
差異的遺伝子発現、薬物相互作用、および疾患の解析。
BaseSpace CloudまたはOnsiteNGSデータの解析と管理のためのイルミナのゲノミクスコンピューティング環境。
NextBio Research拡大し続けている、疾患機序、薬剤標的、およびバイオマーカーを特定するためのキュレーション済みゲノムデータライブラリー。
関連ソリューション
がん研究：変異検出
貴重な腫瘍サンプルを高感度で解析し、1細胞あたりのシングルコピーレベルで変異を検出したい場合があります。Small RNAシーケンスでは、がんトランスクリプトーム中のmiRNAおよび他の低分子ノンコーディングRNAの探索およびプロファイリングを、きわめて高いカバレッジで実施できます。
がんトランスクリプトーム >>
複雑な疾患：RNA編集
自然免疫系、獲得免疫系、CNS、およびさまざまな疾患の細胞に固有のmiRNA発現プロファイルが存在します。NGSベースのプロファイリングでは、RNA編集プロセスや変異イベントに関する情報など、迅速かつ高スループットなmiRNAトランスクリプトーム解析が実現します。高カバレッジの低分子RNAシーケンスにより、新規miRNA種の探索や低頻度変異の同定が可能です。
遺伝子発現プロファイリングおよび制御 >>
関連論文
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追加リソース
* データはイルミナにて公的データベースをもとに計算（2015）