はじめに： Small RNAシーケンス
次世代シーケンサーが進化を続けるなか、イルミナのSmall RNAシーケンス（Small RNA-Seq）のマルチプレックス性能も向上し、スループットも高くなりました。Small RNA-Seqは、低分子RNAの探索およびプロファイリングの両アプリケーションにおける優れた感度とダイナミックレンジを備えており、数千の低分子RNAおよびmiRNAシーケンスを明らかにすることができます。
Small RNA-Seqでは、新規miRNAおよび他の低分子ノンコーディングRNAの探索、1塩基の解像度をもとにしたisomiR変異の特徴づけ、既知配列および構造情報を必要としない低分子RNAまたはmiRNA解析が可能です。TruSeq Small RNA Library Prep Kitはサイズ選択のカスタム化に対応しており、17～35ヌクレオチドのSmall RNAの検討や、あらゆるサンプル中の全Small RNAの差異的遺伝子発現解析が可能です。
Small RNAシーケンスの利点
トータルRNAから直接miRNAシーケンスライブラリーを調製し、ノンコーディングRNAの役割を解析できます。
- 転写後制御の表現型に対する寄与の把握
- 新規バイオマーカーの同定
- 低分子RNAおよびmiRNA全範囲のキャプチャー
Epigenetic Analysis and Small RNA-Seq
Illumina offers a broad portfolio of epigenetic analysis tools for investigators interested in studying epigenetic modifications and small RNA gene regulation.
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Small RNAシーケンスのワークフロー
イルミナは、ライブラリー調製からデータ解析および生物学的解釈までのプロセス全体を容易にする、シンプルな低分子RNAシーケンスワークフローを提供します。
ワークフローが合理化かつ統合されているだけでなく、イルミナの1塩基合成反応（SBS：sequencing by synthesis）ケミストリーは最も広く採用されているNGSテクノロジーであり、世界中のシーケンスデータの約90%以上がこのテクノロジーを利用して産出されています。*
下のをクリックしてワークフローの各ステップで利用できる製品をご覧ください。
Access Illumina Quality NGS with the MiniSeq Benchtop Sequencer
Perform small RNA-Seq with a sequencing solution that fits your benchtop, your budget, and your workflow. Discover novel miRNAs and analyze any small noncoding RNA without prior sequence or secondary structure information.
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貴重な腫瘍サンプルを高感度で解析し、1細胞あたりのシングルコピーレベルで変異を検出したい場合があります。Small RNAシーケンスでは、がんトランスクリプトーム中のmiRNAおよび他の低分子ノンコーディングRNAの探索およびプロファイリングを、きわめて高いカバレッジで実施できます。
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複雑な疾患：RNA編集
自然免疫系、獲得免疫系、CNS、およびさまざまな疾患の細胞に固有のmiRNA発現プロファイルが存在します。NGSベースのプロファイリングでは、RNA編集プロセスや変異イベントに関する情報など、迅速かつ高スループットなmiRNAトランスクリプトーム解析が実現します。高カバレッジの低分子RNAシーケンスにより、新規miRNA種の探索や低頻度変異の同定が可能です。
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追加リソース
Small RNAシーケンスのベストプラクティスに関するウェビナー
Small RNAライブラリー調製、シーケンス、および基礎データ解析の考慮事項。
タッチパネル操作のインフォマティクス
NGSデータを容易に解析、保管、共有できるユーザーフレンドリーなツールにアクセスしてください。
TruSeq Small RNA Library Kit の FAQ
Small RNA-Seq についてよくある質問に対する回答をご覧ください。
RNA-Seq と NextSeq シリーズ
NextSeqシリーズのシーケンスシステムはコスト効率的なRNA-Seqソリューションを手軽に手にすることができます。
* データはイルミナにて公的データベースをもとに計算（2015）