Small RNAは、遺伝子サイレンシングと転写後活性を通じて、遺伝子発現の制御に重要な役割を果たす短いノンコーディングRNAです。Small RNAシーケンス（Small RNA-Seq）は、遺伝子制御、発生、疾患に関与するmicroRNA（miRNA）やその他の小さなノンコーディングRNAについて、高感度な単一塩基解像度の洞察を提供します。循環miRNAバイオマーカーの探索、miRNAアイソフォーム（isomiR）の特性評価、多様なsmall RNA種のプロファイリングのいずれを行う場合でも、イルミナのシーケンスは、あらゆるサンプルタイプや研究デザインにおいて、正確かつハイスループットな測定を提供します。
Small RNA-Seqは、mRNAに焦点を当てた従来のシーケンスアプローチでは効果的にキャプチャーできない、短い制御性RNA分子の包括的な解析を可能にします。Small RNA-Seqは、次世代シーケンサー（NGS）を活用することで、多様なサンプルタイプ全体にわたるsmall RNA発現のバイアスのない視点を提供します。
主な利点：
miRNA-Seqは、転写後遺伝子発現の重要な制御因子として機能し、発生、疾患進行、細胞経路などに影響を与えるmicroRNAの正確な測定に焦点を置いています。Small RNA-Seqのワークフロー内では、miRNAシーケンスにより、miRNA主導の制御ネットワークに対する深い生物学的洞察が得られます。
主な利点：
このガイドは、ターゲットパネルから全トランスクリプトームまで、RNAプロファイリングのためのソリューションを提供します。イルミナのRNA-Seqワークフローは、ライブラリー調製、シーケンス、データ解析を統合し、トランスクリプトーム研究をサポートします。
DRAGEN Secondary Analysisは、NGSデータの正確で包括的かつ効率的な解析を提供する、強力なソフトウェアツール一式です。DRAGEN miRNAアプリケーションは、FFPE組織、血液、細胞培養など、多様なサンプルタイプから抽出されたトータルRNAから、miRNAおよびその他のsmall RNAの正確なアライメントと定量化を可能にします。
Illumina Connected Multiomicsは、マルチオミクスデータの解釈と視覚化のための強力でスケーラブルな解析環境です。Illumina Connected Multiomicsは、miRNA-Seqデータを解析して発現差異のあるmiRNAを検出し、同じ組織内で定量化された発現差異のあるメッセンジャーRNAとの統合を実現します。これにより、miRNAが細胞機能に広範な変化をもたらす全体像を把握することができます。
NGSを用いて、プロテオーム、エピゲノム、ノンコーディングRNA、small RNAの特性評価を行う方法をご覧ください。
Small RNAシーケンスは、遺伝子発現や細胞経路を制御するmicroRNA（miRNA）などの短いノンコーディングRNA分子のプロファイリングに使用されます。これは、バイオマーカーの発見、疾患研究、機能ゲノミクスに広く応用されています。
Small RNAシーケンスはsmall RNA種の全体をキャプチャーするのに対し、miRNAシーケンスはmiRNAのみに焦点を当てます。。
メッセンジャーRNAシーケンス（mRNA‑Seq）は、長いタンパク質コード転写産物を測定しますが、Small RNA‑Seqは、転写後の遺伝子発現を制御する短いノンコーディングRNAをターゲットとします。これらのアプローチは、全体として、遺伝子制御の補完的な視点を提供します。
イルミナのmiRNA Prepは、1～500 ngのトータルRNA用に最適化されています。
シングルエンドシーケンスはsmall RNA-SeqおよびmiRNAシーケンスに推奨されており、正確なアライメントと定量化に十分です。完全なsmall RNAインサートはシングルリードでキャプチャーされるため、ペアエンドシーケンスはsmall RNAライブラリーには利点がありません。
はい、small RNAは小さすぎるため、トータルRNAおよびmRNAライブラリー調製キットではキャプチャーできません。このようなsmall RNAから生成されたライブラリー断片は、ビーズによるクリーンアップステップにおいて忠実に保持されません。
当社の参考資料で、small RNAの詳細をご覧ください。
Small RNAの一般的なタイプには、マイクロRNA（miRNA）、低分子干渉RNA（siRNA）、PIWI相互作用RNA（piRNA）があります。
RNAシーケンスを用いて、がんの遺伝子発現およびトランスクリプトームの変化を検出し、新規がん転写産物を研究します。
NGSベースのプロファイリングは、miRNAトランスクリプトームの高速でハイスループットな解析を可能にし、複雑な疾患関連プロセスや変異イベントに関する洞察を提供します。
イルミナは、エピジェネティックな修飾や遺伝子制御の研究に関心のある研究者向けに、エピジェネティック解析ツールの幅広いポートフォリオを提供しています。
本研究では、トランスクリプトーム全体のRNA-Seqによって、長鎖ノンコーディングRNAの制御の複雑性がどのように解明され、がんや疾患研究においてRNAベースの洞察がいかに重要であるかを明らかにしています。
イルミナのバイオインフォマティクスツールは、大量の複雑なゲノムデータの管理、解析、解釈を容易にします。
この記事では、様々なRNA-Seq実験タイプの検討事項を考察し、研究デザインに役立つリソースを提供します。
Small RNA-Seqのソリューションに関する詳細情報をご希望の場合は、お気軽にお問い合わせください。