Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit
単独で機能するIllumina Ribo-Zero Plusキットを使って、ヒト、マウス、ラット、バクテリアのサンプルでリボソームRNAを除去することが可能です。
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イルミナRibo-Zero Plus rRNA Depletionキットに付属の試薬は、酵素除去を使用して豊富なRNAを除去します。残りのRNAはその後、TruSeq Stranded Total RNA試薬を使用してイルミナシーケンスシステム用のシーケンス対応ライブラリーに変換されます。
| サンプル | ターゲットrRNA |
|---|---|
| ヒト細胞質rRNA | 28S, 18S、5.8秒、5S |
| ヒトミトコンドリアrRNA | 12S, 16S |
| ヒトβグロビン転写産物 | HBA1, HBA2、HBB、HBG1, HBG2 |
| マウス&ラットrRNA | 16S, 28S |
| グラム（-）細菌rRNA | 大腸菌：5S, 16S, 23S |
| Gram(+) Bacterial rRNA | 枯草菌：5S, 16S, 23S |
| Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit | Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit | |
|---|---|---|
| 説明 | メタトランスクリプトミクス研究のための宿主および細菌rRNAからの大量の転写産物の枯渇。 | 複数の種または転写産物からの豊富な転写産物のシングルチューブ枯渇 |
| インプット量 | 最適な性能を得るために、最低25 ngのトータルRNA、50 ngを推奨 | 標準品質のRNA検体にはトータルRNA1～1,000 ng、最適パフォーマンスとFFPE検体にはトータルRNA10 ng以上を推奨 |
| システム互換性の詳細 | ライブラリー調製は、すべてのイルミナシーケンスシステムと互換性があるように設計されており、NextSeq 500、NextSeq 550、NextSeq 1000、NextSeq 2000、およびNovaSeq 6000システムで使用することを推奨します。 | ライブラリー調製は、すべてのイルミナシーケンスシステムと互換性があるように設計されており、NextSeq 500、NextSeq 550、NovaSeq 6000システムで広く検証されています。 |
| ストランド特異性 | ストランド化 | ストランド化 |
| 方法 | 全トランスクリプトームシーケンス、メタトランスクリプトームシーケンス | 全トランスクリプトームシーケンス |
| バリアントクラス | 新規転写産物、転写産物バリアント | 遺伝子融合、新規転写産物、単一ヌクレオチド多型（SNP）、転写産物バリアント |
| 生物種カテゴリー | 細菌、ヒト、マウス、ラット | 細菌、ヒト、マウス、ラット |
| 生物種詳細 | Ribo-Zero Plusにリストされているすべての転写産物に加えて、糞便サンプルを含む複雑な細菌（微生物叢）サンプルから大量のrRNA転写産物が除去されます。 | ヒト細胞質&ミトコンドリアrRNA、マウスrRNA、ラットrRNA、大腸菌およびB. subtilis rRNA、ヒトβグロビン転写産物など、複数の種からの大量の転写産物の除去 |
| システム互換性 | NextSeq 1000、NextSeq 2000、NextSeq 500、NextSeq 550、NovaSeq 6000 | HiSeq 2500、HiSeq 3000、HiSeq 4000、NextSeq 1000、NextSeq 2000、NextSeq 500、NextSeq 550、NovaSeq 6000 |
| 特殊なサンプルタイプ | 複雑な微生物サンプル（糞便） | FFPE組織、低インプットサンプル |
| 核酸タイプ | RNA | RNA |
Microbial RNA sequencing enabled with the Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit
Technical Note | PDF < 1 MB
Data Sheet | PDF | 6 versions
コーディングおよびノンコーディングトランスクリプトーム研究用の広範な種類のサンプルから迅速にライブラリーを調製して、非常に優れた柔軟性を持って研究を行うことができます。
A robust, highly scalable whole-transcriptome analysis (RNA-Seq) solution for a variety of species and sample types, including human, mouse, and formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue.
リボソームRNAとグロビンmRNAを1ステップで除去する効率的なワークフローで、血液由来RNAから全トランスクリプトームシーケンスライブラリーを調製します。
メタトランスクリプトミクス研究のための複雑な微生物サンプル（便など）から望ましくない宿主および汎細菌rRNAを迅速かつ効率的に除去します。
このRNA-Seqライブラリー調製ワークフローで、植物トランスクリプトームの全体像を捉えることができます。植物の葉、種、根組織からrRNAを取り除きます。
