イルミナRibo-Zero Plus rRNA Depletion Kitに付属の試薬は、酵素除去を使用して豊富なRNAを除去します。次に、残りのRNAは、TruSeq Stranded Total RNA試薬を使用してイルミナシーケンスシステム用のシーケンス対応ライブラリーに変換されます。
サンプル | ターゲットrRNA |
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ヒト細胞質rRNA | 28S, 18S、5.8秒、5S |
ヒトミトコンドリアrRNA | 12S, 16S |
ヒトβグロビン転写産物 | HBA1, HBA2、HBB、HBG1, HBG2 |
マウス&ラットrRNA | 16S, 28S |
グラム(-)細菌rRNA | 大腸菌:5S, 16S, 23S |
Gram(+) Bacterial rRNAs | 枯草菌:5S, 16S, 23S |
Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit | Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit | |
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説明 | メタトランスクリプトミクス研究のための宿主および細菌rRNAからの大量の転写産物の枯渇。 | 複数の種または転写産物からの豊富な転写産物のシングルチューブ枯渇 |
インプット量 | 最適な性能を得るために、最低25 ngのトータルRNA、50 ngを推奨 | 標準品質のRNA検体にはトータルRNA1~1,000 ng、最適パフォーマンスとFFPE検体にはトータルRNA10 ng以上を推奨 |
システム互換性の詳細 | ライブラリー調製は、すべてのイルミナシーケンスシステムと互換性があるように設計されており、NextSeq 500、NextSeq 550、NextSeq 1000、NextSeq 2000、およびNovaSeq 6000システムで使用することを推奨します。 | ライブラリー調製は、すべてのイルミナシーケンスシステムと互換性があるように設計されており、NextSeq 500、NextSeq 550、NovaSeq 6000システムで広く検証されています。 |
ストランド特異性 | ストランド化 | ストランド化 |
方法 | 全トランスクリプトームシーケンス、メタトランスクリプトームシーケンス | 全トランスクリプトームシーケンス |
バリアントクラス | 新規転写産物、転写産物バリアント | 遺伝子融合、新規転写産物、単一ヌクレオチド多型(SNP)、転写産物バリアント |
生物種カテゴリー | 細菌、ヒト、マウス、ラット | 細菌、ヒト、マウス、ラット |
生物種詳細 | Ribo-Zero Plusにリストされているすべての転写産物に加えて、糞便サンプルを含む複雑な細菌(微生物叢)サンプルから大量のrRNA転写産物が枯渇。 | ヒト細胞質&ミトコンドリアrRNA、マウスrRNA、ラットrRNA、大腸菌およびB. subtilis rRNA、ヒトβグロビン転写産物など、複数の種からの大量の転写産物の除去 |
システム互換性 | NextSeq 1000、NextSeq 2000、NextSeq 500、NextSeq 550、NovaSeq 6000 | HiSeq 2500、HiSeq 3000、HiSeq 4000、NextSeq 1000、NextSeq 2000、NextSeq 500、NextSeq 550、NovaSeq 6000 |
サンプルタイプ | 複雑な微生物サンプル(糞便) | FFPE組織、低インプットサンプル |
核酸タイプ | RNA | RNA |
Microbial RNA sequencing enabled with the Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit
Technical Note | PDF < 1 MB
Illumina Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus
Data Sheet | PDF 1 MB