2017年3月31日
ライフサイエンス分野におけるバイオマーカーの発見と同定の役割は、特に腫瘍学において、個別化された治療アプローチを提供する目的で重要です。 ゲノム技術の進歩により、小さなバリアント、遺伝子増幅、遺伝子融合、スプライスバリアントなど、がんに関連する遺伝子異常をターゲットにできる幅広い遺伝的バリアントタイプがもたらされます。これらのゲノムアッセイでより広範な遺伝子含有量を有することで、治療法の開発に重要なターゲットである構造的変化を同定し、固形腫瘍の検査を合理化できる可能性もあるため、臨床がん研究を改善することができます。
最近発売されたTruSight Tumor 170は、DNAとRNAを1つのプロトコールに統合し、がん関連バリアントの包括的な解析を加速し、貴重なサンプルから得られるデータを最大化します。TruSight Tumor 170は、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプルからの限られた核酸インプット（40ngのDNAおよびRNA）をサポートするように設計されており、バイオマーカーの効率的な評価を促進します。
Almac DiagnosticsのFRCPath博士であるLeona Galligan博士と話をし、次世代シーケンサー（NGS）をどのように活用してクライアントに革新的でクラス最高のサービスを提供しているかについて話し合いました。
ご自身について少し教えていただけますか？
Leeona Galliganと申します。Almac Diagnosticsの英国オペレーション担当副社長です。この施設での湿式ラボ 作業を担当しています。Almacに入社する前は、分子血液学の博士号を取得し、Belfastで博士 号を取得しました。その後、英国のNational Healthcare システム内で血液学を 専門とする臨床サイエンティストの資格を取得しました。キャリアの初期に遡ると、自動化とコンピューターのパワーが不足 しているため、現在利用できるツールとは大幅に異なっていました。以前は分子生物学の理解に着手していましたが、 今では、これらの生物学を活用するためのツールと連携し始めていると思います。
その間に、アルマックにゲノミクスはどのような価値をもたらしましたか？
ゲノミクスは当社のビジネスの中核であり、一貫して焦点を当ててきたと言っても過言ではありません。ゲノム評価だけでなく、複雑な生物学の ゲノム評価も行います。当社の事業には2つの側面があります。NGS、qPCR、IHC、マイクロアレイなどのテクノロジーを使用して、 さまざまな腫瘍学の適応（結腸、乳房、前立腺など）のためのマルチプレックスバイオマーカーを独自に開発しました。さらに、複雑な生物学に関するバックグラウンドの専門知識 を活用して、製薬およびバイオテクノロジーのクライアント向けに高度にカスタマイズされたCDx開発ソリューションを提供しています。 ゲノミクスソリューションは、背景生物学における当社の専門知識を活用して、 主に製薬会社であるクライアントのために堅牢で適切なツールを開発する方法を提供します。当社の設立以来、当社はその焦点に忠実であり続け、複雑な生物学を評価するためのゲノムツールの応用という点で 世界的リーダーとしての評判を築いてきました。
あなたはTruSight Tumor 170のベータサイトでした。 どのように使用する計画か話せますか？
当社にとって、これは製薬業界のクライアント向けの幅広いスクリーニングアッセイのレパートリーにおいて強力なツールです。TruSight Tumor 170は、 ソリューションプロバイダー であるAlmacがゼロから設計する必要はありません。必要に応じて、さらなる異常選択や分析バリデーション作業を行う準備が整いました 。これは、お客様が適切な幅広い遺伝子のRNAとDNAの両方を評価できるもう一つのサービスです。 製薬業界のクライアントの観点からは、 個別化治療 を可能にするために、関連するバイオマーカーを選択したい薬剤または薬剤パネルが顧客にあります。そのため、これらをすべて組み合わせると、最適なスクリーニングメカニズムになります。
アッセイの柔軟性は多くの価値をもたらすと思いますか？
はい。クライアントが焦点を当てる必要がある項目がよく分からない場合や、関連性のある項目を捉えないことを恐れている場合、パネル内の特定の遺伝子やそれらの遺伝子の特定の異常の評価も可能にするために、パネルがカスタマイズする可能性は 明らかです。
欧州がん研究 治療機関 （EORTC）との協力とAlmacの役割について、少し時間を取って説明していただけますか？
当社は昨年、EORTCによって分子プロファイリングの優先パートナーとして選ばれました。EORTCは、欧州の 幅広い適応症と国で臨床試験を手配しています。2017年には、プロファイリング 用の臨床サンプルを送るために、すでに多数の試験が並んでいます。これらはすべてヨーロッパ全土で実施されている臨床試験の腫瘍学の適応であり、TruSight Tumor 170でプロファイリングする予定です。得られたデータは、EORTCの一元化されたSPECTAデータベース（効果的な臨床試験アクセスのための患者のスクリーニング）に含まれ ます。その目的は、これらのサンプルから得られる非常に 幅広いゲノムデータをまとめることです。それは私たちの専門分野に非常に適合しており、私たちは、EORTCがSPECTAデータベースに取り込まれるための堅牢で意味のあるデータ を得るのに本当に役立つと信じています。また、TruSight Tumor 170パネルは、彼らがここで達成 しようとしていることにも最適な選択肢です。プログラムにご参加いただき、ありがとうございます。
TruSight Tumor170の幅広さは、このプログラムの 目標にとって魅力的であったものの1つであるようです。あなたの視点から見て、他に有益な特徴 はありますか？
主な特徴の1つは、パネルが拾い上げることのできる異常の範囲です。明らかに、RNAとDNAの両方を扱うのはここですが、これは他のメカニズムでは簡単に は利用できないことです。一般的に、DNA-seqパネルでは、SNPやインデルなどのゲノム変化を評価しますが、 これはかなり標準的なものですが、ここでは融合について、増幅について見ていきます。このパネルでは、より広範な 異常を評価できます。
現在の 勢い、テクノロジーの進歩、およびAlmacが最近発表した発表を踏まえて、パーソナライズされた医療の実現におけるあなたのビジョンとAlmacの役割を共有していただけますか？
私たちの歴史に戻り、複雑な遺伝子シグネチャや複雑な生物学に焦点を合わせています。Almacは、 その専門知識を活用できる非常に良い立場にあると思います。製薬業界のクライアントは、非常に複雑なバックグラウンドバイオロジーを使用して 、市場での医薬品承認とポジショニングをサポートすることの価値を高く評価できます。Almac Diagnosticsは、これまでに培った専門知識をお客様の利益のために活用できるという点で、これまでで最も強力な立場 にあります。
Almac Diagnosticsの詳細については、www.almacgroup.com/diagnostics。
TruSight Tumor 170アッセイの詳細については、www.illumina.com/TruSightTumor170。
