融合遺伝子を検出し遺伝子発現を測定するためのカスタム化可能なターゲットパネルで、関心のあるターゲットを最大1200含むことが可能です。
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Fusion Panelにより、一回のアッセイで12～1200の遺伝子ターゲットにおける融合遺伝子の検出と遺伝子発現のプロファイリングが可能です。ターゲットパネルは、ウェブベースのアッセイデザインソフトウェアツールであるDesignStudioを使用して、十分な注釈付きの1000以上の融合遺伝子および20,000超のヒトRefSeq遺伝子から設計することができます。
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panelは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応（PCR）に基づくライブラリー調製、イルミナのSequence by Synthesis（SBS）ケミストリー、次世代シーケンサー（NGS）技術、および自動化解析を含む統合されたワークフローの一部です。
| Automation capability | Liquid handling robot(s) |
|---|---|
| Cancer type | Hematologic, Solid tumor |
| システム | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System, NextSeq 500 System |
| 手法 | Custom sequencing, Amplicon sequencing, Targeted RNA sequencing |
| Nucleic acid type | RNA |
| Specialized sample types | Blood, FFPE tissue |
| Species category | ヒト |
| Strand specificity | Non-stranded |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| バリアントクラス | Gene fusions, Transcript variants |
AmpliSeq for Illuminaのライブラリー調製ワークフローには、パネル、ライブラリー調製試薬（Library Plus）およびインデックスが必要です。ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）のサンプル調製、cDNA合成、ライブラリーのノーマライゼーション用の付属製品もご用意しています。
AmpliSeq for Illumina RNA Panelsを使って作業する際は、トータルRNAをcDNAに変換する時にAmpliSeq cDNA Synthesis for Illuminaが必要となります。
AmpliSeq Library Equalizer for Illuminaは、AmpliSeq for Illuminaライブラリー調製法を使用する際、ライブラリーをノーマライズするための使いやすいソリューションです。
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel
PCRアンプリコンのウルトラディープシーケンスにより、目的のゲノム領域を特定した解析が可能です。アンプリコンシーケンスの詳細と包括的なソリューションをご覧ください。
RNAシーケンス（RNA-Seq）により、がんの遺伝子発現とトランスクリプトームの変化を検出し、新しいがん遺伝子転写物を同定します。
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
| Custom Fusion Panel A（+12遺伝子発現ターゲット） | Custom Fusion Panel B（+28遺伝子発現ターゲット） | コールレート | |
|---|---|---|---|
| RNAソース：Seraseq融合遺伝子RNAミックス v3 | |||
| EML4-ALK |
• | • | 100% |
| KIF5B-RET |
• | • | 100% |
| NCOA4-RET |
- | • | 100% |
| CD74-ROS1 |
• | • | 100% |
| SLC34A2-ROS1 | • | • | 100% |
| TPM3-NTRK1 |
• | • | 100% |
| FGFR3-BAIAP2L1 |
• | • | 100% |
| PAX8-PPARG1 |
- | • | 100% |
| FGFR3-TACC3 |
- | - | - |
| ETV6-NTRK3 |
• | • | 100% |
| LMNA-NTRK1 |
- | - | - |
| SLC45A3-BRAF |
• | • | 100% |
| TMPRSS2-ERG |
• | • | 100% |
| EGFR-SEPT14 | • | • | 100% |
| パネルで検出された参照融合遺伝子（予想／観察） |
10/10 | 12/12 |
AmpliSeq™ Custom RNA Fusion Panel for Illumina®
20032798
ターゲットカスタムRNA融合遺伝子パネル。12～1,200個のアンプリコン。反応1,125回に十分に対応。Library PLUSおよびインデックス付きアダプターは別売です。
AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®
20019101
24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®
20019102
96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®
20019103
384ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)
20019104
24サンプルのラベル付けに十分な24インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®
20019105
96サンプルにラベル表示できる96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®
20019106
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®
20019107
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®
20019167
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬とプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)
20031676
イルミナ、セットA、セットB、セットCおよびセットDの4セットのAmpliSeq CDインデックスが含まれます。各セットには96サンプルにラベルを付けるのに十分な96、8 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®
20022654
AmpliSeq for Illumina RNA Panels（AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom RNA PanelまたはCommunity RNA Panelsなど）で作業する場合、全RNAをcDNAに変換するための反応ミックスと酵素ブレンドが含まれます。反応の数はパネルによって異なります（例：AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom Panelについては1キットあたり100反応、AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panelについては1キットあたり200反応）。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®
20019171
AmpliSeq for Illuminaライブラリーをシーケンス用に調製する場合のライブラリーノーマライゼーション用のビーズと試薬が含まれます。
List Price:
Discounts:
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製品名
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単価
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。
腫瘍と免疫系の相互作用に関わる395遺伝子を対象とした標的RNA発現パネル。
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
iSeq 100システム用の試薬は、1チャンネルSBSケミストリーとCMOSテクノロジーを備えたすぐに使えるカートリッジで、シンプルかつ低コストのシーケンスを実現します。
最大1200の関心ゲノムターゲットのシーケンスに最適化されたターゲット化されたカスタムRNA研究パネル。
シーケンス固有のターゲットまたは興味のあるゲノムコンテンツにに最適化されたターゲットカスタムリサーチパネル。
広範囲のがん型との関連が判明している161種のバリアントを調べるためのターゲットDNA／RNA研究パネル。
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