AmpliSeq for Illumina On-Demand Panels

事前検査済みの5,000超もの遺伝子カタログから選択して、カスタムターゲットリシーケンスパネルを作成

コンピューター画面でAmpliseqを確認するサイエンティスト

事前に検証済みの遺伝子コンテンツを用いたDNAまたはRNAパネルの設計

遺伝性がん、原発性免疫不全、難聴、筋ジストロフィーなどの遺伝性疾患研究に関連する5,000以上の遺伝子から選択し、ヒト疾患研究向けのパネル設計を的確にカスタマイズできます。すべての遺伝子は、NextSeq 550 システムで事前に検証されています。

無料のウェブベースツール「DesignStudioアッセイデザインツール」を使用し、最大500の対象遺伝子を追加できます。また、24または96反応分の小分けパックでパネルを注文することができます。

サムネール

AmpliSeq for Illumina製品の主な特長

AmpliSeq for Illumina On-Demand

事前検査済みの5,000以上の遺伝子カタログから選択し、ヒト疾患研究向けのパネル設計を効率的かつ容易にカスタマイズすることができます。

AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel

シーケンス固有のターゲットまたは興味のあるゲノムコンテンツに最適化されたターゲットカスタムリサーチパネル。 

主な特長とメリット

パネル作成がシンプル

使いやすいユーザーインターフェース、ロバストなアルゴリズム、そしてDesignStudioの動的フィードバックにより、オンデマンドパネルを簡単に作成できます。

事前に検証済みのコンテンツ

最適化され、検証済みのコンテンツを活用し、さまざまな遺伝性疾患研究を強力にサポートします。

柔軟なコンテンツ設計

1~500個の遺伝子および24~15,000個のアンプリコンを含むパネルを設計することができます。

合理化されたデータ解析

BaseSpace Sequence Hubを利用したクラウド上の二次解析ワークフロー、またはLocal Run Managerを用いた装置上の二次解析ワークフローを実行できます。

少量インプットサンプルタイプ

ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織のような解析が難しいサンプルでも、最小限のインプット量で高いカバレッジ均一性を実現し、高品質なデータを取得することができます。

迅速なライブラリー調製

わずか1.5時間のハンズオンタイムと最短5時間のワークフローにより、オンターゲットかつ高い均一性を実現した増幅ライブラリーを調製できます。

AmpliSeq for Illuminaオンデマンドパネルの仕組み

AmpliSeq for Illumina On-Demand Panelを作成するには、DesignStudioアッセイデザインツールを使用し、アッセイタイプ、種、サンプルタイプ、最大アンプリコン長などのパラメーターを選択します。次に、対象となる遺伝子または座標を指定してターゲットを追加します。設計結果を受領後、内容を評価し、必要に応じて調整してから、カスタムPCRベースのライブラリー調製アッセイをオーダーします。

シーケンスに先立ち、ターゲットについてマルチプレックスPCR増幅を行い、イルミナの次世代シーケンサー(NGS)システム上でSequence by Synthesis(SBS)ケミストリーを用いてライブラリーを調製します。解析は、クラウド上のDRAGEN AmpliconパイプラインまたはLocal Run Managerを用いて装置上で実施するため、高度なバイオインフォマティクスのリソースがなくても高精度の結果を得ることができます。

サムネール

AmpliSeq for Illuminaオンデマンドパネルのワークフロー

カスタムアッセイデザインサービス

イルミナのコンシェルジュによる設計サポートにより、カバレッジを向上させ、アドオンまたはヒト以外の生物種の設計を実現します。イルミナのコンシェルジュチームが、プロジェクト全体の管理、in silicoカバレッジ評価、設計支援サービスを一貫して実施します。

Research design team in collaboration

AmpliSeq for Illuminaオンデマンドパネルに関するよくある質問

DesignStudioアッセイデザインツールにサインアップまたはログインして、新しい設計を開始してください。あらかじめロードされたリファレンスゲノムを選択し、目的のゲノム領域を追加します。AmpliSeq for Illumina Ready-to-UseまたはCommunity Panelsのコンテンツを活用したい場合、製品マニフェストファイルをDesignStudioツールに直接アップロードし、カスタマイズの起点として利用することができます。詳細はこちら .

統合サンプルバーコードを使用することで、1回のシーケンスランあたり最大96個のサンプルをプールできます。ただし、実際にプールできるサンプル数は、アンプリコン数とカバレッジの望ましい深度によって異なります。DesignStudioアッセイデザインツールには、これらのパラメーターを計算するオンラインツールが搭載されています。

AmpliSeq for Illumina On-Demand Panelsは、ヒト疾患研究における生殖系列解析用にカスタマイズされたパネルで、事前検査済みの5,000以上の遺伝子カタログから選択することができる製品です。一方、AmpliSeq for Illumina Custom Panelsは、ターゲットに応じて完全にパーソナライズされ、最適化されたコンテンツを含むパネルで、生殖系列解析だけでなく体細胞解析にも対応する製品です。独自のターゲットリストから設計を開始できるほか、AmpliSeq for Illumina Ready-to-UseパネルやCommunityパネルを基にカスタマイズすることもできます。

はい。5,000超の利用可能な遺伝子はすべて、NextSeq 550システムで実際にシーケンスランを行っており、検査済みです。これにより、研究に必要なコンテンツを安心して選択することができます。

ザ・ には、DesignStudio Assay Design Toolを使用するためのステップバイステップガイドが含まれています。DesignStudioについてサポートが必要な場合は、イルミナテクニカルサポートにお問い合わせください。ご注文に関してサポートが必要な場合は、営業担当者までお問い合わせください。

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補足資料

アンプリコンシーケンス

PCRアンプリコンのウルトラディープシーケンスを行うことで、1回のアッセイで数百のターゲットゲノム領域をコスト効率よく解析します。

ターゲットリシーケンス

遺伝子プロファイリング研究用に事前に設計されたパネルまたはカスタム設計されたパネルを使用して、特定の遺伝子またはゲノムの関心領域を選択してシーケンスします。

お問い合わせ

AmpliSeq for Illumina製品の詳細については、お気軽にお問い合わせください。