Slow Off-rate Modified Aptamer（SOMAmer）テクノロジー

従来の抗体は、免疫反応を誘発したタンパク質（免疫原性ターゲット）の表面の3次元構造に結合する、大型の親和性試薬（約150 kDa）です。これらは、単一のタンパク質エピトープを認識する細胞培養由来のモノクローナル抗体、あるいは同一タンパク質上の複数のエピトープを認識する動物由来のポリクローナル抗体として、生物学的に産生されます。

一方、SOMAmer試薬は、化学修飾された小型のアプタマー（8～20 kDa）であり、3次元タンパク質構造にも結合します。完全に合成されるため、バッチ間で一貫した性能を示します。また、明確に定義された化学的特性により、非免疫原性ターゲットや、従来は抗体で標的化されていないエピトープにも結合可能です。

これらの特性により、SOMAmer試薬は、従来の抗体ベースのツールに対する、多用途で信頼性の高い代替手法となります。

SOMAmerベースのプロテオミクスは、10-log超のダイナミックレンジとフェムトモーラー感度、スケーラブルなマルチプレックスにより、ハイスループットかつコスト効率の高いワークフローを実現します。いずれも従来手法よりばらつきが少なく、ワークフローを変更することなしに、低存在量のタンパク質を確実に検出できます。このように、SOMAmerベースのプロテオミクスは、大規模かつ広範で信頼性の高いタンパク質測定に適した強力かつ効率的なアプローチです。

一方、質量分析法では、低存在量タンパク質のカバレッジの向上には、通常、追加のサンプル処理ステップが必要となります。

また、抗体ベースのアプローチと比較して、SOMAmerベースのプロテオミクスは、アッセイマルチプレックスを拡張した場合でも、高い再現性（約5%のCV）を一貫して示します。

ワークフローはサンプルから解析まで約2.5日、ハンズオンタイムは4時間未満です。

各SOMAmer試薬は、ターゲットタンパク質への高い親和性結合と遅い解離速度という2つの重要な特性によって特異性を達成します。これらの特性は、試薬固有の化学構造から生じます。

SOMAmer試薬をアッセイで使用する前に、一次検証を行います。一次検証には、プルダウン実験と用量反応アッセイが含まれ、目的のターゲットに選択的に結合することを確認します。さらに、SOMAmer試薬の70%以上が、質量分析法などの直交検証技術を使用して独立した研究者によって生成された、特異性を裏付けるデータを持っています。

SOMAmer試薬は合成試薬であり、一貫して再製造できるため、他のアフィニティベースの方法よりもロット間の一貫性と高い再現性が保証されます。