次世代シーケンサー（NGS）を活用したプロテオミクスサービスは、自社内に体制を構築せずに利用できる実用的な選択肢であり、必要なインフラへの投資を行うことなく、シーケンスとデータ解析の専門知識に即座にアクセスできます。NGSベースのタンパク質シーケンスサービスをアウトソーシングすることにより、高品質で再現性の高い結果を確保しながら、コスト削減、研究期間の短縮とともに、研究の効率的な拡大が可能になります。ハイプレックスプロテオミクスアッセイをNGSのパワーとスケーラビリティと組み合わせることで、1つのサンプルで数千のタンパク質を同時に解析することができ、プロテオミクス研究の発見力が最大限に高まります。さらに、NGSベースのプロテオミクスサービスは、大規模アプリケーションに対応できるよう、コンテンツを柔軟に増やすことができる、拡張性の高いマルチプレックス化を提供します。
NGSベースのプロテオミクスサービスのメリット
SomaSeq Discoveryサービスの概要
SomaSeq Discoveryプロテオミクスサービスは、SomaSeq Discoveryを利用しています。これは、1つのサンプルから、200を超える生物学的パスウェイにわたり、9,500を超えるユニークなヒトタンパク質を検出して定量できるハイスループットNGSアッセイです。SomaSeq Discoveryは、市場最大のNGSベースのプロテオームパネルであり、主要な抗体ベースのアッセイよりも4,000種類多いタンパク質ターゲットを備えています。1SomaSeq Discoveryは、質量分析法や酵素結合免疫吸着測定法（ELISA）などの方法で検証された、オフ速度の遅い修飾アプタマー（SOMAmer）試薬を使用して、NGSの速度と規模で信頼性が高く再現性のある結果を保証します。
SomaSeq Discoveryサービスのハイライト
SomaSeq Discoveryプロテオミクスプロジェクトを信頼できるサービスプロバイダーにアウトソーシングすれば、社内ワークフローを構築する代わりに実用的な代替手段が提供され、NGSベースのプロテオミクス機能と専門知識にすぐにアクセスできるようになります。SomaSeq Discoveryサービスは、一貫性のある品質管理されたデータを使用して発見を加速し、より幅広い生物学的洞察を得るうえできわめて有用です。また、これらのサービスによりデータ解析も簡素化されるため、生物学をより深く理解するためにマルチオミクスを統合するオプションとともに解釈に集中できます。
SomaSeq Discoveryサービスプロバイダーは、小規模なパイロットスタディから大規模な研究イニシアチブまで、幅広い規模のプロジェクトに対応できます。これらのラボでは、高品質なデータの提供に加えて、詳細な品質管理メトリクスと、基本および高度なプロテオミクス分析サービスのサポートも提供し、研究者がサンプルから信頼性の高いデータを確実に受け取れるようにします。SomaSeq Discoveryサービスには、他にも以下のような利点があります。
プロテオミクスサービスプロバイダーへの
アウトソーシング方法
スペシャリストとつながる
お問い合わせフォームを用いて、イルミナのプロテオミクスサービス専門担当者にご相談ください。ご連絡後、イルミナのスペシャリストが、お客様のプロテオミクスのニーズに最適なサービスプロバイダーを紹介します。
プロバイダーとマッチングする
SomaSeq Discoveryサービスプロバイダー
信頼できるSomaSeq Discoveryプロテオミクスサービスプロバイダーの拡大するネットワークをご覧ください。
| サービスプロバイダー | 場所 | 連絡先情報 |
|---|---|---|
| SeqCenter | 米国、ペンシルベニア州 | https://www.seqcenter.com/contact/ |
| TGEN | 米国、アリゾナ州 | soma@tgen.org |
| University of California, Los Angeles - Technology Center for Genomics Bioinformatics | 米国、カリフォルニア州 | sequencing@mednet.ucla.edu |
| University of Colorado Anschutz Medical Campus | 米国、コロラド州 | genomics.core@cuanschutz.edu |
| Washington University - McDonnell Genome Institute | 米国、ミズーリ州 | gtac-mgi-list@email.wustl.edu |
| Genome Quebec | カナダ、ケベック州 | infoservices@genomequebec.com |
| サービスプロバイダー | 場所 | 連絡先情報 |
|---|---|---|
| Genomics Taiwan | 台湾 | https://www.genomics.com.tw/en/contact |
| The University of Sydney - Sydney Mass Spectrometry | オーストラリア、シドニー | mass.spectrometry@sydney.edu.au |
| サービスプロバイダー | 場所 | 連絡先情報 |
|---|---|---|
| CNIC | スペイン | jalopez@cnic.es |
| Genomix4Life | イタリア | maria.ravo@genomix4life.com |
| IAB | チェコ | iabio@iabio.eu |
| LIGAN | フランス | |
| TATAA | スウェーデン | info@tataa.com |
| NGI | スウェーデン | affinity.proteomics-uppsala@scilifelab.uu.se |
/
件
プロセスの概要
以下は、SomaSeq Discoveryサービスプロバイダーと連携する際の一般的なプロセスです。
| 1. コンサルティング | イルミナのスペシャリストにご連絡いただくと、イルミナネットワークを通じて、信頼できるサービスプロバイダーにおつなぎします。この段階では、研究の目標、サンプルの種類、望ましい結果、ターゲットタンパク質パネルやデータ解析のニーズなどの特定の要件について話し合います。 |
| 2. サンプルの提出と受け入れ | プロバイダーより、サンプル調製要件と発送プロトコールについてご案内します。受領したサンプルは記録され、品質の評価を行い、処理の準備が整います。 |
| 3. ライブラリー調製 | Illumina SomaSeq Discoveryライブラリー調製を使用して、サービスプロバイダーがタンパク質サンプルをシーケンス対応のライブラリーに変換します。 |
| 4. シーケンス | ライブラリーは、Illumina NovaSeq XシリーズまたはNovaSeq 6000シーケンシングシステムを使用してシーケンスされ、これによって最大約9,500個の固有のヒトタンパク質を検出できます。シーケンスパラメーターは、プロジェクトの範囲に基づいて最適化されます。 |
| 5. データ解析とQC | サービスプロバイダーは包括的なQCメトリックを提供し、基本的または高度なデータ解析サービスを提供します。これには、お客様の研究課題に合わせたタンパク質定量やバイオインフォマティクスの解釈が含まれる場合があります。 |
| 6. 結果の配信 | 最終的なデータセットは、調査結果を解釈するのに役立つドキュメントとオプションのコンサルティングとともに安全に配信されます。必要に応じて、プロバイダーが他のオミクスデータの統合をサポートする場合もあります。 |
よくある質問（FAQ）
はい。SomaSeq Discoveryサービスプロバイダーはプロジェクトコンサルティングを行っています。プロバイダーとの相談を開始する方法については、このページのフォームにご記入のうえ、お問い合わせください。
はい。サービスプロバイダーはすべてのサンプルのQCメトリクスサービスを提供しています。Illumina Protein Prepサービスの詳細については、このページのフォームにご記入のうえ、お問い合わせください。
多くのプロバイダーが基本的なデータ解析サービスを提供していますが、高度な解析やバイオインフォマティクスをサポートするプロバイダーもあります。サービスプロバイダーの詳細については、このページのフォームにご記入のうえ、お問い合せください。
はい、一部のプロバイダーは、スケーリング前に性能を検証するためのパイロットプロジェクトを受け入れています。プロバイダーによってサービス提供状況は異なります。プロバイダーおよびパイロットプロジェクト割引の可能性の詳細については、このページのフォームにご記入のうえ、お問い合せください。
/
件
SomaSeq Discoveryサービスの提供にご興味をお持ちですか？
SomaSeq Discoveryのサービスプロバイダーとしてネットワークに参加する
SomaSeq Discoveryサービスプロバイダーとしてスタートすると、シーケンステクノロジーのリーダーと提携する信頼できるグループに参加することになります。プロバイダーとして、イルミナのワークフローにアクセスできるだけでなく、可視性、信頼性、成長の機会を提供するグローバルネットワークに参加できます。
サービスプロバイダーとして参加する方法
参考文献
- Olink. Olink Explore HT. https://olink.com/products/olink-explore-ht. Accessed January 28, 2025.