次世代シーケンサー（NGS）を活用したプロテオミクスサービスは、自社で解析基盤を構築することなく利用できる実用的な選択肢です。必要なインフラ投資を行うことなく、シーケンスおよびデータ解析の専門知識をご活用いただけます。NGSベースのタンパク質シーケンスサービスを委託することで、高品質かつ再現性の高い結果を確保しつつ、コストの削減、研究期間の短縮、研究規模の効率的な拡大が実現します。ハイプレックスプロテオミクスアッセイをNGSのパワーとスケーラビリティと組み合わせることで、単一サンプルから数千種類のタンパク質を同時に解析し、プロテオミクス研究の発見力を最大限に引き出すことができます。さらに、NGSベースのプロテオミクスサービスは、大規模アプリケーションにも対応でき、コンテンツを柔軟に増やせる、拡張性の高いマルチプレックス解析を提供します。
NGSベースのプロテオミクスサービスのメリット
SomaSeq Discoveryサービス概要
SomaSeq Discoveryプロテオミクスサービスは、SomaSeq Discoveryを活用したハイスループットNGSアッセイです。単一サンプルから200を超える生物学的パスウェイにわたり、9,500種類を超えるユニークなヒトタンパク質の検出と定量が可能です。市場最大規模のNGSベースのプロテオームパネルであるSomaSeq Discoveryは、主要な抗体ベースアッセイと比較して、4,000種類多いタンパク質ターゲットをカバーしています。1また、質量分析法や酵素結合免疫吸着測定法（ELISA）によって検証された、オフレートの遅い修飾アプタマー（SOMAmer）試薬を採用し、NGSの高い処理能力と規模により、信頼性と再現性に優れた結果を担保します。
SomaSeq Discoveryサービスの特徴
SomaSeq Discoveryプロテオミクスプロジェクトを、信頼できるサービスプロバイダーに委託することで、自社ワークフローを構築することなく、実用的な代替手段が得られ、NGSベースのプロテオミクス機能と専門知識をすぐにご活用いただけます。SomaSeq Discoveryサービスは、一貫した品質管理のもとで得られたデータを提供し、発見の加速と、より幅広い生物学的洞察の獲得を支援します。また、データ解析を簡素化できるため、研究者は結果の解釈に集中するとともに、マルチオミクス解析を統合することで生物学への理解をさらに深めることができます。
SomaSeq Discoveryサービスプロバイダーは、小規模なパイロットスタディから大規模な研究イニシアチブまで、幅広い規模のプロジェクトに対応できます。これらのラボでは、高品質なデータの提供はもちろん、詳細な品質管理メトリクスや、基本的な解析から高度なプロテオミクス解析まで、幅広いサポートを提供しています。これにより、研究者はサンプルから得たデータの信頼性に確信を持って研究を進めることができます。さらに、SomaSeq Discoveryサービスには以下のような利点があります。
プロテオミクスサービスプロバイダーへの
委託方法
スペシャリストとつながる
お問い合わせフォームを用いて、イルミナのプロテオミクスサービス専門担当者にご相談ください。ご連絡後、イルミナのスペシャリストが、お客様のプロテオミクスのニーズに最適なサービスプロバイダーを紹介します。
プロバイダーとマッチングする
SomaSeq Discoveryサービスプロバイダー
信頼できるSomaSeq Discoveryプロテオミクスサービスプロバイダーの拡大するネットワークをご覧ください。
| サービスプロバイダー | 場所 | 連絡先情報 |
|---|---|---|
| SeqCenter | 米国、ペンシルベニア州 | https://www.seqcenter.com/contact/ |
| TGEN | 米国、アリゾナ州 | soma@tgen.org |
| University of California, Los Angeles - Technology Center for Genomics Bioinformatics | 米国、カリフォルニア州 | sequencing@mednet.ucla.edu |
| University of Colorado Anschutz Medical Campus | 米国、コロラド州 | genomics.core@cuanschutz.edu |
| Washington University - McDonnell Genome Institute | 米国、ミズーリ州 | gtac-mgi-list@email.wustl.edu |
| Genome Quebec | カナダ、ケベック州 | infoservices@genomequebec.com |
| サービスプロバイダー | 場所 | 連絡先情報 |
|---|---|---|
| Genomics Taiwan | 台湾 | https://www.genomics.com.tw/en/contact |
| The University of Sydney - Sydney Mass Spectrometry | オーストラリア、シドニー | mass.spectrometry@sydney.edu.au |
| サービスプロバイダー | 場所 | 連絡先情報 |
|---|---|---|
| CNIC | スペイン | jalopez@cnic.es |
| Genomix4Life | イタリア | maria.ravo@genomix4life.com |
| IAB | チェコ | iabio@iabio.eu |
| LIGAN | フランス | |
| TATAA | スウェーデン | info@tataa.com |
| NGI | スウェーデン | affinity.proteomics-uppsala@scilifelab.uu.se |
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プロセスの概要
以下は、SomaSeq Discoveryサービスプロバイダーと連携する際の一般的なプロセスです。
| 1. コンサルティング | イルミナのスペシャリストとご相談の上、イルミナネットワークを通じて信頼できるサービスプロバイダーをご紹介いたします。この段階では、研究目標、サンプルタイプ、期待する成果、ターゲットタンパク質パネル、データ解析のニーズなどの特定の要件について詳細に確認します。 |
| 2. サンプルの提出と受領 | プロバイダーより、サンプル調製要件および発送手順についてご案内します。受領したサンプルは登録後に品質評価を行い、解析に向けて準備を進めます。 |
| 3. ライブラリー調製 | サービスプロバイダーが、Illumina SomaSeq Discoveryライブラリー調製キットを用いて、タンパク質サンプルをシーケンス用ライブラリーに変換します。 |
| 4. シーケンス | ライブラリーは、Illumina NovaSeq XシリーズまたはNovaSeq 6000システムを使用してシーケンスされます。これにより、最大約9,500種類のユニークなヒトタンパク質を検出できます。シーケンスパラメーターは、プロジェクトの要件や規模に応じて最適化されます。 |
| 5. データ解析とQC | サービスプロバイダーは包括的なQCメトリクスを提供するとともに、基本解析から高度なデータ解析まで、幅広いサービスを提供します。これには、お客様の研究目的に応じたタンパク質定量やバイオインフォマティクス解釈が含まれる場合があります。 |
| 6. 結果の納品 | 最終データセットは、結果の解釈に役立つドキュメントと、オプションのコンサルティングサービスとともに安全に納品いたします。また、必要に応じて、他のオミクスデータの統合解析のサポート提供も可能です。 |
よくある質問（FAQ）
はい。SomaSeq Discoveryサービスプロバイダーは、プロジェクトコンサルティングサービスを提供しています。プロバイダーとのご相談をご希望の場合は、このページのフォームにご記入のうえ、お問い合わせください。
はい。サービスプロバイダーはすべてのサンプルのQCメトリクスサービスを提供しています。Illumina Protein Prepサービスの詳細については、このページのフォームにご記入のうえ、お問い合わせください。
多くのプロバイダーが基本的なデータ解析サービスを提供していますが、高度な解析やバイオインフォマティクスをサポートするプロバイダーもあります。サービスプロバイダーの詳細については、このページのフォームにご記入のうえ、お問い合せください。
はい、一部のプロバイダーは、スケーリング前に性能を検証するためのパイロットプロジェクトを受け入れています。プロバイダーによってサービス提供状況は異なります。プロバイダーおよびパイロットプロジェクト割引の可能性の詳細については、このページのフォームにご記入のうえ、お問い合せください。
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SomaSeq Discoveryサービスプロバイダーになることで、シーケンステクノロジーのリーダーであるイルミナと連携する、信頼のパートナーコミュニティに参加できます。イルミナのワークフローへのアクセスに加え、グローバルネットワークを通じ認知度と信頼性を高めるとともに、事業成長につながる新たな機会を得ることができます。
サービスプロバイダーになるには
参考文献
- Olink. Olink Explore HT. https://olink.com/products/olink-explore-ht. Accessed January 28, 2025.