Illumina StrataMap Spatialソリューションを使用して、空間的な位置関係に基づく遺伝子発現パターンを探索
このデモデータセットは、StrataMap Spatial Transcriptomeが組織構造を維持した状態で遺伝子発現の位置をどのように明らかにし、分子データと細胞の空間的な位置関係を大規模に結び付けるかを示しています。
これらのデータは、StrataMap Spatial Transcriptomeで処理し、NovaSeq X Plusシステムでシーケンスを行い、DRAGEN二次解析とIllumina Connected Multiomicsで解析したマウス腎臓切片を用いて、イルミナの空間解析ソリューション全体の性能を示しています。
空間実験を設計する研究者にとって、このデータはラン前の細胞セグメンテーションの精度、遺伝子検出深度、リードマッピングの品質を評価するための具体的な基準点となります。
正常マウス腎臓（新鮮凍結）
C57BL/6マウス系統
8週齢雄
10 µmセクション
H&E染色済み
Keyence BZX-810蛍光顕微鏡を用いて20倍でイメージング
イルミナの空間解析用基質で処理したサンプル
NovaSeq X Plusシステムでシーケンス
100サイクル、25Bフローセル
1 × 130 + 8 bpリード長
データは、DRAGEN Spatial Transcriptome v1.1.6を使用してIllumina Connected Analyticsを介して処理されました。三次解析のためにIllumina Connected Multiomicsで処理されたデータ。
Go beyond the topline metrics. Request a demo of Illumina Connected Multiomics to explore this mouse kidney data set alongside spatial, single-cell, proteomics, and more.
データについてご質問がありますか？あるいは、ご自身で空間トランスクリプトミクス実験を計画する準備はできていますか？ ワークフローの適合性の評価から導入までサポートいたしますので、お気軽にご相談ください。