リード長とは？
シーケンスリード長は、シーケンスされた各DNA断片の長さ、および片端または両端からシーケンスされるかどうかを示すものです。たとえば、2 x 150 bpランでは、各DNA断片に対し、150塩基対の2つのリード（フォワードとリバース）が生成されます。長いリード長は、DNA配列内の繰り返し部分をまたぐ確率が高いため、短いリード長よりも好まれます。
iSeq 100シーケンスシステムの仕様
小さなパッケージで大きな利点
シンプルでコンパクトなベンチトップシーケンスシステムで、高精度データ、高速なランタイム、最大出力1.2 Gbを実現
あらゆるラボ、あらゆる場所で
比類なきシンプルさと驚異的なスピードでNGSにアクセス
様々なリード長用フローセル当たりのアウトプットa
iSeq 100シーケンスシステム
| リード長 | iSeq 100 i1 Reagent v2 |
|---|---|
| 1 × 36 bp | 144 Mb |
| 1 × 50 bp | 200 Mb |
| 1 × 75 bp | 300 Mb |
| 2 × 75 bp | 600 Mb |
| 2 x 150 bp | 1.2 Gb |
a. サポートされているクラスター密度（フィルターを通過する174～200 k/mm2のクラスター）でのイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく仕様。
主要アプリケーションの予サンプルスループット予測a
iSeq 100シーケンスシステム
| アプリケーション | iSeq 100 i1 Reagent v2b |
|---|---|
ランごとの小さなゲノムシーケンス 5～10 Mbゲノム、30×カバレッジ、2 × 150 bp |
1～8 |
ランごとのターゲット遺伝子発現プロファイリング 最大500ターゲット、1 × 50 bp |
1～48 |
ランごとのターゲットアンプリコンシーケンス 最大3000アンプリコン、2 × 150 bp |
1～48 |
a. すべてのサンプルスループットは推定値であり、単一のフローセルの実行に基づいています。
b. iSeq 100 i1 Reagent v2を使用したランあたりのサンプル数。
フローセルあたりのパスフィルターリード数a
パスフィルターリードとは何ですか？
フィルターを通過するクラスターの割合で、各パスフィルタークラスターはリード（シングルエンドリード）または2リード（ペアエンドリード）を提供します。
iSeq 100シーケンスシステム
| iSeq 100 i1 Reagent v2 | |
|---|---|
| シングルエンドリード | 4M |
| ペアエンドリード | 8M |
a. サポートされているクラスター密度（フィルターを通過する174～200 k/mm2のクラスター）でのイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく仕様。
クオリティスコアa
クオリティスコアとは？
クオリティスコアまたはQスコアとは、ベースコーリングにおけるエラーの発生率の予測です。Qスコアが高いほど、エラーが起きる確率が低いことを示します。クオリティスコアが30なら、エラー率は1000分の1で、対応するコール精度は99.9%です。
iSeq 100シーケンスシステム
| リード長 | iSeq 100 i1 Reagent v2 |
|---|---|
| 1 × 36 bp | Q30以上の塩基が85%超 |
| 1 × 50 bp | Q30以上の塩基が85%超 |
| 1 × 75 bp | Q30以上の塩基が80%超 |
| 2 × 75 bp | Q30以上の塩基が80%超 |
| 2 x 150 bp | Q30以上の塩基が80%超 |
a. Q30超の塩基のパーセンテージは全体のランの平均です。
ランタイムa
iSeq 100シーケンスシステム
| リード長 | iSeq 100 i1 Reagent v2 |
|---|---|
| 1 × 36 bp | 9.5時間 |
| 1 × 50 bp | 10時間 |
| 1 × 75 bp | 11時間 |
| 2 × 75 bp | 14時間 |
| 2 x 150 bp | 19時間 |
a. 合計時間には、iSeq 100 システムでのクラスター形成、シーケンス、およびベースコーリングが含まれます。
装置の仕様
iSeq 100 装置の仕様
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発光ダイオード（LED）
波長520 nm
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寸法
W × D × H30.5 cm × 33 cm × 42.5 cm（12.0インチ × 13.0インチ × 16.7インチ）
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本体重量
16 kg（35ポンド）
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梱包重量
21 kg（47ポンド）
主要なテクノロジー
Sequence by Synthesis（SBS）ケミストリー
iSeq 100システムでは、イルミナの実績あるSBSテクノロジーを採用しているため、さまざまなアプリケーションで傑出した高品質かつ高精度、ロバストな性能なデータが得られます。SBS法は、可逆的ターミネーター蛍光標識ヌクレオチドを使用して、成長するDNA鎖に取り込まれる塩基を検出し、何十億もの配列を並行して読み取ります。
iSeq 100 システム、イルミナのSBSケミストリーと相補的な金属酸化膜半導体（CMOS）テクノロジーを組み合わせ、1チャネルのSBSケミストリーを実現します。CMOSチップ上の1チャネルのSBSケミストリーは、正確なデータを提供しながら、装置のコストを削減し、ベンチトップの設置面積を小さくするのに役立ちます。
シーケンス仕様の理解
シーケンスクオリティスコアは、ベースコールの不確実性、またはベースコールが間違っている可能性の尺度です。クオリティスコアとシーケンスランにおけるその意味を理解する。
シーケンスカバレッジはアプリケーションごとに要件が異なります。望ましい次世代シーケンサー（NGS）カバレッジレベルを推定し、達成する方法をご覧ください。
ペアエンドランは、再配列や新規転写産物などの解析を容易にするために、DNA末端の両方をシーケンスします。シングルエンドランは経済的な代替品となります。これらのシーケンスリードタイプの主な違いの詳細をご覧ください。