リード長とは何ですか？
シーケンスリード長は、シーケンスされた各DNA断片の長さ、および片端または両端からシーケンスされるかどうかを示します。たとえば、2 × 150 bpランでは、各DNA断片に対して150塩基対の2つのリード（フォワードとリバース）が生成されます。リード長が長いほど、DNAシーケンスのリピートにまたがる可能性が高くなります。
iSeq 100シーケンスシステムの仕様
小さなパッケージで大きな利点
シンプルでコンパクトなベンチトップシーケンスシステムで、高精度データ、高速なランタイム、最大出力1.2 Gbを実現
様々なリード長用フローセル当たりのアウトプットa
iSeq 100シーケンスシステム
| リード長 | iSeq 100 i1 Reagent v2 |
|---|---|
| 1 × 36 bp | 144 Mb |
| 1 × 50 bp | 200 Mb |
| 1 × 75 bp | 300 Mb |
| 2 × 75 bp | 600 Mb |
| 2 × 150 bp | 1.2 Gb |
a. サポートされているクラスター密度（フィルターを通過する174～200 k/mm2クラスター）でのイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく仕様。
主要なアプリケーションにおけるサンプルスループットの推定値a
iSeq 100シーケンスシステム
| アプリケーション | iSeq 100 i1 Reagent v2b |
|---|---|
ランごとの小さなゲノムシーケンス 5～10 Mbゲノム、30×カバレッジ、2 × 150 bp |
1～8 |
ランごとのターゲット遺伝子発現プロファイリング 最大500ターゲット、1 × 50 bp |
1～48 |
ランごとのターゲットアンプリコンシーケンス 最大3000アンプリコン、2 × 150 bp |
1～48 |
a. すべてのサンプルスループットは推定値であり、シングルフローセルランに基づいています。
b. iSeq 100 i1 Reagent v2を使用したランあたりのサンプル数。
フローセルごとのパスフィルターの読み取りa
フィルターを通過するリードとは何ですか？
各パスフィルタークラスターがリード（シングルエンドリード）または2リード（ペアエンドリード）を提供する、シャスティティフィルターを通過するクラスターの割合。
iSeq 100シーケンスシステム
| iSeq 100 i1 Reagent v2 | |
|---|---|
| シングルエンドリード | 4M |
| ペアエンドリード | 8M |
a. サポートされているクラスター密度（フィルターを通過する174～200 k/mm2クラスター）でのイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく仕様。
クオリティスコアa
クオリティスコアとは何ですか？
クオリティスコア、つまりQスコアは、ベースコーリングにおけるエラーの可能性の予測です。Qスコアが高いほど、エラーの確率が低くなります。品質スコア30は、エラー率が1000分の1で、対応するコール精度は99.9%です。
iSeq 100シーケンスシステム
| リード長 | iSeq 100 i1 Reagent v2 |
|---|---|
| 1 × 36 bp | > Q30より高い塩基の85% |
| 1 × 50 bp | > Q30より高い塩基の85% |
| 1 × 75 bp | > Q30より高い塩基の80% |
| 2 × 75 bp | > Q30より高い塩基の80% |
| 2 × 150 bp | > Q30より高い塩基の80% |
a. Q30超の塩基のパーセンテージは全体のランの平均です。
ランタイムa
iSeq 100シーケンスシステム
| リード長 | iSeq 100 i1 Reagent v2 |
|---|---|
| 1 × 36 bp | 9.5時間 |
| 1 × 50 bp | 10時間 |
| 1 × 75 bp | 11時間 |
| 2 × 75 bp | 14時間 |
| 2 × 150 bp | 19時間 |
a. 合計時間には、iSeq 100 システムクラスター生成、シーケンス、およびベースコーリングが含まれます。
装置の仕様
iSeq 100装置の仕様
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発光ダイオード（LED）
波長520 nm
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寸法
幅 × 奥行 × 高さ30.5 cm × 33 cm × 42.5 cm 12.0 in × 13.0 in × 16.7 in
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乾燥重量
16 kg（35 lb）
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木枠重量
21 kg（47 lb）
主要なテクノロジー
Sequence by Synthesis（SBS）ケミストリー
iSeq 100 システム、実績のあるイルミナのSequencing by Synthesis（SBS）ケミストリーを利用して、幅広いアプリケーションに高精度のデータと堅牢な性能を提供します。SBS法は、可逆的ターミネーター蛍光標識ヌクレオチドを使用して、成長するDNA鎖に取り込まれる塩基を検出し、何十億もの配列を並行して読み取ります。
iSeq 100 システム、イルミナのSBSケミストリーと相補的な金属酸化物半導体（CMOS）テクノロジーを組み合わせ、1チャネルのSBSケミストリーを実現します。CMOSチップ上の1チャネルSBSケミストリーは、正確なデータを提供しながら、装置のコストを削減し、ベンチトップの設置面積を小さくするのに役立ちます。
シーケンス仕様の理解
シーケンスクオリティスコアは、ベースコールの不確実性、またはベースコールが間違っている可能性の尺度です。クオリティスコアと、シーケンスランにおけるクオリティスコアの意味を理解する。
シーケンスカバレッジはアプリケーションごとに要件が異なります。望ましい次世代シーケンサー（NGS）カバレッジレベルを推定し、達成する方法をご覧ください。
ペアエンドランは、再配列や新規転写産物などの解析を容易にするために、両方のDNA末端をシーケンスします。シングルエンドランは経済的な代替手段となります。これらのシーケンスリードタイプの主な違いの詳細をご覧ください。