所定の塩基Qのシーケンスにおけるクオリティスコアは、以下の式で定義されます。
Q = -10log10(e)
ここで、eはベースコールが間違っている確率の推定値です。
クオリティスコアが20(Q20)の場合、エラー率は1/100(100 bpのシーケンスリードごとにエラーが1回発生する可能性がある)であり、対応するコール精度は99%です。
シーケンス品質がQ30に達すると、事実上すべてのリードが完全で、エラーや曖昧さはありません。そのため、Q30は次世代シーケンサー(NGS)の品質に関するベンチマークと見なされています。
クオリティスコア | 不正確なベースコールの確度 | 推定されるベースコール精度 |
---|---|---|
10(Q10) | 1/10 | 90% |
20(Q20) | 1/100 | 99% |
30 (Q30) | 1/1000 | 99.9% |
イルミナのシーケンスケミストリーは、大多数の塩基のスコアがQ30以上となる高精度を実現します。この精度レベルは、臨床研究を含む幅広いシーケンスアプリケーションにとって最適です。
シーケンスにおけるクオリティスコアの詳細については、以下のテクニカルノートをお読みください。
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