SBSテクノロジーの利点
堅牢な性能とデータ品質
Illumina sequencing by synthesis（SBS）は、世界中のシーケンスデータの生成を担う次世代シーケンス（NGS）テクノロジーです。 SBSケミストリーは、エラーのないリードの最高の収量1を実現し、ゲノム全体の堅牢な塩基コールを可能にします。イルミナSBSテクノロジーの品質と性能の利点は、結果に自信を与えます。
実績のあるベースコーリング精度
SBSケミストリーは、単一塩基の伸長とヌクレオチドの競合的付加を使用して、非常に正確なシーケンスを実現します。SBSは、Q30を超えるシーケンス塩基の割合が最も高く、塩基が誤って呼び出された確率が0.1%であることを示す品質スコアです。この実績のある精度は、主要なNGSプラットフォームの中で、誤検出、誤検出、およびミスコールを最小限に抑え、プロジェクト効率を向上させます。2
ゲノム全体にわたる偏りのないカバレッジ
最適化されたSBS試薬は、反復的またはGCリッチなスパンなど、シーケンスが難しいゲノム領域でも均一なカバレッジと精度を保証します。SBSは塩基ごとの可逆的ターミネーターケミストリーを使用し、イオンセミコンダクターやピロシーケンス技術で見られるホモポリマーエラーを事実上排除します。SBSはハイブリダイゼーションやライゲーションベースのケミストリーで見られる高いGCバイアスも回避します。2
ペアエンドシーケンスによる高品質のアライメント
SBSではペアエンドシーケンスが可能です。両端からDNAライブラリー断片をシーケンスし、高品質のシーケンスデータを生成します。各リードペア間の距離は既知であるため、ペアエンドシーケンスはアライメントとゲノムアセンブリを向上させます。リードペアとしてアライメントされたシーケンスにより、構造バリアント、遺伝子融合、転写アイソフォームの正確な検出が可能になります。
タッチパネル式インフォマティクス
BaseSpace Sequence Hubは、バイオインフォマティクスの経験の有無にかかわらず、どのような研究者でもNGSデータ解析を行えるユーザーフレンドリーなツールです。
BaseSpaceの詳細はこちらあらゆるスループットやスケールでコスト効率が高い
SBS試薬、光学系、フローセルのイノベーションにより、イルミナシーケンサーの能力がさらに向上しました。最近の進歩の例を以下に示します。
- 2チャネルSBSの高速な画像検出とデータ処理により、ロースループットのアプリケーションでもNGSのコスト効率が向上します。
- パターン化フローセルテクノロジーは、1,000ドルのヒトゲノムを可能にする超高スループットとスケールでシーケンスを強化します。
- 1チャネルSBS、またはイルミナの半導体シーケンス法は、SBSとCMOSテクノロジーを組み合わせることで、iSeq 100システムの装置コストを削減し、NGSを簡素化します。
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参考文献
- 業界をリードするNGSプラットフォームの上位3つの比較に基づく。社内計算データ Illumina, Inc. 2016.
- Ross MG, Russ C, Costello M, et al. シーケンスデータにおけるバイアスの特性解析と測定。Gen Biol 2013;14:R51