Sequence by Synthesis(SBS)テクノロジー

SBSテクノロジーのご紹介

SBSテクノロジーのご紹介

Sequencing by Synthesis(SBS)はイルミナのシーケンステクノロジーであり、世界中で広く採用されている次世代シーケンス(NGS)テクノロジーです。イルミナの装置と試薬は、超並列機能で成長中のDNA鎖に取り込まれる単一塩基を検出する独自の手法を使用しています。最新のイルミナSBSテクノロジーであるXLEAP-SBSケミストリーは、これまでで最速、最高品質、最もロバストなSBSケミストリーであり、マーケットをリードするシーケンサーでワークフローを合理化できます。 

SBSケミストリー

各dNTPを追加するたびに、蛍光ラベル付きの可逆的ターミネーターの蛍光がデータ化され、そして次の塩基を取り込めるように切断されます。可逆的ターミネーターに結合した4種類すべてのdNTPがそれぞれのシーケンスサイクルに存在しているため、自然競合によって取り込みバイアスが最小化されます。1

結果として真の塩基ごとのシーケンスを実現できるため、幅広いアプリケーション向けに正確なデータを入手することができます。この手法では事実上、一連の反復的なヌクレオチド(ホモポリマー)に付随するエラーやコールの見逃しを回避することができます。

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SBSテクノロジーのその他の利点

イルミナのSequence by Synthesis(SBS)テクノロジーは、シングルリードとペアエンドライブラリーの両方をサポートしています。SBSテクノロジーは高解像度のゲノムシーケンス用に、ショートインサートのペアエンドに加えて、効率的なシーケンスアセンブルやde novoシーケンスなどに対してロングインサートのペアエンドリードを提供しています。

ショートインサートとロングリードの組み合わせによりあらゆるゲノムの特徴を完全にとらえることができます。

ペアエンドシーケンスについて

次世代シーケンサー(NGS)eBookの紹介

NGSを初めてご利用になる方は、包括的かつ分かりやすいガイドのダウンロードから始めましょう。このステップバイステップのガイドでは、NGS法、ワークフロー、データ解析ソリューションなどについて説明しています。

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XLEAP-SBSケミストリーによりスピードと信頼性が向上

XLEAP-SBSケミストリーは、スピードの向上、信頼性の向上、堅牢性の向上のために設計された、根本的に高度なSBSケミストリーを提供します。XLEAP-SBSケミストリーは、取り込み速度が最大2倍、精度が最大3倍であり、リードが長くなるように設計されているため、これまで以上に多くのシーケンス機能を利用することができます。2 XLEAP-SBSケミストリーは、現在、以下のプラットフォームで利用できます。

 

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MiniSeqシステム

シーケンスシステムのポートフォリオ

イルミナは革新的なシーケンスシステムを提供して、必要な規模に応じた優れたデータ品質と正確性を提供します。

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1チャネルSBS

SBSテクノロジーのブレークスルー

1色法SBS

イルミナ半導体シーケンス法は、1色法SBSともいわれており、イルミナSBSケミストリーと補完的な金属酸化膜半導体(CMOS)テクノロジーを組み合わせたものです。これによってSBSのデータの正確さは維持しながら、機器のコストと機器設置面積を小さくすることが可能です。

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2色法SBS

SBSの最新の進化形である2色法SBSは、データを高精度に保ちながら、以前のバージョンのイルミナSBSよりもデータを速く生成できます。

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参考文献
  1. Bentley DR, Balasubramanian S, Swerdlow HP, et al. Accurate Whole Human Genome Sequencing using Reversible Terminator Chemistry. Nature. 2008;456(7218):53–59. doi:10.1038/nature07517
  2. 標準的なイルミナSBSケミストリーとの比較。