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AmpliSeq for Illumina BRCA Panel

BRCA1とBRCA2における、体細胞および生殖細胞系列バリアントを調査するターゲット化した研究パネル

5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない）

アッセイ時間

<1.5時間

ハンズオンタイム

1～100 ng、プールあたり10 ngを推奨

インプット量

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概要

AmpliSeq for Illumina  BRCA Panelは、BRCA1およびBRCA  BRCA2 遺伝子全体の体細胞および生殖細胞系列バリアントの研究のためのターゲットリシーケンスアッセイです。  

主な特長

  • 関連遺伝子コンテンツ - すべてのエクソン領域と、BRCA BRCA1 2の隣接イントロン配列を ターゲットにします BRCA2

  • 迅速で合理化されたワークフロー - わずか1 ngの高品質サンプルまたは10 ngのホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）インプットサンプルから、1日でシーケンス対応ライブラリーを 調製

  • 正確なデータ - ローカル解析またはクラウドベース解析を使用して、5%のバリアントアリル頻度の低い体細胞変異 を検出

 BRCA パネルは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応（PCR）ベースのライブラリー調製、イルミナの合成によるシーケンス（SBS）次世代シーケンス（NGS）テクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です。

BRCA1 および BRCA2 はヒトの腫瘍抑制遺伝子であり、特定の変異を担持する場合、乳がんや卵巣がんのリスク増加に関与しています。このすぐに使えるパネルは、研究者がターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化を行う時間と労力を節約します。

AmpliSeq for Illuminaの詳細はこちら

仕様

アッセイ時間 5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない）
Cancer type Solid tumor
コンテンツ仕様 BRCA1および BRCA2のエクソン領域と隣接するイントロン配列
説明 BRCA1および BRCA2の生殖細胞系および体細胞解析研究。
ハンズオンタイム <1.5時間
インプット量 1～100 ng、プールあたり10 ngを推奨
システム MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム
作用機序 マルチプレックスPCR法
手法 Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing
マルチプレックス 96のデュアルインデックスの組み合わせ
Nucleic acid type DNA
アンプリコン数 合計265（2プール） （プール1：132アンプリコン。プール2：133アンプリコン）
サンプルタイプ Blood, FFPE tissue
Species category ヒト
テクノロジー イルミナシーケンサー
バリアントクラス Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels)

必要な製品

AmpliSeq for Illumina  BRCA Panelワークフローには、 BRCA Panel、Library PLUSキット、インデックスアダプターが必要です。

/ 結果

アプリケーション

ワークフローの例

1
ライブラリー調製

AmpliSeq for Illumina  BRCA パネル

2
シーケンス
3
解析

プロジェクトの推奨事項

装置 Recommended number of samples Read length
iSeq 100 System

12 samples per run (assumes minimum coverage of 500×)
96 samples per run (assumes minimum coverage of 50x)

2 × 150 bp
2 × 150 bp
MiniSeq System

Samples per run: mid output: 24, high output: 80 (assumes minimum coverage of 500×)

2 × 150 bp
MiSeq System

Samples per run at 500x minimum coverage (by reagent kit version): v2 nano: 3, v2 micro: 12, v2: 48, v3: 80
Samples per run at 50x minimum coverage (by reagent kit version): v2 nano: 32, v2 micro: 96

2 × 150 bp
2 × 150 bp

関連するアプリケーションとメソッド

ターゲットリシーケンス

ターゲットリシーケンスでは、遺伝子のサブセットまたはゲノム領域を単離しシーケンスすることで、ラボのリソースを節約できます。

病理学とがんの臨床研究

私たちのがん臨床研究ソリューションでは、正確なゲノム情報を提供しており、研究所では複数の遺伝子を1回の試験で解析できます。

ドキュメント

製品資料
  • アプリケーションノート PDF < 1 MB
    5 バージョン
サポートドキュメント

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AmpliSeq for Illumina BRCA Panel TruSight Cancer
アッセイ時間 5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） 1.5日
Cancer type Solid tumor Pan-cancer
コンテンツ仕様 BRCA1および BRCA2のエクソン領域と隣接するイントロン配列 一般的ながんおよびまれながんに関連する94の遺伝子と284のSNPを濃縮する固定プローブセット。
説明 BRCA1および BRCA2の生殖細胞系および体細胞解析研究。 一般的および稀ながんの生殖細胞変異検出研究。
ハンズオンタイム <1.5時間 5時間
インプット量 1～100 ng、プールあたり10 ngを推奨 DNA 50 ng
システム MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 500 Desktop Sequencer
作用機序 マルチプレックスPCR法
手法 Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing Targeted DNA sequencing, Target enrichment
マルチプレックス 96のデュアルインデックスの組み合わせ 最大96プレックス
Nucleic acid type DNA DNA
アンプリコン数 合計265（2プール） （プール1：132アンプリコン。プール2：133アンプリコン）
サンプルタイプ Blood, FFPE tissue Not FFPE-compatible, Not FFPE-compatible
Species category ヒト ヒト
テクノロジー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー
バリアントクラス Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels) Germline variants

選択ツール：

ライブラリー調製とアレイキットセレクター

ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。

パネル (1)

AmpliSeq™ BRCA Panel for Illumina®

20019168

BRCA1およびBRCA2遺伝子のすべてのエクソンを評価するターゲットパネル。キットには24の反応が含まれます。Library PLUSとインデックスは別売りです。

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ライブラリー調製 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

384ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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インデックスアダプター (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

24サンプルのラベル付けに十分な24インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

96サンプルにラベル表示できる96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬とプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

イルミナ、セットA、セットB、セットCおよびセットDの4セットのAmpliSeq CDインデックスが含まれます。各セットには96サンプルにラベルを付けるのに十分な96、8 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。

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アクセサリー製品 (2)

AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

AmpliSeq for Illuminaプロトコールを使用したライブラリー構築のために、非染色スライドマウントFFPE組織からDNAを調製するための24の反応を含み、脱パラフィンやDNA精製は必要ありません。

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

AmpliSeq for Illuminaライブラリーをシーケンス用に調製する場合のライブラリーノーマライゼーション用のビーズと試薬が含まれます。

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NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

TruSight Hereditary Cancer Panel

遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。

iSeq 100 Reagents

iSeq 100システム用の試薬は、1チャンネルSBSケミストリーとCMOSテクノロジーを備えたすぐに使えるカートリッジで、シンプルかつ低コストのシーケンスを実現します。

AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel

シーケンス固有のターゲットまたは興味のあるゲノムコンテンツにに最適化されたターゲットカスタムリサーチパネル。

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