Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24

本研究用マイクロアレイを用いることで、ヒトゲノムの構造的バリエーションの検出や、体質性疾患およびがんにおける細胞遺伝学的変化の解析が可能です。

概要

Infinium Global Screening Array-24 with Cytogenetics-24には約70万のバリアントが含まれており、その中には4,800を超える階層化遺伝子および既知の疾患関連性領域をターゲットとする8万の補助プローブが含まれます。ターゲットバリアントは、細胞遺伝学研究コンソーシアムの見解に基づき選定されており、現行のアッセイに求められる強化されたバックボーンとともに、ClinGenにより病原性および病原性の可能性があると定義された遺伝子も含まれています。

  • 重複、欠失、増幅、コピー数中立的なヘテロ接合性欠失、モザイク現象など、ヒトゲノムの構造的バリエーションを検出します

  • 体質性疾患、がんなどの細胞ゲノムの変化を調べます

  • ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)フリーのInfinium HTSアッセイを使用して、サンプルあたりわずか200 ngのDNAで、唾液、血液、口腔粘膜スワブなどの複数のサンプルタイプを処理します

  • 適切なFFPEクラスターファイルとともに使用する場合、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)ペア腫瘍/正常サンプルを解析します

幅広い臨床研究アプリケーション

マーカーは、リスクプロファイリング、ファーマコゲノミクス、健康特性評価、疾患発見を含む研究アプリケーションのために、ClinVar、CPIC、PharmGKBなどの臨床研究データベースから選定されています。

仕様

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関連するアプリケーションと手法

製品比較

Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24 Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8
アッセイ時間 3日 3日
自動化機能 自動化アレイローダー, Liquid handling robot(s) 自動化アレイローダー, Liquid handling robot(s)
がんの種類 血液学, 固形腫瘍 血液学, 固形腫瘍
説明 24サンプルのInfinium Global Screening Array with Cytogenetics-24は、ゲノム全体で4,800を超える重要な遺伝子をターゲットとしています。BeadChipには約70万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能2.5 Mbを提供します。 8サンプルのInfinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8は、ゲノム全体で4,800を超える主要な遺伝子を広範囲にターゲットとしています。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。
ハンズオンタイム 8ビーズチップワークフローの自動化に1時間5分 8ビーズチップワークフローの自動化に1時間5分
インプット量 200 ng 200 ng
システム iScan iScan
手法 ハイスループットジェノタイピングアレイ, 細胞遺伝学アレイ 細胞遺伝学アレイ, ゲノムワイドジェノタイピングアレイ
核酸の種類 DNA DNA
サンプル数 24サンプル (1アレイあたり) アレイあたり8サンプル
対応サンプルタイプ 血液, FFPE組織, 口腔スワブ, 唾液 血液, FFPE組織, 口腔スワブ, 唾液
生物種カテゴリー ヒト ヒト
テクノロジー マイクロアレイ マイクロアレイ
バリアントクラス 1塩基変異多型(SNP), ヘテロ接合性欠失(LOH), 染色体変異, コピー数バリアント(CNV) 1塩基変異多型(SNP), ヘテロ接合性欠失(LOH), 染色体変異, コピー数バリアント(CNV)

Infinium Global Screening Array with Cytogenetics (24 Samples)

20122862

Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24, 24 Samples Kitは、汎用性の高いゲノムワイドバックボーンと高度な細胞遺伝学的解析のための最適化されたコンテンツの組み合わせです。各BeadChipアッセイで合計~70万のバリアントが測定されます。各キットには、1 BeadChipと、24サンプルの増幅、断片化、ハイブリダイゼーション、標識、検出に必要な試薬が含まれています。

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Infinium GSACyto-24 v1.0 Kit, 48 samples (includes array and consumables)

20066469

Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24, 48 Samples Kitは、汎用性の高いゲノムワイドバックボーンと高度な細胞遺伝学的解析のための最適化されたコンテンツの組み合わせです。各BeadChipアッセイで合計~70万のバリアントが測定されます。各キットには、2 BeadChipと、48 DNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイゼーション、標識、検出に必要な試薬が含まれています。

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Infinium GSACyto-24 v1.0 Kit, 288 samples (includes array and consumables)

20066470

Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24, 288 Samples Kitは、汎用性の高いゲノムワイドバックボーンと高度な細胞遺伝学的解析のための最適化されたコンテンツの組み合わせです。各BeadChipアッセイで合計~70万のバリアントが測定されます。各キットには、12 BeadChipと、288 DNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、標識、検出に必要な試薬が含まれています。

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Infinium GSACyto-24 v1.0 Kit, 1152 samples (includes array and consumables)

20066471

Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24, 1152 Samples Kitは、汎用性の高いゲノムワイドバックボーンと高度な細胞遺伝学的解析のための最適化されたコンテンツを組み合わせています。各BeadChipアッセイで合計~70万のバリアントが測定されます。キットには、48 BeadChipと、1152 DNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、標識、検出に必要な試薬が含まれています。

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サービス (2)

Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

20015273

Infiniumプロトコルの必須ステップを習得していただくための、お客様の施設での3日間のハンズオンの指導。サンプルとBeadChipの調製、iScanシステムを使用したサンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データの評価と解析などのハンズオン指導が受けられるコースです。

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ILMN Microarray Analytics ICA Training

20081935

Illumina Connected Analytics(ICA)を使用したIlluminaアレイクラウド解析のトレーニングには、ICA上のプライベートドメインの登録と管理、iScanでのスキャン時のICAへのデータ送信、BaseSpaceシーケンスハブ(BSSH)を使用したデータの解析に関するオンボーディングサポートとトレーニングが含まれます。この1時間のトレーニングは、バーチャルでも、他の対面トレーニングと組み合わせることもでき、各種分析タイプに適用されます。

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ソフトウェアおよびインフォマティクス (2)

ICA Basic Annual Subscription

20044874

Illumina Connected Analytics (ICA) Basic Annual Subscription。この製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、パッケージ化された解析ツールへのアクセスなど、ICA Basicへの1年間のアクセスが含まれています。

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Illumina Analytics - 1 iCredit

20042038

iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。

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NovaSeq Xシリーズのご購入

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。

TruSight Oncology 500 v2

FFPE組織から、すべての主要バリアントクラスに加え、重要なバイオマーカー(TMB、MSI、HRD)を網羅する大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現します。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。

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