Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24

この研究マイクロアレイにより、ヒトゲノムの構造的変異を検出し、体質性疾患やがんにおける細胞ゲノムの変化を調べます。

概要

Infinium Global Screening Array-24 with Cytogenetics-24には約70万のバリアントが含まれ、これには、4,800を超える階層化遺伝子および既知の疾患関連性領域をターゲットとする8万の補助プローブが含まれます。ターゲットバリアントは、細胞遺伝学研究コンソーシアムからの意見に基づき選択され、現代の最新のアッセイに必要な強化されたバックボーンとともに、病原性および病原性の可能性としてClinGenによって定義された遺伝子を含んでいます。

  • 重複、欠失、増幅、コピー数中立的なヘテロ接合性欠失、モザイク現象など、ヒトゲノムの構造的変異を検出します

  • 体質性疾患、がんなどの細胞ゲノムの変化を調べます

  • ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)フリーのInfinium HTSアッセイを使用して、サンプルあたりわずか200 ngのDNAで、唾液、血液、口腔粘膜スワブなどの複数のサンプルタイプを処理します

  • 適切なFFPEクラスターファイルとともに使用する場合、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)ペア腫瘍/正常サンプルを解析します

幅広い臨床研究アプリケーション

マーカーは、リスクプロファイリング、ファーマコゲノミクス、健康特性評価、疾患発見を含む研究アプリケーションのために、ClinVar、CPIC、PharmGKBなどの臨床研究データベースから選定されました。

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関連するアプリケーションと手法

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Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24 Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8
アッセイ時間 3日 3日
Automation capability Automated array loader, Liquid handling robot(s) Automated array loader, Liquid handling robot(s)
Cancer type Hematologic, Solid tumor Hematologic, Solid tumor
説明 24サンプルのInfinium Global Screening Array with Cytogenetics-24は、ゲノム全体で4,800を超える重要な遺伝子をターゲットとしています。BeadChipには約70万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能2.5 Mbを提供します。 8サンプルのInfinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8は、ゲノム全体で4,800を超える主要な遺伝子を広範囲にターゲットとしています。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。
ハンズオンタイム 8ビーズチップワークフローの自動化に1時間5分 8ビーズチップワークフローの自動化に1時間5分
インプット量 200 ng DNA 200 ng DNA
システム iScan iScan
手法 High-throughput genotyping array, Cytogenomic array Cytogenomic array, Genome-wide genotyping array
Nucleic acid type DNA DNA
サンプル数 アレイあたり24サンプル アレイあたり8サンプル
Specialized sample types Blood, FFPE tissue, Buccal swabs, Saliva Blood, FFPE tissue, Buccal swabs, Saliva
Species category ヒト ヒト
テクノロジー Microarray Microarray
バリアントクラス Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs)

Infinium Global Screening Array with Cytogenetics (24 Samples)

20122862

The Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24, 24 Samples Kit combines a versatile genome-wide backbone with optimized content for advanced cytogenetic analysis. Each BeadChip assays ~700K total variants. The kit contains 1 BeadChip and the necessary reagents for amplifying, fragmenting, hybridizing, labeling, and detecting 24 samples.

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Infinium GSACyto-24 v1.0 Kit, 48 samples (includes array and consumables)

20066469

Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24, 48 Samples Kitは、汎用性の高いゲノムワイドバックボーンと高度な細胞遺伝学的解析のための最適化されたコンテンツを組み合わせています。各BeadChipアッセイでは、合計で約70万のバリアントが解析されます。このキットには、BeadChipが2個と、48のサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出に必要な試薬が含まれています。

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Infinium GSACyto-24 v1.0 Kit, 288 samples (includes array and consumables)

20066470

Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24, 288 Samples Kitは、汎用性の高いゲノムワイドバックボーンと高度な細胞遺伝学的解析のための最適化されたコンテンツを組み合わせています。各BeadChipアッセイでは、合計で約70万のバリアントが測定されます。このキットには、12のBeadChipと、288のサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出に必要な試薬が含まれています。

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Infinium GSACyto-24 v1.0 Kit, 1152 samples (includes array and consumables)

20066471

Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24, 1152 Samples Kitは、汎用性の高いゲノムワイドバックボーンと高度な細胞遺伝学的解析のための最適化されたコンテンツを組み合わせています。各BeadChipアッセイでは、合計で約70万のバリアントが解析されます。このキットには、48のBeadChipと、1152のサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出に必要な試薬が含まれています。

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Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

20015273

Infiniumプロトコールの必須ステップをユーザーに理解してもらうための3日間のハンズオンインストラクション。コースでは、サンプルとBeadChip調製、iScanシステムを使用したサンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価と解析に関するハンズオントレーニングを提供します。

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NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。

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