2023年3月14日
結核（TB）は世界のほとんどの地域で予防および治癒が可能ですが、南アフリカでは依然として急激な問題となっています。世界保健機関（WHO）は、2021年に全世界で1,060万人が病気にかかり、ヒト人口の約0.1%を占めたと推定しています。The Lancetの最近の研究によると、WHOの30の高負荷TB国にリストされている南アフリカでは、感染率は約8倍高く、10万人あたり852例です。
この疾患は結核菌によって引き起こされます。 換気の悪い狭い生活区域や作業区域で繁殖し、肺やその他の臓器に入り込みます。感染した人の多くは無症状ですが、そのうち約5%が18カ月以内に活動性結核を発症する可能性があります。複雑なのは、一部の結核症例が標準的薬剤に反応しないという事実であり、患者が治療過程を完了しないと、多剤耐性結核（MDR-TB）の感染につながる可能性があります。さらに悪いことに、HIVに感染している人は結核に感染するリスクが高く、死亡する可能性も高くなります。
ヨハネスブルグの南アフリカ結核センター国立伝染病研究所の科学リーダーであるShaheed Vally Omarは、次世代シーケンスが彼の国のMDR-TBの検出と追跡に役立つと考えています。Omarはまた、WHO Global TB ProgrammeのExpert PanelおよびTechnical Expert Groupのメンバーでもあり、疾患の診断と薬剤耐性の予測に役立つ革新的なツールについてグループを助言しています。
現在、結核の検出は非常に困難です。最も安価なオプションは、顕微鏡で呼吸器サンプル中の細菌を探すことです。WHOは初期検査としてリアルタイムPCR分子アッセイを推奨していますが、診断に含まれる場合、微生物のゲノムの特定の領域のみをターゲットとし、薬剤耐性マーカーに関する情報は限られています。Omar氏は、この状況にもかかわらず、10年前に創業した場所から長い道のりを歩んできました。
約10年前、Omarが研究機関に初めて参加した際、WHOは南アフリカのサーベイランスと研究にイルミナMiSeqの使用を検討し始めました。2015年、南アフリカのOmar氏らは、MiSeqが結核だけでなく薬剤耐性マーカーも正確に評価できることを確認しました。
“薬剤耐性結核の出現と拡大は、地域だけでなく、世界的にも懸念されています”とOmar氏は述べています。次世代シーケンスにより、科学者は薬剤耐性結核を早期に発見することができ、最終的には感染リスクを低減できると付け加えています。さらに、イルミナのプラットフォーム上でのシーケンスは、どの細菌株が循環しているか、例えば薬剤耐性菌が拡大している場所にも光を当てます。
Omar氏は、私がこの分野で研究を開始した当時は、資金が不足しており、多くの研究者が関心を示していなかったと述べています。結核に焦点を当てたのは、変化をもたらし、一命を救うことができれば、すべての人類に利益をもたらすことができるという宗教的な教示でした。高負荷の国々でシーケンス技術を実装するという課題にもかかわらず、彼の研究は、地元、国内、および国際レベルでの結核との闘いの方針を導くためにすでに使用されています。彼は、イルミナのツールが南アフリカだけでなくその先にも広く導入され、今後10年間で結核に大きな影響を与えることを期待しています。
結核サーベイランスの詳細については、ここをクリックしてください。
イルミナとGenoScreen Deeplex® Myc-TB Combo Kitの詳細については、ここをクリックしてください。
