次世代シーケンサーのコスト
NGSのコスト
継続的なイノベーションによるコスト削減により、シーケンスはかつてないほど簡単に、手頃な価格でご利用いただけます。
発見のコストを見直す
ゲノミクス研究の規模と検出力を拡大することを目的に、NGSへの移行が進んでいます。ベンチトップシーケンスシステムのシンプルさと費用対効率により、NGS装置はあらゆる規模のラボで利用できるようになりました。
多くのラボが、ラボの効率を高め、時間を節約し、データプライバシーとNGSプロジェクトの管理を強化するために、ラボ内へのNGSの導入を選択しています。NGSは他の手法と比べて高価すぎると考える人もいますが、実際にはNGSは他の分子解析手法を補完または置き換える、非常に費用対効果の高い手法である場合もあります。NGSは、専門知識を必要とせずに、ラボに相当な価値と有用性を与えることができます。
検討すべき主な質問
意思決定プロセスを開始するにあたり、まず研究目標や予算、ラボのニーズを評価します。NGSシステムを購入する前に考慮すべき重要な事項
- 最もよく使用する手法とアプリケーションは何か？
- 手法や研究規模に最適な装置オプションは何か？
- データ、装置、ワークフローの品質をどのように確保するか？
- 最初の購入後にかかるランニングコストは？
- NGSデータをどのように解析・保存するか？
- 他の研究者とどのように協働する予定か？
- どの程度の製品サポートを受けるか？
NGSのコストを評価し、予算を計画する
包括的な視点
NGSプラットフォームの購入にあたっては、装置本体価格やGbあたりのコストだけでなく、多くの要因を考慮する必要があります。これらの要素だけでは判断を誤らせる可能性があります。これには、セットアップから補助機器、使いやすさ、サポートの程度／装置の稼働時間、会社の評判／寿命、トレーニングなど、あらゆるものが含まれます。
装置
ラボに最適なシーケンス装置の種類は、主に実施したい NGSアプリケーション のスループットとデータ量によって決まります。現在のニーズと将来のニーズをいずれも考慮します。研究者の多くは、ベンチトップシーケンスから始めます。
ランニングコスト
- 実験1回あたりのコスト
- サンプルあたりのコスト（DNA抽出、ライブラリー調製、シーケンス試薬など）
- 高出力アプリケーションの場合、規模の経済性がコスト削減に役立つ
実験室スペースと補助装置
- ラボのスペースと施設システムを考慮する
- 核酸定量装置
- 核酸品質分析装置
- 個別のクラスター形成装置
- サーマルサイクラー
- 超音波処理装置（一部のライブラリー調製方法で使用）
- 遠心機
- 一般的なラボ用品（ピペッター、96ウェルプレート、遠心機チューブなど）
- 追加の専用機器
データの品質、解析、保管
- 反復操作を防止するためのデータ品質（Qスコア）
- ソフトウェアライセンス
- データの保管／サーバー（多くの場合ライセンス費用の一部）
- データ解析アプリの実行（コンピューティングコストとも呼ばれる）
- セキュリティおよびコンプライアンス要件
- 解析パイプラインスケーラビリティ
- データ圧縮およびアーカイブソリューション
装置サポート
- 導入支援とスタッフトレーニング
- 装置トラブル対応に伴う機会損失コスト
- プロアクティブな装置モニタリングによる予防保守
- ハンズオンタイム：効率性とワークフローの簡素化によるラボ技術者の時間創出
- 外部委託時のターンアラウンドタイムはコスト増につながる可能性（機会損失、実施可能な実験数の減少）
NGSシステムの選択：ステップバイステップガイド
この包括的なガイドでは、研究目標とラボのニーズを評価することで、意思決定プロセス全体について手順を追って説明します。
- NGSシステムを購入する前に尋ねるべき重要な質問
- シーケンスおよびデータ解析プラットフォームの主な考慮事項
- NGS購入者のチェックリスト
完全なシーケンスエコシステム
次世代シーケンサー（NGS）のコストが低下し続ける中、イルミナは、継続的な革新を通じてNGSをより手頃で利用しやすいものにする取り組みをリードしています。2013年以降、ゲノムあたりの平均コストは96%減少しています1,2。当社は、多くのラボがその規模にかかわらずこの強力なテクノロジーの潜在能力を利用できるよう支援することに努めています。
イルミナシーケンサーをご購入いただくと、以下のメリットをご活用いただけます。
シームレスなワークフローを実現する、包括的かつ連携されたポートフォリオ・エコシステム
運用の簡素化と迅速かつ容易な導入を実現するイノベーション
96%の顧客満足度、平均修理時間1日未満、週5日24時間対応のテクニカルサポートなど、包括的な製品サポート
* サービス内容は地域によって異なります。詳細については、弊社担当までお問い合わせください。
エンジニア、テクニカルアプリケーションサイエンティスト、バイオインフォマティシャン、IT専門家など高度な資格を持つサービスチームによる装置サービスプラン
ベストプラクティスとアプローチを共有する主要な研究者のコミュニティ
パワフルで使いやすいデータ解析とストレージソリューション
"コストの障壁は大幅に減少しました。これまで多くの人がコストを理由に導入を妨げられていましたが、イルミナは、低コストでシーケンス技術をより利用しやすくするために大きな進歩を遂げました。そこには専門知識があります。"
参考文献
- National Human Genome Research Institute. DNA Sequencing Costs: Data. genome.gov/about-genomics/fact-sheets/DNA-Sequencing-Costs-Data. 2023年4月10日閲覧。
- 3billion. Whole Genome Sequencing cost 2023 3billion.io/blog/whole-genome-sequencing-cost-2023. 2023年4月10日閲覧。