フローセルタイプ | 1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
2 × 50 bp | ~165 Gb | ~1 Tb | ~2.6 Tb |
2 × 100 bp | ~330 Gb | ~2 Tb | ~5.3 Tb |
2 × 150 bp | ~500 Gb | ~3 Tb | ~8 Tb |
ハイスループットシーケンスのための新標準
NovaSeq XおよびNovaSeq X Plusシステムのための、次のレベルのシーケンスアウトプット、サンプルスループット、仕様
フローセルタイプ | 1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
2 × 50 bp | ~165 Gb | ~1 Tb | ~2.6 Tb |
2 × 100 bp | ~330 Gb | ~2 Tb | ~5.3 Tb |
2 × 150 bp | ~500 Gb | ~3 Tb | ~8 Tb |
* 仕様は、サポートされるクラスター密度でNA12878で作成されたイルミナPhiXコントロールライブラリーまたはTruSeq DNAライブラリーに基づいています。
NovaSeq X Plus システムでは、シングルフローセルもしくはデュアルフローセルのランが可能です。デュアルフローセル ランは、上記の2倍の出力を実現します。
NovaSeq X システムでは、シングルフローセルのランが可能です。
フローセルタイプ | 1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
シングルエンドリード | 16億 | 100億 | 260億 |
ペアエンドリード | 32億 | 200億 | 520億 |
フローセルタイプ |
1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
クオリティスコア | |||
2 × 50 bp | Q30以上の塩基が90%以上 | ||
2 × 100 bp | Q30以上の塩基が85%以上 | ||
2 × 150 bp | Q30以上の塩基が85%以上 | ||
ランタイム | |||
2 × 50 bp | ~17時間 | ~18時間 | ~25時間 |
2 × 100 bp | ~20時間 | ~22時間 | ~38時間 |
2 x 150 bp | ~23時間 | ~25時間 | ~48時間 |
* クオリティスコア(Qスコア)とは、ベースコーリングにおけるエラーの発生率を予測するものです。Q30超の塩基のパーセンテージは全体のランの平均です。クオリティスコアは、イルミナのPhiXコントロールライブラリー使用したNovaSeq Xシリーズ10B試薬に基づきます。性能はライブラリータイプやクオリティ、インサートサイズ、ローディング濃度およびその他の実験要因に応じて変わることがあります。
†ランタイムには、自動化されたクラスター形成、シーケンス、自動ポストランウォッシュ、およびベースコールが含まれます。ランタイムは、サポートされているクラスター密度でのイルミナPhiX コントロールライブラリーに基づきます。性能はライブラリータイプやクオリティ、インサートサイズ、ローディング濃度およびその他の実験要因に応じて変わることがあります。
このテクニカルノートに概説されているベストプラクティスに従って、ライブラリーの品質を評価し、ローディング濃度を最適化し、NovaSeq Xシリーズのパフォーマンスを最大化するためにライブラリーのプールを作成してください。
フローセルタイプ | 1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
フローセル当たりのヒトゲノム | ~4 | ~24 | ~64 |
フローセル当たりのエクソーム | ~41 | ~250 | ~750 |
フローセル当たりのトランスクリプトーム | ~30 | ~200 | ~520 |
*すべてのサンプルスループットは、シングルフローセルの1ラン当たりの概算値です。ヒトゲノムは、30xのゲノムカバレッジを達成するために、サンプル当たり120 Gb超のデータを想定しています。エクソームは、100倍のカバレッジを達成するために、サンプルあたり約8 Gbまたは約40Mの読み取りを想定しています。 トランスクリプトームが推定するリード長は50M以上です。スループットは、使用するエクソームパネルのサイズ、必要な深度、ライブラリー調製キットなどの多くの要因によって異なります。
NovaSeq Xシリーズの多くのイノベーションとXLEAP-SBSケミストリーの概要をバーチャルツアーでご覧ください。統合バイオインフォマティクス、データフットプリントの削減、凍結乾燥試薬、その他のイノベーションについて学びます。
NovaSeq Xシリーズは、当社史上最も高速で、高品質、そして長持ちするSequence by Synthesis(SBS)である、XLEAP-SBSのケミストリーに対応します。実績のある標準的なイルミナSBSケミストリーを基礎として開発されたXLEAP-SBSケミストリーは、2倍速くなった取り込み時間と、改善した試薬の安定性をお届けします。
NovaSeq Xシリーズは、パターン化フローセルテクノロジーを取り入れ、幅広いシーケンスアプリケーションのための超高レベルのスループットを生成します。NovaSeq Xのパターン化フローセルは、決まった位置に何百億ものナノウェルが配置されていますが、これがシーケンスクラスターの均一な間隔を実現するためのデザインです。これにより、シーケンスリード数とシステムの総出力を飛躍的に向上させることができました。
NovaSeq XとNovaSeq X Plusシステムは、超高速で精確なゲノムデータ解析を目指して、DRAGEN Bio-IT Platformと統合されました。搭載型もしくはクラウド上で、複数の二次解析パイプラインを同時進行で実行します。1回のランで、フローセル当たり最大4つのアプリケーションを同時に実行することができます。
統合DRAGEN ORA(オリジナルリードアーカイブ)は、可逆圧縮を実行し、FASTQファイルのサイズを最大5倍削減します。この最適化されたゲノミクスデータ圧縮により、より高速なデータ転送と簡単なデータ管理が可能になります。データのフットプリントがより小さくなると、ストレージおよび電力消費とその費用も削減できます。
NovaSeq Xシリーズは、より高いサステイナビリティという目的に合うように設計されました。イノベーションに含まれるのは、常温で届けられる凍結乾燥された試薬と試薬用のパッケージの廃棄物の約90%の削減です。プラスチックの重量を50%以上削減し、緩衝液カートリッジは植物由来のバイオポリマーで作られています。
NovaSeq Xシリーズでは、青緑色のオプティクスを搭載したより多い開口数、カスタムCMOSセンサー、2チャンネルSBSにより、超高解像度のイメージングを達成しています。波長の短縮により、NovaSeq Xシリーズの25Bフローセルにおいて、最大260億シングルリード用にナノウェル間の間隔をより狭くすることが可能になります。