NovaSeq Xシリーズ:包括的なオミクスソリューション向けに最適化した製品群

ハイスループットマルチオミクスの力で生物学的探索の世界が広がります 

NovaSeq Xシリーズでオミクスソリューションを活用 

NovaSeq Xシリーズは、ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、およびプロテオームを調べるための幅広い方法をサポートするスケーラブルなシーケンス能力と柔軟性を提供します。最高の完全性でデータを出力するよう 設計されたNovaSeq Xシリーズは、業界をリードするスピードとスループットで、最もデータ集約的な研究でさえアクセスできるようにします。

NovaSeq Xシリーズ向けに設計されたイノベーションにより、複数のオムにまたがる発見力を解き放つ

柔軟性

小規模なデータセットと大規模なマルチオミクス研究の両方に適し、バルク、シングルセル、空間など、複数のサンプルタイプをサポートします。事前設定されたカスタマイズ可能なワークフローには、さまざまなユーザーニーズを満たす柔軟性があります。

スケーラビリティ

複数のサイクルキットが幅広いスケーラブルなオプションをサポートします。NovaSeq X Plusシステムと1.5B、10B、25Bのフローセルにより、データ集約型のマルチオミクス研究をこれまで以上に幅広く、より深い規模で行うことができます。

Hongyu Gao, Phd


NovaSeq Xシリーズでは、10Bまたは25Bのフローセルを使用して、複数のプロジェクトとユーザーからのサンプルを同じ大規模ランで組み合わせています。

効率性

タッチポイントとステップが減ることで、サンプル調製からデータ解釈までのワークフローが迅速で簡単になります。個別アドレス可能なレーンにより、ライブラリーごとにシーケンスデータをカスタマイズすることができます。

コスト

より多くのサンプルを処理して、最大3倍の精度でより多くのomeにアクセスします。1 25Bフローセルは、同じ予算でサンプル数を最大2.5倍増加させます。2

Elizabeth Pritchett, PhD

この25Bフローセルは、効率的な方法でシーケンスできる多様なライブラリータイプの優れた例です。

サムネール

NovaSeq Xシリーズ:250億リードの単一細胞発見を達成

マルチオミクスが複雑な生物学的課題に取り組む時が来ました。NovaSeq Xシリーズのパワーを通じてサイエンティストがサンプルから探索までの過程でどのように優位性を得るかについて、動画でご確認ください。

NovaSeq Xシリーズ用の統合マルチオミクスワークフロー

1. ライブラリー調製ソリューション

ゲノム、エピゲノム、トランクリプトーム、プロテオームを精査するためのイルミナとサードパーティのハイスループットソリューションの幅広いポートフォリオ

2. NovaSeq Xシリーズによるシーケンシング

NovaSeq XおよびNovaSeq X Plusシーケンスシステムは、大規模なデータ集約型アプリケーションに、並外れたスループットと正確性を提供します。

3. Illumina Connected Analytics

インフォマティクスワークフローを運用可能にし、画期的な科学的洞察を獲得するために設計された、安全で柔軟なバイオインフォマティクスプラットフォームのパワーをご体験ください。

NovaSeq Xシリーズによるオミクス手法とワークフロー

NovaSeq Xシリーズは、これまで手の届かなかった発見を可能にするマルチオミクスを実現します。以下に、オミクスワークフロー向けの製品と試薬をご紹介します。サポート用のアプリケーションノート、リソース、結果を解釈するための関連分析ソリューションも併せてご覧いただけます。 

ゲノムを研究することで、研究者はDNAの構造、機能、シーケンスに関する情報を活用して、健康や疾患におけるゲノムの役割をより深く理解することができます。

主なソリューションとリソース

高感度な全ゲノムシーケンスのための迅速で柔軟なワークフロー。

幅広いDNAインプットタイプに対応する、高速でロバストかつ柔軟なワークフローです。

Illuminaの最速かつ最も柔軟なターゲットDNAシーケンスソリューション。

セルフリーDNAサンプルから少量の変異を検出する高感度ライブラリー調製ソリューションです。詳細は当社の データシートをご覧ください。

Illumina Complete Long Readシーケンスの製品をご覧ください。

トランスクリプトームとは、生物内のすべてのRNA分子の総体を指し、ゲノムの機能を理解するための重要な研究分野です。この研究により、疾患や創薬に関する洞察が得られる可能性があります。

主なソリューションとリソース

遺伝子と転写産物の量を正確に測定し、コーディングRNAと複数の形態のノンコーディングRNAの既知および新規の特徴を検出します。 詳細は当社の データシートをご覧ください。

幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス配列ライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフローです。詳細は アプリケーションノートをご覧ください。

コーディングトランスクリプトーム全体にわたって明確で包括的な解析を行うための合理化されたソリューションです。新規アイソフォーム、遺伝子融合、アレル特異的遺伝子発現などの特徴を発見することができます。詳細は データシートをご覧ください。

Illumina BaseSpace Sequence Hubが、ScaleBioのSingle Cell RNA Sequencing Kitに対応できるようになりました。このキットは、組み合わせ式インデックスと装置不要のアプローチを活用することで、シングルセルRNA解析のために数十万個の細胞に対する高度にマルチプレックス化されたライブラリー調製を実現します。その詳細をご覧ください。

シングルセルスケールの解像度で新鮮凍結組織の全トランスクリプトーム解析を実現する、ハイスループットの空間シーケンスプラットフォームです。

数万のシングルセルにわたる遺伝子発現を測定し、細胞の不均一性を解析します。

空間トランスクリプトーム実験が分子的特性と形態学的特性を組み合わせ、これまで得られなかった組織生物学の新たな視点を提供する方法をご紹介します。 

このプレスリリースでは、Illuminaが最新のマルチオミクス ソリューションをサポートするためのシングルセルテクノロジーの開発計画を紹介しています。

このeBookでは、Illumina Connected Softwareを活用した高インパクトな研究に役立つ、高精度で汎用性の高い統合データ解析ソリューションをご紹介しています。ぜひダウンロードしてご覧ください。

イルミナのシングルセルテクノロジーがいかに簡単でスケーラブルなワークフローを提供し、他のシングルセル手法のような予算やテクノロジーの制限なく、scRNA-seqをよりアクセスしやすいものにするかをご説明します。

エピゲノミクスとは、細胞や生物内の多くの遺伝子のエピジェネティックな変化を包括的に研究する分野です。ただし、DNAシーケンスの変化は対象外です。

主なソリューションとリソース

DNAメチル化研究のための全ゲノムバイサルファイトシーケンシング(WGBS)の詳細をご覧ください。WGBSとは、塩基レベルのメチル化を定量する手法です。

このテクニカルノートでは、同一のシングルセルから得られるエピゲノムとトランスクリプトームの結果を結びつけ、遺伝子制御の全体像を把握する方法をご紹介しています。

 Illumina Tagment DNA TDE1 Enzyme and Buffer Kitsなどの製品 で、 ATAC-Seq 実験におけるクロマチンアクセシビリティを解析してください。また、ATAC-Seqに関するリソースや、この手法がシングルセル実験などでどのように使用されたかを紹介する ウェビナー もご覧ください。

バイモーダルのduetマルチオミクス ソリューション+modCデータがIllumina BaseSpace Sequence Hubで利用できるようになりました。詳細をご覧ください。

プロテオミクスは、生物体内のタンパク質の構造と機能を包括的に研究する分野です。NGSを活用したハイスループットプロテオミクスの発展により、バイオマーカーの発見が進み、細胞機能と疾患に対する理解を向上させることができます。 

主なソリューションとリソース

このアプリケーションノートでは、BEN-Seq(バルクエピトープおよび核酸シーケンス)やCITE-Seq(トランスクリプトームおよびエピトープシーケンスの細胞インデックス)などの手法を活用して、Th1細胞におけるタンパク質および遺伝子発現プロファイルを分析する方法をご紹介しています。

CITE-Seqを使用して、シングルセル分解能でトランスクリプトームとタンパク質発現を同時に解析する方法をご紹介します。さらに、この 記事では、研究者が同様の手法を活用して、疾患に関連する新しい細胞のタイプと状態を明らかにする方法をご紹介しています。あわせてご覧ください。

Illumina BaseSpace Sequence HubのDRAGEN Single-Cell RNAアプリを活用して、マルチプレックス化されたサンプル(mRNAとタンパク質)を解析する方法をご紹介します。

アプタマー技術を活用したプロテオミクスソリューションにより、NGSリードアウトから約9,500種類のユニークなヒトタンパク質を同定および定量します。詳細はイルミナのデータシートをご覧ください。

このテクニカルノートでは、Olink ExploreとIlluminaシーケンスシステムを活用して、バイオマーカーと創薬研究のためのハイスループットタンパク質プロファイリングを行う方法をご紹介します。

NanoStringのGeoMx DSPプラットフォームとNGSデータ管理と解析のためのクラウドベースのゲノミクスハブであるイルミナBaseSpace Sequence Hubを使用して、空間情報をタンパク質とRNA発現と組み合わせる方法をご覧ください。星細胞腫と膠芽腫の組織構造を解決する方法については 、関連するアプリケーションノート を参照してください。

オミクスデータの解析と解釈のためのソリューション

Illuminaでは、オミクスデータを解析し、新たな洞察を導き出すための包括的なソフトウェアソリューションポートフォリオをご用意しています。NovaSeq Xシリーズのような実用規模のシステムに対応するインフォマティクスソリューションを活用し、データから洞察へのプロセスを効率的かつ容易に進めましょう。

ソフトウェア ソリューション

DRAGEN二次解析

複数の導入オプション、アプリケーション、パイプラインを備えた、精確で包括的、かつ高効率のバイオインフォマティクスを提供し、お客様の研究ニーズにお応えします。  

BaseSpace Sequence Hub

直感的なインターフェースでIlluminaのシーケンスシステムと統合し、ランのセットアップとモニタリングを効率化します。セキュアなクラウドエコシステム内で、タッチパネル操作の二次解析とデータ共有を直感的に行うことができます。また、拡張可能なストレージにより、研究室のニーズ拡大に対応します。

Illumina Connected Analytics

セキュアで拡張性の高いバイオインフォマティクスプラットフォームです。大量のマルチオミクスデータの管理、解析、解釈を実現します。 

Partek Flow解析ソリューション

Partek Flowバイオインフォマティクスソフトウェアは、視覚的なユーザーインターフェース、ロバストな統計アルゴリズム、情報量の豊富な視覚化、そして最先端のゲノミクスツールを提供します。これにより、あらゆるスキルレベルの研究者が自信を持ってデータ解析を実行できます。 

Illumina Correlation Engine

インタラクティブなオミクスのナレッジベースで、プライベートなオミクスデータを生物学的コンテキストにおいて、高度にキュレーションされた公開データに当てはめます。

サムネール

マルチオミクスがんアプリケーションのためのIllumina Connected Analytics

マルチオミクスがん解析用のコホートに特化したIllumina Connected Analyticsワークフローのデモをご覧ください。

ソフトウェアの記事とリソース

10x Genomicsライブラリーに対応したBaseSpace Sequence Hub

10x Genomicsライブラリーを活用したシーケンスランをRun Plannerで直接セットアップできるようになりました。その方法についてご紹介します。Run Plannerツールは、サンプルやインデックス情報の指定、リード長や解析オプションの指定など、シーケンスランの準備に必要な手順をガイドします。

空間マルチオミクスのためのPartekバイオインフォマティクス

RNAとタンパク質のデータを統合し、遺伝子とタンパク質分子間の相関関係を参照して統計的に関係性を評価し、さらに細胞タイプ間の差異を差分解析比較で探索する方法をご紹介します。また、細胞タイプ間の違いを比較する差分解析を通じて、生物学的解釈を深める方法もご紹介します。

関連電子書籍

マルチオミクスの力 eBook

マルチオミクスを使用して、遺伝型と表現型のマッチング精度を高め、単一のオミクスアプローチでは得られない完全な細胞のリードアウトを取得する方法をご覧ください。

NovaSeq XシリーズeBookによるマルチオミクスシーケンス

NovaSeq Xシリーズでより幅広く、より深いシーケンスを行い、以前は手が届かなかったオミクスプロジェクトに取り組む方法をご覧ください。

遺伝子発現や制御についてのバイオインフォマティクス(eBook)

NGSデータ解析ワークフローの詳細と、遺伝子発現および制御データの解析に利用できるソフトウェアソリューションの概要をご覧ください。

シングルセルシーケンスに関するeBook

シングルセルシーケンスワークフローのすべてのステップを探索し、実験を成功に導くための貴重な洞察を学びましょう。

補足資料

NovaSeq Xシリーズに対応したTruSight Oncology ctDNA v2

このアプリノートでは、TruSight Oncology ctDNA v2 CGPアッセイを用いてNovaSeq XとNovaSeq 6000の性能を比較します。この比較によれば、NovaSeq Xシリーズを使用すると、ランタイムが大幅に短縮されても、同じレベルの高い性能が得られることが判ります。

Correlation Engineでオミクスパターンの探索を効率化

Correlation Engineが、膨大なマルチオミクスの公開データや出版物、および内蔵の包括的な解析相関ツールによって 駆動される生物学的相互作用のキュレーションされたオミクス知識ベースをどのように提供するかをご覧ください。

よくある質問

マルチオミクスページでは、複数のオムにまたがって研究と発見のパワーを拡大し、さまざまなオミクス手法を実行する方法の詳細を確認できます。

NovaSeq Xシリーズなら、大量の貴重なデータを生成することができます。これらのデータは、生産規模のインフォマティクスのためのIllumina Connected Analytics(ICA)を使用して分析できます。ICAは、Illuminaのハードウェアとソフトウェアと緊密に統合されており、カスタマイズ可能なワークフローと標準搭載のセキュリティおよびコンプライアンス機能を備え、規制のある環境にも対応します。さらに、BaseSpace Sequence Hubは直感的に使用できるインターフェースを備えており、セキュアなクラウドベースのエコシステムを使用して、研究室のニーズ拡大に対応できるような効率的なランセットアップとモニタリングを実現します。

さまざまなソリューションがご利用になれます。Illumina Connected AnalyticsCorrelation Engineなどのソフトウェアソリューションは、マイクロアレイやNGSデータを解析する機能を備えています。Partek Flowのパートナーソリューションでは、NGS、マイクロアレイ、qPCRデータを解析することもできます。

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参考文献

  1. XLEAP-SBSケミストリーを搭載
  2. NovaSeq 6000 S4フローセルとの比較