NovaSeq Xシリーズ:包括的なオミクスソリューション向けに最適化した製品群

ハイスループットマルチオミクスの力で生物学的探索の世界が広がります 

NovaSeq Xシリーズでオミクスソリューションを活用 

NovaSeq Xシリーズは、ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、およびプロテオームを調べるための幅広い手法に対応するスケーラブルなシーケンス能力と柔軟性を備えています。最高の整合性でデータを出力するよう設計されたNovaSeq Xシリーズは、業界最先端のスピードとスループットにより、極めてデータ集約型の研究にも利用できます。 

NovaSeq Xシリーズ向けに設計された革新的な技術により、複数のオミクス分野にわたる新たな検出への扉が開きます

柔軟性

小規模なデータセットと大規模なマルチオミクス研究の両方に適し、バルク、シングルセル、空間など、複数のサンプルタイプをサポートします。事前設定されたカスタマイズ可能なワークフローには、さまざまなユーザーニーズを満たす柔軟性があります。

スケーラビリティ

複数のサイクルキットが幅広いスケーラブルなオプションをサポートします。NovaSeq X Plusシステムと1.5B、10B、25Bのフローセルにより、データ集約型のマルチオミクス研究をこれまで以上に幅広く、より深い規模で行うことができます。

Hongyu Gao, Phd


NovaSeq Xシリーズでは、10Bまたは25Bのフローセルを使用して、複数のプロジェクトやユーザーのサンプルを同一の大規模ランで組み合わせています。

効率性

タッチポイントとステップが減ることで、サンプル調製からデータ解釈までのワークフローが迅速で簡単になります。個別アドレス可能なレーンにより、ライブラリーごとにシーケンスデータをカスタマイズすることができます。

コスト

最大3倍の高精度により、より多くのサンプルを処理し、より多くのオミクスにアクセスできます1。25Bフローセルにより、同じ予算で最大2.5倍のサンプル数を処理できます2

Elizabeth Pritchett, PhD

この25Bフローセルは、効率的な方法でシーケンスできる多様なライブラリータイプの好例です。

NovaSeq X Plusシステムでマルチオミクスのブレークスルーを推進

ヒトの健康や農業などにおけるブレークスルーを推進するスケーラブルなシーケンスシステムであるイルミナNovaSeq X Plusシステムを使用して、Génome Québecがどのように研究を進めているかをご覧ください。この動画では、科学者とGénome Québecが同じ信頼できるツールを使ってより多くのことを達成しながら、発見を加速し、コストを削減し、効率を向上させられるように、イルミナの製品とワークフローがどのように役立っているかについて学びます。

サムネール

NovaSeq Xシリーズ用の統合マルチオミクスワークフロー

1. ライブラリー調製ソリューション

ゲノム、エピゲノム、トランクリプトーム、プロテオームを精査するためのイルミナとサードパーティのハイスループットソリューションの幅広いポートフォリオ

2. NovaSeq Xシリーズによるシーケンシング

NovaSeq XおよびNovaSeq X Plusシーケンスシステムは、大規模なデータ集約型アプリケーションに、並外れたスループットと正確性を提供します。

3. Illumina Connected Analytics

インフォマティクスワークフローを運用可能にし、画期的な科学的知見を獲得するために設計された、安全で柔軟なバイオインフォマティクスプラットフォームのパワーをご体験ください。

NovaSeq Xシリーズによるオミクス手法とワークフロー

NovaSeq Xシリーズは、これまで手の届かなかった発見を可能にするマルチオミクスを実現します。以下に、オミクスワークフロー向けの製品と試薬をご紹介します。サポート用のアプリケーションノート、リソース、結果を解釈するための関連分析ソリューションも併せてご覧いただけます。 

ゲノムを研究することで、研究者はDNAの構造、機能、シーケンスに関する情報を活用して、健康や疾患におけるゲノムの役割をより深く理解することができます。

主なソリューションとリソース

高感度な全ゲノムシーケンスのための迅速で柔軟なワークフロー。

幅広いDNAインプットタイプに対応する、高速でロバストかつ柔軟なワークフローです。

Illuminaの最速かつ最も柔軟なターゲットDNAシーケンスソリューション。

セルフリーDNAサンプルから少量の変異を検出する高感度ライブラリー調製ソリューションです。詳細はイルミナのデータシートをご覧ください。 

トランスクリプトームとは、生物内のすべてのRNA分子の総体を指し、ゲノムの機能を理解するための重要な研究分野です。この研究により、疾患や創薬に関する知見が得られる可能性があります。

主なソリューションとリソース

遺伝子や転写産物の量を精確に測定し、コーディングRNAや複数の種類のノンコーディングRNAにおける既知および新規の特徴を検出できます。詳細はイルミナのデータシートをご覧ください。  

幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス配列ライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフローです。イルミナのアプリケーションノートで詳細をご確認ください。 

コーディングトランスクリプトーム全体にわたって明確で包括的な解析を行うための合理化されたソリューションです。新規アイソフォーム、遺伝子融合、アレル特異的遺伝子発現などの特徴を発見することができます。詳細はイルミナのデータシートをご覧ください。 

イルミナのシングルセルテクノロジーがいかに簡単でスケーラブルなワークフローを提供し、他のシングルセル手法のような予算やテクノロジーの制限なく、scRNA-seqをよりアクセスしやすいものにするかをご説明します。

シングルセルスケールの解像度で新鮮凍結組織の全トランスクリプトーム解析を実現する、ハイスループットの空間シーケンスプラットフォームです。

10x GenomicsのChromium Single Cell Gene Expressionを使用して、数万のシングルセルの遺伝子発現を測定し、細胞の不均一性を解析します。

Illumina BaseSpace Sequence Hubで、この空間トランスクリプトミクス製品のシーケンスデータを表示します。

Illumina BaseSpace Sequence Hubが、ScaleBioのSingle Cell RNA Sequencing Kitに対応できるようになりました。このキットは、組み合わせ式インデックスと装置不要のアプローチを活用することで、数十万個の細胞に対する高度にマルチプレックス化されたライブラリー調製を実現します。

このeBookでは、高インパクトな研究に役立つ、高精度で汎用性の高い統合データ解析ソリューションをご紹介しています。ぜひダウンロードしてご覧ください。

イルミナが画期的なシングルセル解析とオミクステクノロジーの開発をどのように計画しているかについて、プレスリリースをお読みください。

エピゲノミクスとは、細胞や生物内の多くの遺伝子のエピジェネティックな変化を包括的に研究する分野です。ただし、DNAシーケンスの変化は対象外です。

主なソリューションとリソース

塩基レベルのメチル化を定量化するためのDNAメチル化研究のためのWGBSの詳細、または Zymo-Seq WGBSのワークフローとデータについてご覧ください。

10x GenomicsのChromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expressionを使用して、単一細胞エピゲノムとトランスクリプトームの結果を結び付け、同じ単一細胞からの遺伝子制御の全体像を把握します。

ATAC-Seqに関するリソースや、この手法がシングルセル実験などでどのように使用されたかを紹介する ウェビナー もご覧ください。ATAC-Seq実験用の(Illumina Tagment DNA TDE1 Enzyme and Buffer Kitsなど)の製品をご覧ください。 

バイオモーダルからデュエットマルチオミクスソリューション + modC遺伝学およびエピジェネティクスキットの詳細を学び、Illumina BaseSpace Sequence Hubでデータをご覧ください。

プロテオミクスは、生物体内のタンパク質の構造と機能を包括的に研究する分野です。NGSを活用したハイスループットプロテオミクスの発展により、バイオマーカーの発見が進み、細胞機能と疾患に対する理解を向上させることができます。 

主なソリューションとリソース

このアプリケーションノートでは、BEN-Seq(バルクエピトープおよび核酸シーケンス)の手法を活用して、Th1細胞におけるタンパク質および遺伝子発現プロファイルを分析する方法をご紹介しています。

CITE-Seqを使用して、シングルセル分解能でトランスクリプトームとタンパク質発現を同時に解析する方法をご紹介します。さらに、この 記事では、研究者が同様の手法を活用して、疾患に関連する新しい細胞のタイプと状態を明らかにする方法をご紹介しています。あわせてご覧ください。

Illumina BaseSpace Sequence HubのDRAGEN Single-Cell RNAアプリを活用して、マルチプレックス化されたサンプル(mRNAとタンパク質)を解析する方法をご紹介します。

アプタマー技術を活用したプロテオミクスソリューションにより、NGSリードアウトから約9,500種類のユニークなヒトタンパク質を同定および定量します。詳細はイルミナのデータシートをご覧ください。

プロテオミクス手法とNGSを組み合わせることで、ユーザーは費用対効果の高いスケーラビリティ、柔軟なサンプルバッチ処理、ハイスループットのタンパク質発見などの追加の機能を活用してプロテオームを解析できます。

NanoStringのGeoMx DSPプラットフォームとIllumina BaseSpace Sequence Hubを活用して、設備情報を、タンパク質およびRNA発現と組み合わせる方法をご紹介します。BaseSpace Sequence Hubは、NGSデータの管理と解析のためのクラウドベースです。関連するアプリケーションノートでは、この方法を使用して星状細胞腫と膠芽腫の組織構造を解明する方法をご覧いただけます。  

オミクスデータの解析と解釈のためのソリューション

Illuminaでは、オミクスデータを解析し、新たな知見を導き出すための包括的なソフトウェアソリューションポートフォリオをご用意しています。NovaSeq Xシリーズのような実用規模のシステムに対応するインフォマティクスソリューションを活用し、データから洞察へのプロセスを効率的かつ容易に進めましょう。

ソフトウェア ソリューション

DRAGEN二次解析

複数の導入オプション、アプリケーション、パイプラインを備えた、精確で包括的、かつ高効率のバイオインフォマティクスを提供し、お客様の研究ニーズにお応えします。  

BaseSpace Sequence Hub

直感的なインターフェースでIlluminaのシーケンスシステムと統合し、ランのセットアップとモニタリングを効率化します。セキュアなクラウドエコシステム内で、タッチパネル操作の二次解析とデータ共有を直感的に行うことができます。また、拡張可能なストレージにより、研究室のニーズ拡大に対応します。

Illumina Connected Analytics

セキュアで拡張性の高いバイオインフォマティクスプラットフォームです。大量のマルチオミクスデータの管理、解析、解釈を実現します。 

Partek Flowソフトウェア

マルチオミクスデータの解析と視覚化のための使いやすい、バイオインフォマティクスソフトウェア。

Illumina Correlation Engine

インタラクティブなオミクスのナレッジベースで、プライベートなオミクスデータを生物学的コンテキストにおいて、高度にキュレーションされた公開データに当てはめます。

サムネール

マルチオミクスがんアプリケーションのためのIllumina Connected Analytics

マルチオミクスがん解析用のコホートに特化したIllumina Connected Analyticsワークフローのデモをご覧ください。

ソフトウェアの記事とリソース

DRAGENでシングルセルゲノムの知見を引き出す

DRAGENの革新的なパイプラインの導入に関する最新情報をご覧ください。シングルセルATAC-Seqおよびシングルセルマルチオミクス(RNA-SeqおよびATAC-Seq)に関する情報も取り上げています。

10x Genomicsライブラリーに対応したBaseSpace Sequence Hub

10x Genomicsライブラリーを活用したシーケンスランをRun Plannerで直接セットアップできるようになりました。その方法についてご紹介します。本ツールは、サンプルやインデックス情報の指定、リード長や解析オプションの指定など、シーケンスランの準備に必要な手順をガイドします。

関連eBook

eBook『マルチオミクスのパワー』

マルチオミクスを使用して、遺伝型と表現型のマッチング精度を高め、単一のオミクスアプローチでは得られない完全な細胞のリードアウトを取得する方法をご覧ください。

NovaSeq Xシリーズによるマルチオミクスシーケンシング(eBook)

NovaSeq Xシリーズを使用して、より広範かつ詳細なシーケンシングを行い、これまで取り組むことが難しかったオミクスプロジェクトに挑戦しましょう。

遺伝子発現や制御についてのバイオインフォマティクス(eBook)

NGSデータ解析ワークフローについての詳細と、遺伝子発現および制御データの解析に使用できるソフトウェアソリューションの概要をご覧ください。

シングルセルシーケンスに関するeBook

シングルセルシーケンスワークフローのすべてのステップを探索し、実験を成功に導くための貴重な知見を学びましょう。

補足資料

NovaSeq Xシリーズに対応したTruSight Oncology ctDNA v2

このアプリノートでは、TruSight Oncology ctDNA v2 CGPアッセイを用いてNovaSeq XとNovaSeq 6000の性能を比較します。この比較によれば、NovaSeq Xシリーズを使用すると、ランタイムが大幅に短縮されても、同じレベルの高い性能が得られることが判ります。

Correlation Engineでオミクスパターンの探索を効率化

Correlation Engineが提供する、生物学的相互作用に関するキュレーション済みオミクスナレッジベースについてご覧ください。このナレッジベースは、膨大なマルチオミクスの公開データや論文に基づいて構築されており、包括的な解析相関ツールも組み込まれています。 

サムネール

NovaSeq Xシリーズ: 250億のリードによりシングルセル探索を達成

マルチオミクスが複雑な生物学的課題に取り組む時が来ました。NovaSeq Xシリーズのパワーを通じてサイエンティストがサンプルから探索までの過程でどのように優位性を得るかについて、動画でご確認ください。

よくある質問

マルチオミクスのページで詳細をご覧いただけます。このページでは、複数のオミクス分野にわたる研究と検出力の可能性を広げ、様々なオミクス手法を行う方法をご紹介しています。

NovaSeq Xシリーズなら、大量の貴重なデータを生成することができます。これらのデータは、生産規模のインフォマティクスのためのIllumina Connected Analytics(ICA)を使用して分析できます。ICAは、Illuminaのハードウェアとソフトウェアと緊密に統合されており、カスタマイズ可能なワークフローと標準搭載のセキュリティおよびコンプライアンス機能を備え、規制のある環境にも対応します。さらに、BaseSpace Sequence Hubは直感的に使用できるインターフェースを備えており、セキュアなクラウドベースのエコシステムを使用して、研究室のニーズ拡大に対応できるような効率的なランセットアップとモニタリングを実現します。

さまざまなソリューションがご利用になれます。Illumina Connected AnalyticsCorrelation Engineなどのソフトウェアソリューションは、マイクロアレイやNGSデータを解析する機能を備えています。また、Partek Flowのパートナーソリューションは、NGS、マイクロアレイ、qPCRデータを解析する機能を備えています。

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参考文献

  1. XLEAP-SBSケミストリーを搭載
  2. NovaSeq 6000 S4フローセルとの比較