Pillar oncoReveal Myeloid Panel

DNAコンテンツを組み合わせた58遺伝子の腫瘍横断型パネルです。シングルチューブSLIMampワークフローを使用して、ライブラリー調製とターンアラウンドタイムを高速化します。

48時間-サンプルからレポートまで

アッセイ時間

約3時間

ハンズオンタイム

DNA 10~80 ng(推奨量20 ng)

インプット量

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概要

oncoReveal Myeloid PanelはDNA NGSシーケンスパネルです。効率的なシングルチューブターゲット濃縮を行うタイル状アンプリコンベースのライブラリー調製手法である独自のStem-Loop Inhibition-Mediated Amplification(SLIMamp)テクノロジーを採用しています。

  • 組織内のあらゆるNGSラボで実施が可能なシングルチューブのタイル状増幅により、サンプルと結果の管理を維持

  • DNAインプットが限られていたりサンプル品質が低い場合でも、UIDなしでVAF 1%のバリアント検出を実現

  • ラボの効率を改善し、ノーコール、"検査の繰り返し、解釈の難解さにまつわる意思決定の必要性を低減

  • 8時間未満でDNAからシーケンサーへ

仕様

必要な製品

Pillar oncoRevealパネルには、Pillarインデックスキットが必要です。ご希望の反応回数を選択してください。

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アプリケーション

ワークフローの例

1
ライブラリー調製

Pillar oncoReveal Myeloid Panel

ドキュメント

製品資料

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Pillar oncoReveal Myeloid Panel AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel Pillar oncoReveal Essential MPN Panel
アッセイ時間 48時間-サンプルからレポートまで 5.5~7.5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) 48時間-サンプルからレポートまで
がんの種類 血液学 血液学 血液学
説明 58遺伝子アンプリコンベースのDNAパネル、シンプルなシングルチューブワークフロー 骨髄がんに関連する40種のDNA遺伝子、29種のRNA融合ドライバー遺伝子、5種の遺伝子発現レベルを調べるターゲットパネル。 MPL、JAK2、CALRに影響を及ぼす変異に焦点を当てたターゲット遺伝子パネル、シンプルなシングルチューブワークフロー
ハンズオンタイム 約3時間 <1.5時間 約3時間
インプット量 DNA 10~80 ng(推奨量20 ng) 20 ngの高品質DNA、10 ngの高品質RNA
(プールあたり10ngを推奨)
DNA 10~80 ng(推奨量20 ng)
システム MiSeq System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 550Dx in Research Mode, MiSeq i100 Plusシステム, MiSeq i100システム MiSeq System, MiniSeq System MiSeq System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 550Dx in Research Mode, MiSeq i100 Plusシステム, MiSeq i100システム
作用機序 タイルアンプリコンを使用したマルチプレックスPCR法 タイルアンプリコンを使用したマルチプレックスPCR法
手法 ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス
核酸の種類 DNA DNA, RNA DNA
アンプリコン数 1プール、766アンプリコン 3遺伝子、7アンプリコン
反応数 24回 1キットあたりの反応48回
オンターゲットリード 99.6% ± 0.2% 99.9% ± 0.0%
対応サンプルタイプ 血液, 少量インプットサンプル 血液, FFPE非対応, 骨髄 血液, 少量インプットサンプル
生物種カテゴリー ヒト ヒト ヒト
ターゲットインサートサイズ 平均:215 bp 平均:167 bp
テクノロジー シーケンス シーケンス シーケンス
均一性 96.8% ±1.0% 100%
バリアントクラス 1塩基変異(SNV), 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV) 1塩基変異多型(SNP), 融合遺伝子, 体細胞バリアント, 挿入 欠失(Indel) 体細胞バリアント, 1塩基変異(SNV), 挿入 欠失(Indel)

遺伝子リスト

Pillar oncoReveal Myeloid Panelは、DNA由来の58遺伝子を解析します。

パネル仕様

Pillar oncoReveal Myeloid Panelは、血液由来DNAのバリアントを解析するための58遺伝子を対象としたパネル仕様

Pillar® oncoReveal™ Myeloid Panel (24 reactions)

HDA-MY-1001-24

oncoReveal™ Myeloid Panel

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Pillar Index Kit A (32 reactions)

IDX-PI-1001-96

インデックスPI501-8、PI701-4(32の組み合わせ、96反応)

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Pillar Index Kit D (96 reactions)

IDX-PI-1004-192

キットD、インデックスPI501-8、PI701-12

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製品名

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MiSeq i100シリーズのご購入

操作の簡素化、高度なケミストリー、オンボードインフォマティクスにより、使いやすく、高速で、幅広いアプリケーションをサポートする柔軟性の高い装置を提供します。

Illumina Connected Analyticsのご購入

Illumina Connected Analyticsでインフォマティクスを活用して科学的洞察を促進しましょう。価格、サブスクリプションなどについては、弊社までお問い合わせください。

MiSeq i100 シリーズ用‭ 試薬キット

MiSeq i100シリーズ用試薬は、使いやすいカートリッジと、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフロー セル構成を備えています。

Pillar oncoReveal Essential MPN Panel

MPL、JAK2、CALR遺伝子の主要な変異をターゲットにしたロバストなアッセイです。シングルチューブのSLIMampワークフローを使用してライブラリー調製にかかる時間とターンアラウンドタイムを短縮します。

TruSight RNA Fusion Panel

ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)およびその他のがん研究サンプルからの507の遺伝子カバレッジを提供する、包括的な遺伝子融合検出を提供。

TruSight RNA Pan-Cancer Panel

血液、骨髄、ホルマリン固定パラフィン包埋組織など、多種多様なRNAサンプルタイプを用いる遺伝子発現・バリアント検出・融合検出の研究のために、1,385のがん遺伝子をターゲットとします。

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