Pillar® oncoReveal™ Myeloid Panel

DNAとRNAのコンテンツを組み合わせた78遺伝子の腫瘍横断型パネルです。シングルチューブSLIMamp™ ワークフローを使用して、ライブラリー調製とターンアラウンドタイムを高速化します。

約6.5時間

アッセイ時間

約3時間

ハンズオンタイム

DNA 10~80 ng(20 ngを推奨)

インプット量

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概要

oncoReveal™ Myeloid PanelはDNA NGSシーケンスパネルです。効率的なシングルチューブターゲット濃縮用タイル状アンプリコンベースのライブラリー調製ケミストリーである独自のStem-Loop Inhibition-Mediated Amplification(SLIMamp®)テクノロジーを採用しています。

  • 組織内のあらゆるNGSラボで実施が可能なシングルチューブのタイル状増幅により、サンプルと結果の管理を維持

  • DNAインプットが限られていたりサンプル品質が低い場合でも、UIDなしでVAF 1%のバリアント検出を実現

  • ラボの効率を改善し、ノーコール、検査の繰り返し、解釈の難解さにまつわる意思決定の必要性を低減

  • 8時間未満でDNAからシーケンサーへ


仕様


必要な製品

Pillar® oncoReveal™ パネルには、Pillarインデックスキットが必要になります。ご希望の反応回数を選択してください。

/

アプリケーション

ワークフローの例

1
ライブラリー調製

Pillar® oncoReveal™ Myeloid Panel

2
シーケンス

ドキュメント

製品資料

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Pillar® oncoReveal™ Myeloid Panel AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel TruSight Myeloid Sequencing Panel
Cancer type Pan-Cancer, Solid Tumor Hematologic Hematologic
Method Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing
Specialized sample types Blood, Low-Input Samples Blood, Not FFPE-Compatible, Bone Marrow Not FFPE-Compatible
Variant class Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Somatic variants, Insertions-deletions (indels) Somatic variants, Insertions-deletions (indels)
アッセイ時間 約6.5時間 5.5~7.5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) 8時間
アンプリコン数 1プール、766アンプリコン
インプット量 DNA 10~80 ng(20 ngを推奨) 20 ngの高品質DNA、10 ngの高品質RNA
(プールあたり10ngを推奨)
50 ng
オンターゲットリード 99.6% ± 0.2%
システム MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 550Dx in Research Mode MiSeq Desktop Sequencer, MiniSeqシステム MiSeq Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 500 Desktop Sequencer
ターゲットインサートサイズ 平均:215 bp
テクノロジー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー
ハンズオンタイム 約3時間 <1.5時間 3時間
作用機序 タイルアンプリコンを使用したマルチプレックスPCR法
反応数 24回
核酸の種類 DNA DNA, RNA DNA
生物種 ヒト ヒト ヒト

遺伝子リスト

パネル仕様

oncoReveal™ Myeloid Panel

HDA-MY-1001-24

oncoReveal™ Myeloid Panel

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Indices PI501-8, PI701-4 (32 combinations, 96 reactions)

IDX-PI-1001-96

Indices PI501-8, PI701-4 (32 combinations, 96 reactions)

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Kit D, indices PI501-8, PI701-12

IDX-PI-1004-192

Kit D, indices PI501-8, PI701-12

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