ライブラリー調製とターンアラウンドタイムを高速化するシングルチューブSLIMamp とワークフローを利用した、DNAコンテンツを組み合わせた58遺伝子汎がんパネル。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
oncoReveal™ Myeloid PanelはDNA NGSシーケンスパネルです。効率的なシングルチューブターゲット濃縮用タイル状アンプリコンベースのライブラリー調製ケミストリーである独自のStem-Loop Inhibition-Mediated Amplification（SLIMamp®）テクノロジーを採用しています。
| アッセイ時間 | 約6.5時間 |
|---|---|
| Cancer type | Pan-cancer, Solid tumor |
| 説明 | 58遺伝子アンプリコンベースのDNAパネル、シンプルなシングルチューブワークフロー |
| ハンズオンタイム | 約3時間 |
| インプット量 | DNA 10～80 ng（20 ngを推奨） |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 550Dx in Research Mode |
| 作用機序 | タイルアンプリコンを使用したマルチプレックスPCR法 |
| 手法 | Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing |
| Nucleic acid type | DNA |
| アンプリコン数 | 1プール、766アンプリコン |
| 反応数 | 24回 |
| オンターゲットリード | 99.6% ± 0.2% |
| サンプルタイプ | Blood, Low-input samples |
| Species category | ヒト |
| ターゲットインサートサイズ | 平均：215 bp |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| 均一性 | 96.8% ±1.0% |
| バリアントクラス | Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
Pillar® oncoReveal™ パネルには、Pillarインデックスキットが必要になります。ご希望の反応回数を選択してください。
Pillar® oncoReveal™ Myeloid Panel
| Pillar® oncoReveal™ Myeloid Panel | AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel | TruSight Myeloid Sequencing Panel | |
|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | 約6.5時間 | 5.5～7.5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） | 8時間 |
| Cancer type | Pan-cancer, Solid tumor | Hematologic | Hematologic |
| 説明 | 58遺伝子アンプリコンベースのDNAパネル、シンプルなシングルチューブワークフロー | 骨髄がんに関連する40種のDNA遺伝子、29種のRNA融合ドライバー遺伝子、5種の遺伝子発現レベルを調べるターゲットパネル。 | 骨髄性悪性腫瘍における体細胞変異検出研究用。 |
| ハンズオンタイム | 約3時間 | <1.5時間 | 3時間 |
| インプット量 | DNA 10～80 ng（20 ngを推奨） |
20 ngの高品質DNA、10 ngの高品質RNA （プールあたり10ngを推奨） |
50 ng |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 550Dx in Research Mode | MiSeq Desktop Sequencer, MiniSeqシステム | MiSeq Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 500 Desktop Sequencer |
| 作用機序 | タイルアンプリコンを使用したマルチプレックスPCR法 | ||
| 手法 | Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing | Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing, Targeted RNA sequencing | Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing |
| Nucleic acid type | DNA | DNA, RNA | DNA |
| アンプリコン数 | 1プール、766アンプリコン | ||
| 反応数 | 24回 | ||
| オンターゲットリード | 99.6% ± 0.2% | ||
| サンプルタイプ | Blood, Low-input samples | Blood, Not FFPE-compatible, Bone marrow | Not FFPE-compatible, Not FFPE-compatible |
| Species category | ヒト | ヒト | ヒト |
| ターゲットインサートサイズ | 平均：215 bp | ||
| テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー |
| 均一性 | 96.8% ±1.0% | ||
| バリアントクラス | Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Somatic variants, Insertions-deletions (indels) | Somatic variants, Insertions-deletions (indels) |
遺伝子リスト
パネル仕様
Pillar® oncoReveal™ Myeloid Panel (24 reactions)
HDA-MY-1001-24
Pillar Index Kit A (32 reactions)
IDX-PI-1001-96
Pillar Index Kit A (32 reactions)
Pillar Index Kit D (96 reactions)
IDX-PI-1004-192
Pillar Index Kit D (96 reactions)
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単価
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
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