MPL、JAK2、CALR遺伝子の主要な変異をターゲットにしたロバストなアッセイです。シングルチューブのSLIMampワークフローを使用してライブラリー調製にかかる時間とターンアラウンドタイムを短縮します。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
The Pillar oncoReveal Essential MPN Panelは、MPL、JAK2、CALR遺伝子内の重要な変異を同時に検査するロバストなアッセイです。このアッセイは、効率的なシングルチューブターゲット濃縮を行うタイル状アンプリコンベースのライブラリー調製手法である独自のStem Loop Inhibition-Mediated Amplification（SLIMamp）テクノロジーを採用しています。
| Assay time | 48 hours sample to report |
|---|---|
| がんの種類 | 血液学 |
| 説明 | MPL、JAK2、CALRに影響を及ぼす変異に焦点を当てたターゲット遺伝子パネル、シンプルなシングルチューブワークフロー |
| ハンズオンタイム | 約3時間 |
| Input quantity | 10–80 ng DNA (20 ng recommended) |
| システム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, MiSeqDx システム 研究（RUO）モード, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム |
| 作用機序 | タイルアンプリコンを使用したマルチプレックスPCR法 |
| 手法 | ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス |
| 核酸の種類 | DNA |
| アンプリコン数 | 3遺伝子、7アンプリコン |
| 反応数 | 1キットあたりの反応48回 |
| オンターゲットリード | 99.9% ± 0.0% |
| 対応サンプルタイプ | 血液, 少量インプットサンプル |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| ターゲットインサートサイズ | 平均：167 bp |
| テクノロジー | シーケンス |
| 均一性 | 100% |
| バリアントクラス | 体細胞バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel） |
Pillar oncoRevealパネルには、Pillarインデックスキットが必要です。ご希望の反応回数を選択してください。
Pillar oncoReveal Essential MPN Panel
| Pillar oncoReveal Essential MPN Panel | AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel | Pillar oncoReveal Myeloid Panel | |
|---|---|---|---|
| Assay time | 48 hours sample to report | 5.5～7.5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） | 48 hours sample to report |
| がんの種類 | 血液学 | 血液学 | 血液学 |
| 説明 | MPL、JAK2、CALRに影響を及ぼす変異に焦点を当てたターゲット遺伝子パネル、シンプルなシングルチューブワークフロー | 骨髄がんに関連する40種のDNA遺伝子、29種のRNA融合ドライバー遺伝子、5種の遺伝子発現レベルを調べるターゲットパネル。 | 58遺伝子アンプリコンベースのDNAパネル、シンプルなシングルチューブワークフロー |
| ハンズオンタイム | 約3時間 | <1.5時間 | 約3時間 |
| Input quantity | 10–80 ng DNA (20 ng recommended) |
20 ngの高品質DNA、10 ngの高品質RNA （プールあたり10ngを推奨） |
10–80 ng DNA (20 ng recommended) |
| システム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, MiSeqDx システム 研究（RUO）モード, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム | MiSeqシステム, MiniSeq System | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, MiSeqDx システム 研究（RUO）モード, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム |
| 作用機序 | タイルアンプリコンを使用したマルチプレックスPCR法 | タイルアンプリコンを使用したマルチプレックスPCR法 | |
| 手法 | ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス | ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス | ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス |
| 核酸の種類 | DNA | DNA, RNA | DNA |
| アンプリコン数 | 3遺伝子、7アンプリコン | 1プール、766アンプリコン | |
| 反応数 | 1キットあたりの反応48回 | 24回 | |
| オンターゲットリード | 99.9% ± 0.0% | 99.6% ± 0.2% | |
| 対応サンプルタイプ | 血液, 少量インプットサンプル | 血液, FFPE非対応, 骨髄 | 血液, 少量インプットサンプル |
| 生物種カテゴリー | ヒト | ヒト | ヒト |
| ターゲットインサートサイズ | 平均：167 bp | 平均：215 bp | |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
| 均一性 | 100% | 96.8% ±1.0% | |
| バリアントクラス | 体細胞バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel） | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, 体細胞バリアント, 挿入 欠失（Indel） | 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） |
遺伝子リスト
Pillar oncoReveal Essential MPN Panel は、MPL、JAK2、およびCALR遺伝子の6つのエクソンを解析します。
パネル仕様
Pillar oncoReveal Essential MPN Panel は、血液由来DNAからMPL、JAK2、CALR のバリアントを解析するための仕様です。
Pillar® oncoReveal™ Essential MPN Panel (48 reactions)
HDA-MY-1002-48
Pillar® oncoReveal™ Essential MPN Panel (48 reactions)
Pillar Index Kit A (32 reactions)
IDX-PI-1001-96
Pillar Index Kit A (32 reactions)
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Pillar Index Kit D (96 reactions)
IDX-PI-1004-192
Pillar Index Kit D (96 reactions)
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MiSeq i100シリーズ用試薬は、使いやすいカートリッジと、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフロー セル構成を備えています。
DNAコンテンツを組み合わせた58遺伝子の腫瘍横断型パネルです。シングルチューブSLIMampワークフローを使用して、ライブラリー調製とターンアラウンドタイムを高速化します。
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）およびその他のがん研究サンプルからの507の遺伝子カバレッジを提供する、包括的な遺伝子融合検出を提供。
血液、骨髄、ホルマリン固定パラフィン包埋組織など、多種多様なRNAサンプルタイプを用いる遺伝子発現・バリアント検出・融合検出の研究のために、1,385のがん遺伝子をターゲットとします。
固形腫瘍との関連が判明している52種の遺伝子を調べるターゲットDNA／RNA研究パネル。
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