MiSeqシステムの仕様

MiSeqは、高いデータ品質を維持しながら、短いシーケンス実行時間と長いリード長を提供します

MiSeq仕様

  MiSeq試薬キットv2 MiSeq Reagent Kit v3
リード長 1 × 36 bp 2 × 25 bp 2 × 150 bp 2 × 250 bp 2 × 75 bp 2 × 300 bp
合計時間* 約4時間 ~5.5時間 ~24時間 ~39時間 ~21時間 ~56時間
出力 540~610 Mb 750~850 Mb 4.5~5.1 Gb 7.5~8.5 Gb 3.3~3.8 Gb 13.2~15Gb
  MiSeq Reagent Kit v2 Micro MiSeq Reagent Kit v2 Nano
リード長 2 × 150 bp 2 × 250 bp 2 × 150 bp
合計時間* ~19時間 ~28時間 ~17時間
出力 1.2 Gb 500 Mb 300 Mb

* 合計時間には、デュアルサーフェススキャンが可能なMiSeqシステムのクラスター生成、シーケンス、およびベースコーリングが含まれます。

  MiSeq試薬キットv2 MiSeq Reagent Kit v3 MiSeq Reagent Kit v2 Micro MiSeq Reagent Kit v2 Nano
シングルリード 1,200万~1,500万 2,200万~2,500万 400万 100万
ペアエンドリード 2,400万~3,000万 4,400万~5,000万 800万 200万

** 対応するクラスター密度(865~965 k/mm v2ケミストリー用のフィルターを通過する2クラスター、および1200-1400 k/mm v3ケミストリー用のフィルターを通過する2クラスター)でイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく仕様をインストールします。実際の性能パラメーターは、サンプルタイプ、サンプル品質、フィルターを通過するクラスターによって異なる場合があります。

MiSeq試薬キットv2 MiSeq Reagent Kit v3
> 1 × 36 bpでQ30よりQ30%高い塩基 > 2 × 75 bpでQ30より85%高い塩基
> 2 × 25 bpでQ30より90%高い塩基 > 2 × Q30でQ30より70%高い塩基
> 2 × 150 bpでQ30より80%高い塩基  
> 2 × 250 bpでQ30より75%高い塩基  

† クオリティスコア(Qスコア)は、ベースコールにおけるエラー確率の予測指標です。Q30超の塩基のパーセンテージは全体のランの平均です。

MiSeqシステム仕様書

MiSeqシステム仕様書

MiSeqシステムは、ほぼすべてのラボ環境に適合する小さなフットプリントでDNAから結果までのシーケンスソリューションを提供します。

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1塩基合成反応(SBS)テクノロジー

MiSeqシステムでは、イルミナの実績あるSBSテクノロジーを採用しているため、さまざまなアプリケーションで傑出した高品質かつ高精度なデータが得られます。 SBSでは、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法により、伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で検出します。

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ペアエンドシーケンステクノロジー

ペアエンドシーケンスでは、DNA断片の両端をシーケンスできます。 各ペアリード間の距離は既知であるため、この情報をアライメントアルゴリズムで使用してリードをマッピングできます。 このテクノロジーは、シーケンスが困難なゲノムの反復領域間で特に有効です。

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