MiSeqシステムの仕様

MiSeqは、高いデータ品質を維持しながら、シーケンスラン時間の短縮と長いリード長を実現します

MiSeq仕様

 MiSeq Reagent Kit v2MiSeq Reagent Kit v3
リード長36bp × 125bp × 2150bp x 2250bp x 275bp × 2300bp x 2
ラン時間*~4時間~5.5時間~24時間~39時間~21時間~56時間
出力540~610Mb750~850Mb4.5~5.1Gb7.5~8.5Gb3.3~3.8Gb13.2~15Gb
 MiSeq Reagent Kit v2 MicroMiSeq Reagent Kit v2 Nano
リード長150bp x 2250bp x 2150bp x 2
ラン時間*~19時間~28時間~17時間
出力1.2Mb500Mb300Mb

* ラン時間には、デュアルサーフェススキャン対応のMiSeqシステムにおけるクラスター形成、シーケンス、ベースコールまでが含まれます。

 MiSeq Reagent Kit v2MiSeq Reagent Kit v3MiSeq Reagent Kit v2 MicroMiSeq Reagent Kit v2 Nano
シングルリード1,200万~1,500万2,200万~2,500万400万100万
ペアエンドリード数2,400万~3,000万4,400万~5,000万800万200万

** 据付けはイルミナPhiXライブラリーを使用し、サポート内のパスフィルターのクラスター密度(MiSeq v2試薬キットの場合は865-965k/mm2、MiSeq v3試薬キットの場合は1200-1400k/mm2)で実施します。 実際のパフォーマンス項目は、サンプルの種類、クオリティ、そしてパスフィルタークラスターに依存します。

MiSeq Reagent Kit v2MiSeq Reagent Kit v3
36bp x 1の場合、Q30以上の塩基が90%以上75bp x 2の場合、Q30以上の塩基が85%以上
25bp x 2の場合、Q30以上の塩基が90%以上300bp x 2の場合、Q30以上の塩基が70%以上
150bp x 2の場合、Q30以上の塩基が80%以上 
250bp x 2の場合、Q30以上の塩基が75%以上 

† クオリティスコア(Qスコア)は、ベースコールにおけるエラー確率の予測指標です。 Q30以上の割合はラン全体の平均値を示します。

MiSeqシステムのデータシート

MiSeqシステムのデータシート

MiSeqシステムはDNAから結果までのシーケンスソリューションで、どんなラボ環境にも設置できるコンパクトな設計です。

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1塩基合成反応(SBS)テクノロジー

MiSeqシステムでは、イルミナの実績あるSBSテクノロジーを採用しているため、さまざまなアプリケーションで傑出した高品質かつ高精度なデータが得られます。 SBSでは、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法により、伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で検出します。

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ペアエンドシーケンステクノロジー

ペアエンドシーケンスでは、DNA断片の両端をシーケンスできます。 各ペアリード間の距離は既知であるため、この情報をアライメントアルゴリズムで使用してリードをマッピングできます。 このテクノロジーは、シーケンスが困難なゲノムの反復領域間で特に有効です。

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