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MiSeqシーケンスシステムの仕様

高性能をシンプルに

短いランタイム、調整可能なリード長、複数のフローセルオプションを、1台のコンパクトなベンチトップシーケンスシステムに搭載しています

MiSeqシステムレンダリング

様々なリード長用フローセル当たりのアウトプット a,b

MiSeqシーケンスシステム

リード長 MiSeq Reagent Nano Kit v2 MiSeq Reagent Micro Kit v2 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
1 × 36 bp 該当なし 該当なし 540～610 Mb N/A
2 × 25 bp 該当なし 該当なし 750～850 Mb N/A
2 x 75 bp 該当なし 該当なし 該当なし 3.3～3.8 Gb
2 x 150 bp 300 Mb 1.2 Gb 4.5～5.1 Gb N/A
2 x 250 bp 500 Mb N/A 7.5～8.5 Gb N/A
2 x 300 bp 該当なし 該当なし 該当なし 13.2～15 Gb

a. MiSeqシステムはシングルフローセルを実行します。フローセルごとの出力とランごとの出力は同じです。 

b. サポートされているクラスター密度でイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づいた仕様。

フローセルあたりのパスフィルターリード数a

MiSeqシーケンスシステム

  MiSeq Reagent Nano Kit v2 MiSeq Reagent Micro Kit v2 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
シングルエンドリード 1M 4M 12～15M 22–25M
ペアエンドリード 2M 8M 24～30M 44–50M

a. v2ケミストリーのフィルター通過クラスター密度865～965 k/mm2、およびv3ケミストリーのパスフィルタークラスター密度1200～1400 k/mm2をサポートするイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく仕様をインストールします。実際のパフォーマンスパラメータは、ライブラリーの種類、ライブラリーの品質、クラスターパスフィルターによって異なる場合があります。

クオリティスコアa

MiSeqシーケンスシステム

リード長 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
2 × 25 bp Q30以上の塩基が90%超 N/A
2 x 75 bp N/A Q30以上の塩基が85%超
2 x 150 bp Q30以上の塩基が80%超 N/A
2 x 250 bp Q30以上の塩基が75%超 N/A
2 x 300 bp N/A Q30以上の塩基が70%超

a. Q30超の塩基のパーセンテージは全体のランの平均です。

ランタイムa

MiSeqシーケンスシステム

リード長 MiSeq Reagent Nano Kit v2 MiSeq Reagent Micro Kit v2 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
2 × 25 bp 該当なし 該当なし 約5.5時間 N/A
2 x 75 bp 該当なし 該当なし 該当なし 約21時間
2 x 150 bp 約17時間 約19時間 約24時間 N/A
2 x 250 bp 約28時間 N/A 約39時間 N/A
2 x 300 bp 該当なし 該当なし 該当なし 約56時間

a. 合計時間はMiSeqシステム上で実施するクラスター形成、シーケンス、ベースコーリングを含みます（デュアルサーフェススキャン）。

装置の仕様

MiSeq system specifications

MiSeqDx 装置仕様書

  • 発光ダイオード（LED）
    波長
    520 nm、660 nm
  • 寸法
    幅ｘ奥行ｘ高さ
    68.6cm ｘ 56.5cm ｘ 52.3cm
    （27.0インチ ｘ 22.2インチ ｘ 20.6インチ）
  • 本体重量
    57.2 kg（126 lb）
  • 梱包重量
    93.6 kg（206 lb）
スペックシート（PDF）で詳細を確認する

主要なテクノロジー

Sequence by Synthesis（SBS）ケミストリー

MiSeq システムは、実績のある Illumina のSequence by Synthesis (SBS) 化学を活用して、正確なデータとロバストな性能を実現します。SBS法は、可逆的ターミネーター蛍光標識ヌクレオチドを使用して、成長するDNA鎖に取り込まれる塩基を検出し、何十億もの配列を並行して読み取ります。

ペアエンドシーケンス

MiSeqシステムには、ペアエンドシーケンスが組み込まれており、DNA断片の両端をシーケンスすることができます。各ペアリード間の距離は既知であるため、アライメントアルゴリズムは、この情報を使ってリードをマッピングすることができます。これは、シーケンスが困難なゲノムの反復領域で特に役立ちます。