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MiSeqシーケンスシステムの仕様

高性能でシンプルに

1つのコンパクトなベンチトップシーケンスシステムで、短いランタイム、調節可能なリード長、複数のフローセルオプションを実現

MiSeq system render

さまざまなリード長のフローセルあたりの出力a,b

MiSeqシーケンスシステム

リード長 MiSeq Reagent Nano Kit v2 MiSeq Reagent Micro Kit v2 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
1 × 36 bp N/A N/A 540～610 Mb N/A
2 × 25 bp N/A N/A 750～850 Mb N/A
2 × 75 bp N/A N/A N/A 3.3～3.8 Gb
2 × 150 bp 300 Mb 1.2 Gb 4.5～5.1 Gb N/A
2 × 250 bp 500 Mb N/A 7.5～8.5 Gb N/A
2 × 300 bp N/A N/A N/A 13.2～15Gb

a. MiSeqシステムは1つのフローセルを実行します。フローセルごとの出力とランごとの出力は同じです。 

b. サポートされているクラスター密度でイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づいた仕様。

フローセルごとのパスフィルターの読み取りa

MiSeqシーケンスシステム

  MiSeq Reagent Nano Kit v2 MiSeq Reagent Micro Kit v2 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
シングルエンドリード 1M 4M 12–15M 2,200万～2,500万
ペアエンドリード 2M 8M 24–30M 4,400万～5,000万

a. v2ケミストリー用のフィルターを通過する865～965 k/mm2のクラスターとv3ケミストリー用のフィルターを通過する1200～1400 k/mm2のクラスターで、サポートされるクラスター密度でイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づいた仕様をインストールします。実際のパフォーマンスパラメータは、ライブラリーの種類、ライブラリーの品質、クラスターパスフィルターによって異なる場合があります。

クオリティスコアa

MiSeqシーケンスシステム

リード長 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
2 × 25 bp > 90%の塩基がQ30より高い N/A
2 × 75 bp N/A > Q30より85%高い塩基
2 × 150 bp > Q30より80%高い塩基 N/A
2 × 250 bp Q30以上の塩基が75%超 N/A
2 × 300 bp N/A > 70%の塩基がQ30より高い

a. Q30超の塩基のパーセンテージは全体のランの平均です。

ランタイムa

MiSeqシーケンスシステム

リード長 MiSeq Reagent Nano Kit v2 MiSeq Reagent Micro Kit v2 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
2 × 25 bp N/A N/A ～5.5時間 N/A
2 × 75 bp N/A N/A N/A 約21時間
2 × 150 bp 約17時間 約19時間 ～24時間 N/A
2 × 250 bp ～28時間 N/A 約39時間 N/A
2 × 300 bp N/A N/A N/A ～56時間

a. 合計時間には、デュアルサーフェーススキャニングが可能なMiSeqシステム上でのクラスター生成、シーケンス、ベースコーリングが含まれます。

装置の仕様

MiSeq system specifications

MiSeq装置の仕様

  • 発光ダイオード（LED）
    波長
    520 nm、660 nm
  • 寸法
    幅 x 奥行 x 高さ
    68.6 cm × 56.5 cm × 52.3 cm
    （27.0インチ × 22.2インチ × 20.6インチ）
  • 乾燥重量
    57.2 kg（126 lb）
  • 木枠重量
    93.6 kg（206 lb）
詳細仕様書シートを見る（PDF）

主要なテクノロジー

Sequence by Synthesis（SBS）ケミストリー

MiSeqシステムは、実績のあるイルミナの合成シーケンサー（SBS）ケミストリーを活用して、正確なデータと堅牢な性能を提供します。SBS法は、可逆的ターミネーター蛍光標識ヌクレオチドを使用して、成長するDNA鎖に取り込まれる塩基を検出し、何十億もの配列を並行して読み取ります。

ペアエンドシーケンス

MiSeqシステムにはペアエンドシーケンスが組み込まれており、DNA断片の両端をシーケンスすることができます。各ペアリード間の距離は既知であるため、アライメントアルゴリズムは、この情報を使ってリードをマッピングすることができます。これは、シーケンスが困難なゲノムの反復領域で特に役立ちます。