MiSeqシーケンスシステムの仕様

高性能をシンプルに

短いランタイム、調整可能なリード長、複数のフローセルオプションを、1台のコンパクトなベンチトップシーケンスシステムに搭載しています

MiSeq system render

様々なリード長用フローセル当たりのアウトプット ^a,b

MiSeqシーケンスシステム

リード長	MiSeq Reagent Nano Kit v2	MiSeq Reagent Micro Kit v2	MiSeq Reagent Kit v2	MiSeq Reagent Kit v3
1 × 36 bp	該当なし	該当なし	540～610 Mb	該当なし
2 × 25 bp	該当なし	該当なし	750～850 Mb	該当なし
2 × 75 bp	該当なし	該当なし	該当なし	3.3～3.8 Gb
2 x 150 bp	300 Mb	1.2 Gb	4.5～5.1 Gb	該当なし
2 x 250 bp	500 Mb	該当なし	7.5～8.5 Gb	該当なし
2 x 300 bp	該当なし	該当なし	該当なし	13.2～15 Gb

a. MiSeqシステムはシングルフローセルを実行します。フローセルごとの出力とランごとの出力は同じです。

b. サポートされているクラスター密度でイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づいた仕様。

フローセルあたりのパスフィルターリード数^a

MiSeqシーケンスシステム

	MiSeq Reagent Nano Kit v2	MiSeq Reagent Micro Kit v2	MiSeq Reagent Kit v2	MiSeq Reagent Kit v3
シングルエンドリード	1M	4M	12～15M	22～25M
ペアエンドリード	2M	8M	24～30M	44～50M

a. v2ケミストリーのフィルター通過クラスター密度865～965 k/mm2、およびv3ケミストリーのパスフィルタークラスター密度1200～1400 k/mm2をサポートするイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく仕様をインストールします。実際のパフォーマンスパラメータは、ライブラリーの種類、ライブラリーの品質、クラスターパスフィルターによって異なる場合があります。

クオリティスコア^a

MiSeqシーケンスシステム

リード長	MiSeq Reagent Kit v2	MiSeq Reagent Kit v3
2 × 25 bp	Q30以上の塩基が90%超	該当なし
2 × 75 bp	該当なし	Q30以上の塩基が85%超
2 x 150 bp	Q30以上の塩基が80%超	該当なし
2 x 250 bp	Q30以上の塩基が75%超	該当なし
2 x 300 bp	該当なし	Q30以上の塩基が70%超

a. Q30超の塩基のパーセンテージは全体のランの平均です。

ランタイム^a

MiSeqシーケンスシステム

リード長	MiSeq Reagent Nano Kit v2	MiSeq Reagent Micro Kit v2	MiSeq Reagent Kit v2	MiSeq Reagent Kit v3
2 × 25 bp	該当なし	該当なし	約5.5時間	該当なし
2 × 75 bp	該当なし	該当なし	該当なし	約21時間
2 x 150 bp	約17時間	約19時間	約24時間	該当なし
2 x 250 bp	約28時間	該当なし	約39時間	該当なし
2 x 300 bp	該当なし	該当なし	該当なし	約56時間

a. 合計時間はMiSeqシステム上で実施するクラスター形成、シーケンス、ベースコーリングを含みます（デュアルサーフェススキャン）。

装置の仕様

MiSeq system specifications

MiSeqDx 装置仕様書

発光ダイオード（LED）
波長

520 nm、660 nm
寸法
幅ｘ奥行ｘ高さ

68.6cm ｘ 56.5cm ｘ 52.3cm
（27.0インチｘ 22.2インチｘ 20.6インチ）
本体重量

57.2 kg（126 lb）
梱包重量

93.6 kg（206 lb）

詳細仕様書シートを見る（PDF）

主要なテクノロジー

Sequence by Synthesis（SBS）ケミストリー

MiSeq システムは、実績のある Illumina のSequence by Synthesis (SBS) 化学を活用して、正確なデータとロバストな性能を実現します。SBS法は、可逆的ターミネーター蛍光標識ヌクレオチドを使用して、成長するDNA鎖に取り込まれる塩基を検出し、何十億もの配列を並行して読み取ります。

ペアエンドシーケンス

MiSeqシステムには、ペアエンドシーケンスが組み込まれており、DNA断片の両端をシーケンスすることができます。各ペアリード間の距離は既知であるため、アライメントアルゴリズムは、この情報を使ってリードをマッピングすることができます。これは、シーケンスが困難なゲノムの反復領域で特に役立ちます。