MiSeqシーケンスシステムの仕様

高性能でシンプルに

1つのコンパクトなベンチトップシーケンスシステムで、短いランタイム、調節可能なリード長、複数のフローセルオプションを実現

MiSeq system render

様々なリード長用フローセル当たりのアウトプット ^a,b

MiSeqシーケンスシステム

リード長	MiSeq Reagent Nano Kit v2	MiSeq Reagent Micro Kit v2	MiSeq Reagent Kit v2	MiSeq Reagent Kit v3
1 × 36 bp	該当なし	該当なし	540～610 Mb	該当なし
2 × 25 bp	該当なし	該当なし	750～850 Mb	該当なし
2 × 75 bp	該当なし	該当なし	該当なし	3.3～3.8 Gb
2 x 150 bp	300 Mb	1.2 Gb	4.5～5.1 Gb	該当なし
2 x 250 bp	500 Mb	該当なし	7.5～8.5 Gb	該当なし
2 x 300 bp	該当なし	該当なし	該当なし	13.2～15 Gb

a. MiSeqシステムはシングルフローセルを実行します。フローセルごとの出力とランごとの出力は同じです。

b. サポートされているクラスター密度でイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づいた仕様。

フローセルあたりのパスフィルターリード数^a

MiSeqシーケンスシステム

	MiSeq Reagent Nano Kit v2	MiSeq Reagent Micro Kit v2	MiSeq Reagent Kit v2	MiSeq Reagent Kit v3
シングルエンドリード	1M	4M	12–15M	22–25M
ペアエンドリード	2M	8M	24–30M	44–50M

a. v2ケミストリーのフィルター通過クラスター密度865～965 k/mm2、およびv3ケミストリーのパスフィルタークラスター密度1200～1400 k/mm2をサポートするイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく仕様をインストールします。実際のパフォーマンスパラメータは、ライブラリーの種類、ライブラリーの品質、クラスターパスフィルターによって異なる場合があります。

クオリティスコア^a

MiSeqシーケンスシステム

リード長	MiSeq Reagent Kit v2	MiSeq Reagent Kit v3
2 × 25 bp	Q30以上の塩基が90%超	該当なし
2 × 75 bp	該当なし	Q30以上の塩基が85%超
2 x 150 bp	Q30以上の塩基が80%超	該当なし
2 x 250 bp	Q30以上の塩基が75%超	該当なし
2 x 300 bp	該当なし	Q30以上の塩基が70%超

a. Q30超の塩基のパーセンテージは全体のランの平均です。

ランタイム^a

MiSeqシーケンスシステム

リード長	MiSeq Reagent Nano Kit v2	MiSeq Reagent Micro Kit v2	MiSeq Reagent Kit v2	MiSeq Reagent Kit v3
2 × 25 bp	該当なし	該当なし	約5.5時間	該当なし
2 × 75 bp	該当なし	該当なし	該当なし	約21時間
2 x 150 bp	約17時間	約19時間	約24時間	該当なし
2 x 250 bp	約28時間	該当なし	約39時間	該当なし
2 x 300 bp	該当なし	該当なし	該当なし	約56時間

a. 合計時間はMiSeqシステム上で実施するクラスター形成、シーケンス、ベースコーリングを含みます（デュアルサーフェススキャン）。

装置の仕様

MiSeq system specifications

MiSeqDx 装置仕様書

発光ダイオード（LED）
波長

520 nm、660 nm
寸法
幅ｘ奥行ｘ高さ

68.6cm ｘ 56.5cm ｘ 52.3cm
（27.0インチｘ 22.2インチｘ 20.6インチ）
本体重量

57.2 kg（126 lb）
梱包重量

93.6 kg（206 lb）

詳細仕様書シートを見る（PDF）

主要なテクノロジー

Sequence by Synthesis（SBS）ケミストリー

MiSeq システムは、実績のある Illumina のSequence by Synthesis (SBS) 化学を活用して、正確なデータとロバストな性能を実現します。SBS法は、可逆的ターミネーター蛍光標識ヌクレオチドを使用して、成長するDNA鎖に取り込まれる塩基を検出し、何十億もの配列を並行して読み取ります。

ペアエンドシーケンス

MiSeqシステムには、ペアエンドシーケンスが組み込まれており、DNA断片の両端をシーケンスすることができます。各ペアリード間の距離は既知であるため、アライメントアルゴリズムは、この情報を使ってリードをマッピングすることができます。これは、シーケンスが困難なゲノムの反復領域で特に役立ちます。