MiSeq試薬キットv2 | MiSeq Reagent Kit v3 | |||||
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リード長 | 1 × 36 bp | 2 × 25 bp | 2 × 150 bp | 2 × 250 bp | 2 × 75 bp | 2 × 300 bp |
合計時間* | 約4時間 | ~5.5時間 | ~24時間 | ~39時間 | ~21時間 | ~56時間 |
出力 | 540~610 Mb | 750~850 Mb | 4.5~5.1 Gb | 7.5~8.5 Gb | 3.3~3.8 Gb | 13.2~15Gb |
MiSeq Reagent Kit v2 Micro | MiSeq Reagent Kit v2 Nano | ||
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リード長 | 2 × 150 bp | 2 × 250 bp | 2 × 150 bp |
合計時間* | ~19時間 | ~28時間 | ~17時間 |
出力 | 1.2 Gb | 500 Mb | 300 Mb |
* 合計時間には、デュアルサーフェススキャンが可能なMiSeqシステムのクラスター生成、シーケンス、およびベースコーリングが含まれます。
MiSeq試薬キットv2 | MiSeq Reagent Kit v3 | MiSeq Reagent Kit v2 Micro | MiSeq Reagent Kit v2 Nano | |
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シングルリード | 1,200万~1,500万 | 2,200万~2,500万 | 400万 | 100万 |
ペアエンドリード | 2,400万~3,000万 | 4,400万~5,000万 | 800万 | 200万 |
** 対応するクラスター密度(865~965 k/mm v2ケミストリー用のフィルターを通過する2クラスター、および1200-1400 k/mm v3ケミストリー用のフィルターを通過する2クラスター)でイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく仕様をインストールします。実際の性能パラメーターは、サンプルタイプ、サンプル品質、フィルターを通過するクラスターによって異なる場合があります。
MiSeq試薬キットv2 | MiSeq Reagent Kit v3 |
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> 1 × 36 bpでQ30よりQ30%高い塩基 | > 2 × 75 bpでQ30より85%高い塩基 |
> 2 × 25 bpでQ30より90%高い塩基 | > 2 × Q30でQ30より70%高い塩基 |
> 2 × 150 bpでQ30より80%高い塩基 | |
> 2 × 250 bpでQ30より75%高い塩基 |
† クオリティスコア(Qスコア)は、ベースコールにおけるエラー確率の予測指標です。Q30超の塩基のパーセンテージは全体のランの平均です。
MiSeqシステムでは、イルミナの実績あるSBSテクノロジーを採用しているため、さまざまなアプリケーションで傑出した高品質かつ高精度なデータが得られます。 SBSでは、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法により、伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で検出します。
ペアエンドシーケンスでは、DNA断片の両端をシーケンスできます。 各ペアリード間の距離は既知であるため、この情報をアライメントアルゴリズムで使用してリードをマッピングできます。 このテクノロジーは、シーケンスが困難なゲノムの反復領域間で特に有効です。