MiSeqシーケンスシステムのアプリケーションと方法

可能性を探る

MiSeqシステムは、ターゲット遺伝子シーケンスや小規模ゲノムシーケンスなど、幅広いアプリケーションに柔軟性とシンプルさを提供します

MiSeqフローセル

主要なアプリケーションと手法

小規模全ゲノムシーケンス(WGS)により、公衆衛生、感染症サーベイランス、分子疫学研究、環境メタゲノムなどのアプリケーションのための微生物またはウイルスゲノムを包括的に解析できます。このアプローチでは、細菌培養や手間のかかるクローニング手順は必要ありません。MiSeqシステムシーケンスランごとに最大24の小さなゲノムをシーケンスします。

アプリケーションノートを確認する:微生物WGS

お客様のインタビューはこちら:疫学研究

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ライブラリー調製
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シーケンス
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解析

BaseSpace Sequence Hubでサンプルデータを参照します(ログインが必要): MiSeq小規模ゲノムデータ

サンプルあたりの推定コスト:$80*

*MiSeqシステム上の小規模全ゲノムシーケンスは、5 Mbゲノム、50~100×カバレッジ、2 × 300 bpリード長、Nextera XT Library Prep Kit、MiSeq Reagent v3 600サイクルキットに基づき、2016年に計算されたサンプルあたりの推定コストです。

ターゲット遺伝子シーケンスでは、対象となる遺伝子またはゲノム領域のみのシーケンスに時間、費用、解析を集中させます。PCRアンプリコンの超深度ターゲットシーケンスにより、1回のアッセイで最大数百のターゲットゲノム領域のコスト効率の良い解析が可能です。1回のMiSeqシステムシーケンスランで最大96サンプルおよび1536アンプリコン以上のシーケンスが可能です。

お客様のインタビューはこちら:細菌薬剤耐性

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アッセイデザインとライブラリー調製 
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シーケンス
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解析

16SリボソームRNA(rRNA)遺伝子のシーケンスは、複雑な微生物叢や研究が困難な環境からの細菌を同定して比較するための培養不要の手法です。イルミナが実証した16S rRNAシーケンスのプロトコールは、実験から推測を排除するのに役立ちます。マルチプレックスでは、MiSeqシステムシーケンスランごとに最大96サンプルをシーケンスできます。

アプリケーションノートを確認する 16Sメタゲノム解析

お客様のインタビューはこちら:微生物コミュニティー研究

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ライブラリー調製
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シーケンス
3
解析

BaseSpace Sequence Hubでサンプルデータを参照します(ログインが必要):

16Sメタゲノムシーケンスラン

16Sメタゲノムシーケンス プロジェクト

サンプルあたりの推定コスト:$10* 

*MiSeqシステム上の16S rRNAシーケンスで、96サンプル、2 × 300 bpリード長、Nextera XTインデックスプライマー、MiSeq Reagent v3 600サイクルキットに基づき、2016年に計算されたサンプルあたりの推定コストです。

その他のアプリケーションと手法

ChIP-Seq

ゲノムワイドな遺伝子制御の調査のために、DNAとのタンパク質の相互作用を解析します。

De novoシーケンス

すべての新規ゲノムの高速で精確な特性解析をリファレンスシーケンスなしで可能にします。

miRNAとSmall RNA解析

microRNAなどのsmall RNAを分離し、シーケンスを決定することで、遺伝子サイレンシングや転写後制御におけるノンコーディングRNAの役割を研究します。

品質管理

フルスケールランを実行する前に、バイオ生産研究の品質管理(QC)アプリケーションを実行したり、シーケンスライブラリーの品質を評価したりすることができます。

ターゲットDNAシーケンス

研究対象の遺伝子またはゲノム領域のみをシーケンスする時間、費用、および解析に焦点を当てます。

ターゲットRNAシーケンス

遺伝子発現プロファイリング研究のために、関心のある特定の転写産物を選択し、シーケンスします。

装置のその他の使用法

MiSeqシステムで何ができるかご覧ください。