幅広いシーケンスアプリケーション

MiSeqのアプリケーションには、ターゲット遺伝子シーケンス、小規模ゲノムシーケンス、アンプリコンシーケンス、16Sメタゲノミクスなどがあります

MiSeqのアプリケーションと手法

微生物のゲノムを詳細に表示できます。 小規模ゲノムシーケンスでは、公衆衛生、疫学、および疾患研究の目的で微生物やウイルスのゲノムを網羅的に解析します。 MiSeqのランあたり最大24の小規模ゲノムシーケンスが可能です。

MiSeqシステムでの小規模ゲノムシーケンスで微生物ゲノミクス研究を行っている事例をご覧ください。

サンプルあたりの推定コスト: 98ドル*

*MiSeqシステムでの小規模全ゲノムシーケンスのサンプルあたりの推定コスト(2016年)。推定条件:5Mbゲノム、50~100xカバレッジ、300bp x 2リード長、Nextera XTサンプル調製キット、MiSeq Reagent Kit v3(600サイクル)

ターゲットリシーケンスは研究の対象となる遺伝子やゲノム領域の一部のみのシーケンス解析、時間とコストに着目した手法です。 PCRアンプリコンの超ディープシーケンスのアンプリコンシーケンスはコスト効率が高く、1つのアッセイで最大数百ものターゲットゲノム領域を解析できます。 1回のMiSeqランで最大96サンプルおよび1536アンプリコン、またはそれ以上をシーケンスできます。

MiSeqシステムでのアンプリコンシーケンスの使用事例をご覧ください。

サンプルあたりの推定コスト: 90ドル*

*MiSeqシステムでのターゲットリシーケンスのサンプルあたりの推定コスト(2016年)。推定条件:400アンプリコンパネル、500xカバレッジ、TruSeq Custom Amplicon Low Input Kit、MiSeq Reagent Kit v2(300サイクル)

16SリボソームRNA(rRNA)遺伝子のシーケンスは培養を必要としない手法で、研究が難しい複雑な微生物群または環境から得た細菌群を同定および比較します。 16S rRNAシーケンス用の実証されたプロトコールで、実験結果から効果的な推量を行うことができます。 マルチプレックスにより、MiSeqランあたり最大96サンプルをシーケンスできます。

サンプルあたりの推定コスト: 18ドル*

*MiSeqシステムでの16S rRNAシーケンスのサンプルあたりの推定コスト(2016年)。推定条件:96サンプル、300bp x 2リード長、Nextera XTインデックスプライマー、MiSeq Reagent Kit v3(600サイクル)

ターゲットRNA-Seqによる遺伝子発現解析

ターゲットRNAシーケンス(RNA-Seq)では、関心のある特定の転写産物を選択して、遺伝子発現の解析および融合遺伝子の同定に使用します。

アプリケーションノート

MiSeqシステム向けのTruSeqターゲットRNA発現ソリューション

研究者の声

小児白血病におけるがんのパスウェイ
CNVと統合失調症との関連性を解明

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ターゲット遺伝子パネル

ターゲット遺伝子シーケンスパネルには、特定の関心遺伝子に絞り込んだ既定のプローブセットが含まれています。 固定パネルとカスタムパネルの両方を利用できます。

研究者の声

LipidSeqで脂質異常症変異を探索
バイオマーカーの発見においてNGSが計り知れない価値を実証

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De Novoシーケンス

次世代シーケンス(NGS)を使ったDe Novoシーケンスにより、リファレンスゲノムを使わない、高速で精確な種の特性評価が可能になります。

アプリケーションノート

1回のMiSeqシステムのランで小規模ゲノムNextera Mate PairライブラリーのDe Novoアセンブル

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miRNA解析およびSmall RNA解析

microRNAなどの低分子RNA種を単離およびシーケンスし、遺伝子サイレンシングおよび転写後制御におけるノンコーディングRNAの役割を調べます。

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シーケンスによるジェノタイピング

シーケンスによるジェノタイピングとは、新たな動植物SNPを発見してジェノタイピング研究を行なうための、低コストな遺伝学的スクリーニング手法です。

アプリケーションノート

柔軟性の高いMiSeqシステムでアグリゲノムの幅広いアプリケーションをサポート

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ChIP-Seqを使用した、DNA-タンパク質相互作用解析

クロマチン免疫沈降アッセイとシーケンスを融合し、ChIP-Seqはゲノムワイド遺伝子調節解析のパワフルな手法となります。

研究者の声

NGSを利用したクロマチンランドスケープの調査

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サンプル品質管理

シーケンスライブラリーを大規模なランで本格的に使用する前にその品質を評価します。または、生物生産研究用の品質管理アプリケーションを実行します。

研究者の声

バイオファーマの製造における生物学的品質管理に次世代シーケンスを使用

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イルミナのNGS活用ガイド

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