可能性を探る
MiSeqシステムは、ターゲット遺伝子シーケンスや小規模ゲノムシーケンスなど、幅広いアプリケーションに柔軟性とシンプルさを提供します
小規模全ゲノムシーケンス（WGS）により、公衆衛生、感染症サーベイランス、分子疫学研究、環境メタゲノムなどのアプリケーションのための微生物またはウイルスゲノムを包括的に解析できます。このアプローチでは、細菌培養や手間のかかるクローニング手順は必要ありません。MiSeqシステムシーケンスランごとに最大24の小さなゲノムをシーケンスします。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
小さなゲノム、PCRアンプリコン、プラスミドに最適化された迅速なライブラリー調製。わずか1 ngのインプットと15分のハンズオンタイムが必要です。
全ヒトゲノムシーケンス、アンプリコン、プラスミド、微生物ゲノムなど、幅広いアプリケーション用の高速かつ統合されたワークフロー。
MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle)
MiSeq システムでの600サイクルのランをサポートするクラスタリングおよびシーケンス試薬を含む、すぐに使用できる充填済みカートリッジ。
次世代シーケンスデータからのMDA単一細胞および標準細菌データセットからの小さなゲノムのde novoアセンブルを行うオープンソース ツール。
微生物ゲノムアセンブリ用の2つのデータ解析パイプライン（Tell-ReadおよびTell-Link）。
BaseSpace Sequence Hubでサンプルデータを閲覧する（ログインが必要）：MiSeq小ゲノムデータ
サンプルあたりの推定コスト：$80*
*MiSeqシステム上の小規模全ゲノムシーケンスは、5 Mbゲノム、50～100×カバレッジ、2 × 300 bpリード長、Nextera XT Library Prep Kit、MiSeq Reagent v3 600サイクルキットに基づき、2016年に計算されたサンプルあたりの推定コストです。
ターゲット遺伝子シーケンスでは、対象となる遺伝子またはゲノム領域のみのシーケンスに時間、費用、解析を集中させます。PCRアンプリコンの超深度ターゲットシーケンスにより、1回のアッセイで最大数百のターゲットゲノム領域のコスト効率の良い解析が可能です。1回のMiSeqシステムシーケンスランで最大96サンプルおよび1536アンプリコン以上のシーケンスが可能です。
一回の実行で数種～数百の遺伝子を範囲とするターゲットに使用するための、高度マルチプレックスポリメラーゼ連鎖反応（PCR）に基づくワークフロー。
カスタムシーケンスプローブのデザインと注文、カスタムジェノタイピングアレイアッセイの作製に役立つウェブベースのアッセイデザインツールです。
MiSeq Reagent Kit v2 (300-cycles)
MiSeq システムでの300サイクルランをサポートするクラスタリングおよびシーケンス試薬が入った、すぐに使用できる充填済みカートリッジ。
シーケンスランの作成、ランステータスのモニタリング、データ解析のためのオンプレミスソフトウェアソリューション。
NGSデータの解析と管理を行うイルミナのゲノミクスクラウドコンピューティング環境。
バリアントアノテーションと解析ソフトウェアツールは研究者が、膨大なゲノムデータから生物学的洞察を抽出してレポート作成するのに役立ちます。
16SリボソームRNA（rRNA）遺伝子のシーケンスは、複雑な微生物叢や研究が困難な環境からの細菌を同定して比較するための培養不要の手法です。イルミナが実証した16S rRNAシーケンスのプロトコールは、実験から推測を排除するのに役立ちます。マルチプレックスでは、MiSeqシステムシーケンスランごとに最大96サンプルをシーケンスできます。
1回のシーケンスランで最大384個の一意にインデックス付けされたサンプルをプールしてシーケンスするためのインデックス。
16S rRNAアンプリコンシーケンス用のMiSeqシステムを使用した包括的なワークフロー。
MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle)
MiSeq システムでの600サイクルのランをサポートするクラスタリングおよびシーケンス試薬を含む、すぐに使用できる充填済みカートリッジ。
イルミナがキュレーションしたGreenGenes分類学的データベースのバージョンを使用した、16S rRNAターゲット アンプリコンリードの分類学的手法。
サンプルあたりの推定コスト：$10*
*MiSeqシステム上の16S rRNAシーケンスで、96サンプル、2 × 300 bpリード長、Nextera XTインデックスプライマー、MiSeq Reagent v3 600サイクルキットに基づき、2016年に計算されたサンプルあたりの推定コストです。
リソーススポットライト
MiSeq システムのセルフサービス ブックレットは、コンピュータ、タブレット、スマートフォンでアクセスできるクリック可能な機能を含むインタラクティブガイドです。ランの準備、装置のメンテナンス、トラブルシューティングなどの詳細をご覧ください。ビデオを見る：MiSeqセルフサービスブックレットの紹介
microRNAなどのsmall RNAを分離し、シーケンスを決定することで、遺伝子サイレンシングや転写後制御におけるノンコーディングRNAの役割を研究します。
フルスケールランを実行する前に、バイオ生産研究の品質管理(QC)アプリケーションを実行したり、シーケンスライブラリーの品質を評価したりすることができます。
遺伝子発現プロファイリング研究のために、関心のある特定の転写産物を選択し、シーケンスします。
MiSeqシステムで何ができるかご覧ください。
カリフォルニア大学デービス校の研究者は、MiSeqシステムを使用して、ワインとチーズの微生物叢プロファイルや、それが製造される施設を特定しています。
デンマークのコペンハーゲンにあるHvidovre University Hospitalの研究者は、MiSeqシステムを使用して、世界中の薬剤耐性菌株を同定しています。
ターゲットシーケンスは、代謝疾患や神経疾患に関連する新しいバリアントを明らかにします。