可能性を探る
MiSeqシステムは、ターゲット遺伝子シーケンスや小ゲノムシーケンスなど、幅広いアプリケーションに柔軟性とシンプルさを提供します
小規模全ゲノムシーケンス（WGS）では、公衆衛生、感染症サーベイランス、分子疫学研究、環境メタゲノミクスにおけるアプリケーションのために、微生物またはウイルスゲノムの包括的な解析が可能です。このアプローチでは、細菌培養や手間のかかるクローニングステップは必要ありません。MiSeqシステムシーケンスランごとに最大24個の小さなゲノムをシーケンスします。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
小さなゲノム、PCRアンプリコン、プラスミドに最適化された迅速なライブラリー調製。わずか1 ngのインプットと15分のハンズオンタイムが必要です。
全ヒトゲノム、アンプリコン、プラスミド、微生物ゲノムのシーケンスなど、幅広いアプリケーションに対応する高速な統合ワークフロー。
MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle)
MiSeqシステム上での600サイクルランをサポートするクラスター試薬およびシーケンス試薬を含む、すぐに使用できる充填済みカートリッジ。
MDAシングルセルおよび次世代シーケンスデータからの標準細菌データセットからの小さなゲノムのde novoアセンブリのためのオープンソースツール。
微生物ゲノムアセンブリ用の2つのデータ解析パイプライン（Tell-ReadおよびTell-Link）。
BaseSpace Sequence Hubのサンプルデータを閲覧する（ログインが必要）：MiSeq小ゲノムデータ
サンプルあたりの推定コスト：$80*
*MiSeqシステム上の小さな全ゲノムシーケンスは、5 Mbゲノム、50～100×カバレッジ、2 × 300 bpリード長、Nextera XT Library Prep Kit、MiSeq Reagent v3 600サイクルキットに基づき、2016年に計算されたサンプルあたりの推定コストです。
ターゲット遺伝子シーケンスは、関心のある遺伝子またはゲノム領域のみのシーケンスに時間、費用、解析を集中させます。PCRアンプリコンの超ディープターゲットシーケンスであるアンプリコンシーケンスは、1回のアッセイで最大数百のターゲットゲノム領域の費用対効果の高い解析を可能にします。1回のMiSeqシステムシーケンスランで最大96サンプルおよび1536アンプリコン以上のシーケンスが可能です。
高度にマルチプレックスされたポリメラーゼ連鎖反応（PCR）ベースのワークフローで、1回のランで数から数百の遺伝子のターゲットに使用できます。
研究者がカスタムシーケンスプローブを設計および注文したり、カスタムジェノタイピングアレイアッセイを作成したりするのに役立つウェブベースのアッセイデザインツール。
MiSeq Reagent Kit v2 (300-cycles)
300サイクルのMiSeqシステムランをサポートするクラスター試薬とシーケンス試薬を含む、すぐに使える充填済みカートリッジ。
16SリボソームRNA（rRNA）遺伝子のシーケンスは、複雑な微生物叢や研究が困難な環境からの細菌を同定して比較するための培養不要の手法です。イルミナが実証した16S rRNAシーケンスのプロトコールは、実験から推測を排除するのに役立ちます。マルチプレックスでは、MiSeqシステムシーケンスランごとに最大96サンプルをシーケンスできます。
1回のシーケンスランで、最大384のユニークにインデックス化されたサンプルをプーリングおよびシーケンスするためのインデックス。
16S rRNAアンプリコンシーケンス用のMiSeqシステムを使用した包括的なワークフロー。
MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle)
MiSeqシステム上での600サイクルランをサポートするクラスター試薬およびシーケンス試薬を含む、すぐに使用できる充填済みカートリッジ。
イルミナがキュレーションしたGreenGenes分類学データベースのバージョンを使用した、16S rRNAターゲットアンプリコンリードの分類学分類。
サンプルあたりの推定コスト：$10*
*MiSeqシステム上の16S rRNAシーケンスは、96サンプル、2 × 300 bpリード長、Nextera XTインデックスプライマー、MiSeq Reagent v3 600サイクルキットに基づき、2016年に計算されたサンプルあたりの推定コストです。
リソーススポットライト
MiSeqシステムのセルフサービスブックレットは、コンピューター、タブレット、スマートフォンからアクセスできるクリック可能な機能を含むインタラクティブなガイドです。ランの準備、装置のメンテナンス、トラブルシューティングなどの詳細をご覧ください。ビデオを見る：MiSeqセルフサービスブックレットの紹介
microRNAなどのsmall RNAを分離し、シーケンスを決定することで、遺伝子サイレンシングや転写後制御におけるノンコーディングRNAの役割を研究します。
フルスケールランを実行する前に、バイオ生産研究の品質管理(QC)アプリケーションを実行したり、シーケンスライブラリーの品質を評価したりすることができます。
遺伝子発現プロファイリング研究のために、関心のある特定の転写産物を選択し、シーケンスします。
MiSeqシステムの可能性を見る
カリフォルニア大学デービス校の研究者は、MiSeqシステムを使用して、ワインとチーズの微生物叢プロファイルと、それが製造される施設を特定しています。
デンマークのコペンハーゲンにあるHvidovre University Hospitalの研究者は、MiSeqシステムを使用して、世界中の薬剤耐性菌株を同定しています。
ターゲットシーケンスは、代謝疾患や神経疾患に関連する新しいバリアントを明らかにします。