がん免疫学は、がんとの闘いにおいて大きな進歩を遂げた新興分野であり、腫瘍が自然免疫応答をどのように回避するかをより良く理解することで支えられています。大手のがん免疫研究者は、次世代シーケンサー(NGS)を活用して、免疫療法の応答因子、バイオマーカー、ゲノミクスを研究し、個別化免疫療法研究を改善しています。
腫瘍が免疫反応を回避するために使用するメカニズムに対する免疫腫瘍学研究は、有望な治療標的につながりました。これらの治療法は、免疫系ががんをターゲットにする能力を高めたり、腫瘍が免疫反応を回避する能力を制限したりします。さらに、NGSは、腫瘍環境でどのパスウェイが活性化されているか、がん細胞の増殖、生存、浸潤、転移などのプロセスにどのように関与しているかを特定するのに役立ちます。
このアプリケーションノートでは、進化する傾向、研究者のニーズ、この急速に進化する分野で利用できるゲノム技術など、がん免疫学の最近の進歩に焦点を当てています。
NGSは、がんゲノムの詳細な解析を提供できる強力なツールです。また、腫瘍の増殖や治療に反応する免疫マーカーの発現をモニタリングするために、高感度で腫瘍微小環境をリアルタイムで効率的に評価することもできます。NGSは、免疫細胞レパートリーを特徴づけ、微小環境内のさまざまな細胞集団を同定し、数千のターゲットの遺伝子発現を同時に包括的に定量化することができます。
NGSは、研究者が新抗原を同定し、免疫反応を促進する革新的な治療法を研究し、遺伝的変異がその有効性にどのように影響するかを理解するのにも役立ちます。NGSは、腫瘍特異的応答を惹起するために適用できる新しい腫瘍抗原の予測的選択も可能にしました。
空間トランスクリプトミクスは、組織切片にマッピングされた遺伝子発現パターンのトポグラフィー配置を提供し、構造と活性を結び付けます。この能力により、研究者は細胞レベルで生物学的相互作用を明確化し、腫瘍微小環境などの複雑な組織に対する新しい洞察を得ることができます。
NGSは、宿主と微生物叢の相互作用ががんの発生、進行、治療効果に及ぼす影響を研究するために使用できます。NGSは、さまざまな状況で微生物群をプロファイリングできます。これは、がんに対する新しい治療アプローチの開発にターゲットとなりうる種や状態を特定するのに不可欠です。
シングルセルRNAシーケンス(scRNA-Seq)は、シングルセル解像度でがんや腫瘍微小環境のトランスクリプトームプロファイルを調べるためにますます使用されています。免疫細胞研究は、単一細胞トランスクリプトミクスと組み合わせて、がん免疫サーベイランスと免疫療法への抵抗性における主要な要因を理解するために適用されています。
ネオアンチゲン、 変異負荷 |
発現 プロファイリング |
微生物叢(16S) シーケンス |
TCR/BCRa プロファイリング |
エピジェネティック プロファイリング |
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治療用途 | |||||
チェックポイント阻害薬 | |||||
ワクチン | |||||
養子細胞療法 | |||||
予後 | |||||
微生物 | |||||
免疫レパートリー | |||||
モニタリング |
- 主な用途
a TCR:T細胞受容体、BCR:B細胞受容体
腫瘍学研究におけるマルチオミクス:複数層の情報により、単一オミクス研究だけでは解決できない腫瘍生物学に対する新しい洞察が得られます。
マルチオミクス研究は、ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、メタゲノム、プロテオミクスのアプローチから得られる高次元データセットを統合します。多くの場合、これらの手法によって生成される膨大な量のデータを解釈するために、計算およびネットワーク生物学を使用します。マルチオミクスを臨床研究データに適用することで、既存のオミクス手法の発見力が強化され、新しいバイオマーカーや免疫療法のターゲットが明らかになります。
さらに、マルチオミクスアプローチは、腫瘍および微小環境の分子プロファイルの包括的なビューを提供することができます。
イルミナでは、がん免疫研究に対応したデータ解析オプションが利用できるライブラリー調製およびシーケンスオプションを複数ご用意しています。合理化されたワークフローと柔軟なキット構成により、複数の研究デザインに対応できます。
T細胞受容体ベータ鎖再配列のシーケンスにより、T細胞の多様性とクローン増殖を調べるターゲットRNA研究パネル。
コーディングRNAおよび複数の形態のノンコーディングRNAの解析に卓越した性能を提供します。代替転写産物、遺伝子融合、およびアレル特異的発現を高い信頼性で発見できます。
ヒト全ゲノムシーケンスからアンプリコン、プラスミド、微生物の種まで、広範囲の用途に対して迅速な統合ワークフロー。
NovaSeq Xシリーズは幅広いアプリケーションを提供し、生産規模でデータ集約型の手法を可能にします。
拡張性のあるスループットと柔軟性により、ほぼすべてのゲノム、シーケンス手法、プロジェクト規模に対応します。
コスト効率に優れ、使いやすいミッドスループットのベンチトップシーケンサーは、新たなアプリケーションをサポートする極めて高い柔軟性を備えています。
NGSデータ解析と管理を行うイルミナのゲノミクスコンピューティング環境。
RNA Ampliconアプリは、イルミナプラットフォームでシーケンスされたアンプリコンパネルを使用した遺伝子発現プロファイリングを可能にします。
シーケンスランの作成、ランステータスのモニタリング、シーケンスデータの解析、および結果の表示のために設計された統合ソリューションです。
がん研究手法ガイドは、幅広いがん研究アプリケーションのためのシンプルで包括的なワークフローを備えた40ページ以上の包括的なリソースです。このガイドには、シングルセルシーケンス、空間シーケンス、メチル化プロファイリング、マルチオミクス、セルフリーRNAシーケンスなどが含まれています。
無料ガイドをダウンロードオンタリオ州がん研究所とUnited Health Networkの研究者が、ゲノム研究を通してがん生物学についてより深く知ることで、大学や医療システムががんとの闘いを前進させる方法を紹介します。
このダウンロード可能なポスターは、がん研究のための新しいスケーラブルなツールの概要を示しており、完全長V(D)J免疫レパートリーシーケンス(IR-Seq)を可能にします。
組織からリキッドバイオプシーサンプルまでの包括的なゲノムプロファイリングを可能にする当社のソリューションをご覧ください。
イルミナのシーケンステクノロジーとマイクロアレイテクノロジーは、DNAからRNA解析、エピジェネティクスなど、がんゲノム研究の応用分野を幅広くサポートしています。
リキッドバイオプシー研究、シングルセル解析、エピジェネティクスなど、がん研究におけるさまざまなアプリケーションを探ります。
研究者ががんのゲノム変化を同定するのに役立つキットと試薬。