BaseSpaceソフトウェア

BaseSpaceは、シーケンスデータのための単一の安全なホームを提供するため、独自のインフラを管理することなく、装置でのデータ取得から解析によるインサイトの獲得までをスムーズに進めることができます。イルミナシーケンサーからのデータはリアルタイムで直接ストリーミングされ、自動的に標準フォーマットへ変換され、その後、アライメント、バリアントコール、視覚化、解釈などを行う豊富なプッシュボタン式アプリを用いて、すぐに解析を開始できます。1TBの無料ストレージ、ランのライブモニタリング機能、保存したサンプルとラン情報による迅速なランセットアップを利用できます。内蔵の共有ツールと転送ツールにより、同僚や顧客とのコラボレーションが容易になり、ゲノム解析を効率的かつ再現性・拡張性の高いワークフローへと変革します。

自動処理です。現在のイルミナシーケンサー（NovaSeq X/X Plusシリーズ、NovaSeq 6000システム、NextSeq 1000/2000システム、NextSeq 550システム、MiSeqシリーズ、MiSeq Dxシステム、MiniSeqシステム、iSeq 100システム）はすべて、BaseSpaceと直接統合されています。機器が生成するデータストリームは、リアルタイムで暗号化され、手動のエクスポート手順なしでクラウドにストリーミングされます。

DRAGEN（生殖細胞系列、体細胞、RNA、メチル化）のほか、RNA-Seq、アンプリコン、全ゲノム、エクソーム、メタゲノム、de novoアセンブルなどをカバーするサードパーティツールやオープンソースツールなど、30以上の厳選された解析アプリが利用可能です。すべてのアプリは、ポイント＆クリックのインターフェースからアクセスできます。

BaseSpace解析アプリをすべて確認

BaseSpaceは、サブスクリプション料金なしで利用できます。1TBのストレージが含まれています。解析アプリのコンピューティングと1TBを超えるストレージは、BioInsight Credits（BIC）で請求されます。1 BIC = 1 USDです。使用した分のコンピューティングに対してのみ支払います。

BaseSpaceは、シーケンサーからクラウドへの接続、ラン管理、プッシュボタン式解析アプリを扱います。BioInsight Platform Coreは、高度なパイプラインオーケストレーション（CWL、Nextflow）、データウェアハウス、インタラクティブコンピューティング（JupyterLab）、およびコホートインフラストラクチャを扱います。両者は補完関係にあります。BaseSpaceがエントリーポイントで、BioInsight Platform Coreが高度なレイヤーです。多くのラボはBaseSpaceから始め、ワークフローの複雑さが増すにつれてBioInsight Platform Coreへ移行します。

わかりやすく言うならば、BaseSpaceはシーケンサーから標準的な二次解析までをつなぐラン中心のハブであり、BioInsight Platform Coreは大規模なオミクスデータを管理および解析するための柔軟な開発者向けプラットフォームです。

ひとつだけを選ぶ必要はありません。ソリューションは補完し合うものです。多くのお客様が、機器データの取得と二次解析のオーケストレーションにBaseSpaceを使用しています。二次解析はBioInsight Platform Coreインフラストラクチャ上で実行されます。より高度でカスタマイズされた解析とデータ管理が必要な場合は、BioInsight Platform Coreを直接使用します。

はい。BaseSpaceは、監査制御されたアクセスによるガバナンスされたデータ共有を提供します。コラボレーターは、ファイル転送、FTP、または外付けドライブを必要とせずに、BaseSpaceから直接データを表示またはダウンロードします。

BaseSpaceは、Illumina BioInsight Platform Cloudのセキュリティ認証スタックの一部であり、ISO 27001、ISO 27701、ISO 27017、ISO 27018、SOC 2 Type II、C5 Level 2、TX-RAMPに準拠し、HIPAA/HITECH（BAA必須）をサポートしています。詳細は、trust.illumina.comでご確認ください。

はい。BaseSpaceは、自動化、カスタム統合、およびプログラムによるデータアクセスのためのRESTful APIとAI対応のCLIツールを提供します。無料のデータエグレスにより、追加料金なしでデータを独自のダウンストリームワークフローに取り込むことができます。