2. PUBLIC DATA のタブをクリックすると、デモデータの一覧が表示されます。

3. Categories より Targeted Sequencing をご選択すると、各種ターゲットパネル製品のデモデータで絞り込むことができます。特に AmpliSeq パネルにご興味のある場合には、AmpliSeq for illumina を選択すると、ターゲットパネル製品のうち、AmpliSeq パネルだけのデモデータを表示させる事ができます。

4. 確認したいデモデータをクリックし、さらにProjectのImportをクリックします。

5. PROJECTのタブに移動し、Importしたターゲットパネルのデータをクリックします。

※ 以下の図はCLASSICバージョン表示での例です。
NEWバージョン表示をご使用の場合には、MY DATAタブからProjectsをお選びください。 CLASSICとNEWバージョンの切り替えは、画面右上のトグルから行えます。

6. BaseSpace Sequence Hub の解析 App で解析をした結果の一覧が表示されます。DNA Amplicon の解析結果をクリックすると、シーケンスリードのOn-Target 率など、一般的にパネル製品の評価の指標となるメトリクスのサマリーが確認できます。

7. タブから各サンプルの Report を選択すると、より詳細な解析結果を確認できます。

8. Coverage by Amplicon Region から、パネル製品を構成する各 Amplicon region の Coverage が確認できます。また図右上のボタンからCSVファイルをダウンロードすることで、各 Amplicon region の Coverage 一覧を確認することができます。

GCリッチな領域など、増幅が難しい領域においては、パネル製品のターゲットの範囲であっても、カバレッジが低下する領域が存在しますので、あらかじめ、研究目的に沿った製品であるかを確認することをお勧めします。