BovineSNP50(24サンプル)

BovineSNP50(24サンプル)

BovineSNP50 v3 BeadChipには、主要な牛種のゲノム全体に均一に分布した 53,714の非常に有益なSNPが含まれており、ゲノムワイドな選択、定量的形質遺伝子座の同定、個人の遺伝的メリットの評価、比較遺伝子研究などのアプリケーションを強化します。 このBeadChipは、イルミナがUSDA-ARS、ミズーリ大学、アルバータ大学と協力して開発しました。22,000を超えるSNPプローブは、経済的に重要な牛と乳牛の3つのプール集団のイルミナシーケンスによって発見された新しいSNP遺伝子座をターゲットとしています。 その他のコンテンツは、ウシリファレンスゲノム、Btau、ウシHapMap Consortiumデータセットなどの公的に入手可能なソースから派生しています。すべてのSNPプローブは、18種の一般的な牛と乳製品で検証されています。

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仕様
固定マーカー数 53,714 イルミナのゲノムアナライザーで一般的な牛の品種のシーケンスから得られる新しいSNP 22,299
追加のカスタムマーカーは最大 600,000 ウシHapMap SNP
BtauアセンブリSNP
全ゲノムショットガン
Holstein BACのSNP
UMD 3.0 SNP
11,607
9,086
5,485
1,238
53,218
サンプル数 24 家系マーカー 200
DNA要件 200 ng FFPE対応 あり
アッセイ Infinium HTS 間隔(kb) 平均/中央値
50.6/37.4

製品および注文情報

  • BovineSNP50 v3 BeadChipキット: 20000766(48サンプル)、 20000767(288サンプル)、 20000768(1152サンプル)。
  • BovineSNP50+ v3 BeadChipキット (追加のカスタムコンテンツに対応): 20000769(48サンプル)、 20000830(288サンプル)、 20000831(1152サンプル)
  • BovineSNP50製品ページ