International Brassica SNP Consortium

International Brassica SNP Consortium

SNPは、Brassica napusから80系統、Brassica oleraceaから4系統、Brassica rapaから4系統から抽出または検証されているため、Brassica AまたはCゲノム種でうまく機能するように設計されています。Brassica napusの遺伝資源では、最も多くのSNPが多型になることが予想されます。最大16の独立したSNPのソースが、International Brassica SNP Consortiumによって提供され、SNPの選択で検討されました。これらのデータセットは、80を超えるアブラナ属の系統に由来し、トランスクリプトームとゲノムの次世代シーケンサー（NGS）データの両方を含みます。13,000を超えるSNPが複数の研究所によって検証され、独立したSNP発見パイプラインの有効性が保証されました。コミュニティは、TraitGenetics、GmbH、Agriculture and Agrifood Canadaからのクラスターファイル開発に主な貢献をしたこの製品のクラスターファイルを開発しました。アドオンコンテンツにより、真にカスタマイズされたアブラナ属のジェノタイピングアレイ用に最大30,000個の追加マーカーをこのアレイに追加できます。