TruSeq Methyl Capture EPIC Library Prep Kitには、NGS用のターゲットMethyl-Seqライブラリーの調製に必要なほぼすべての試薬が含まれています。ENCODE、FANTOM5、およびEpigenomics RoadMap Consortiumによって特定された顧客ベースの要求と関心のある新たな領域によって駆動されるコンテンツ設計により、TruSeq Methyl Capture EPIC Library Prep Kitはヒトの全メチロームに及びます。ライブラリー調製中の偏りのないターゲットエンリッチメントでは、ターゲットキャプチャーステップはバイサルファイト変換の前に実行されます。
| 種の互換性 | ヒト | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 推奨イルミナ機器 | NovaSeq 6000（デュアルフローセル）† | HiSeq 3000/4000 | HiSeq 2500 | NextSeq 500/550 | ||
| ランごとの推奨サンプルおよびケミストリーバージョン（v3で24）‡ | 48 | 48 | 96 | 3000: 48 4000: 96 |
高速ラン：8～12歳 High Output v4：64 |
高出力：8 |
| ランモード | S1§ | S2 | S4 | 3000、シングルフローセル 4000、デュアルフローセル |
デュアルフローセル | 高出力 |
| 最大推奨リード長 | 2×100 bp | 2×100 bp | 2×100 bp | 2×100 bp | ||
| 推奨される二次解析（MiSeq Reporter、Basespaceなど） | BaseSpace Apps MethylSeqv2およびMethylKitv2 | |||||
* ライブラリー調製はすべてのイルミナ装置に対応しています。一般的な出力と選択したアプリケーションに必要な解析に基づいて選択された推奨装置。
† 利用可能なインデックスの組み合わせによって制限されます。>55Mリードに基づく。
‡ 平均カバレッジが40倍のサンプルとターゲット塩基の>90%が≥10倍でカバーされているサンプルに基づきます。
§ NovaSeq S1 Reagent Kitは現在利用できません。
| 合計サイズ | 107 Mb |
|---|---|
| CpG部位数 | 334万 |
| 転写因子結合部位 | 180K |
| FANTOM5エンハンサー | 28.2K |