TruSeq Stranded mRNA + Ribo-Zero Bacteria
TruSeq Stranded mRNA + Ribo-Zero Bacteria
細菌トランスクリプトームサンプルを調製するには、TruSeq鎖mRNAキットと組み合わせて、細菌用に設計されたRibo-Zero rRNA Removal Kitを使用することをお勧めします。
出発物質：1～5ugのトータルRNAでRiboZeroを開始し、10～100ngのRiboZero産物をTruSeqプロトコールに取り込みます（ユーザーガイドの"PurifyおよびFragment mRNA"セクションの2番目の注記を参照）。
LT HT
詳細についてはデバイスを回転させてください
| * ライブラリー調製は、すべてのイルミナ機器に対応しています。一般的な出力と選択したアプリケーションに必要な解析に基づいて選択された推奨装置。 † RNAプロファイリングではサンプルあたり20Mリード、トランスクリプトーム解析ではサンプルあたり50Mリードに基づきます。FFPEサンプルまたは分解サンプルには2倍のリード数を使用します。 |
||||
| プロジェクトの推奨事項 | ||||
|---|---|---|---|---|
| 種の 互換性 | 細菌 | |||
| 推奨イルミナ装置* | NextSeq 500 | HiSeq 2500（デュアルフローセル） | ||
| ランごとの推奨サンプル† | RNAプロファイリング：6～20歳 トランスクリプトーム解析：2～8 |
RNAプロファイリング：30～200 トランスクリプトーム解析：12～80歳 |
||
| ランモード | 中出力 | 高出力 | ラピッドラン | 高出力 |
| 最大推奨リード長 | 2x75 bp | 2x75 bp | 2x75 bp | 2x75 bp |
| 推奨される二次解析 |
|
|||
| 推奨されるダウンストリーム解析 |
|
|||