TruSeq Stranded Total RNA Ribo-Zero Plant

TruSeq Stranded Total RNA Ribo-Zero Plant

TruSeq Stranded Total RNA Sample Preparation Kits with Ribo-Zero Plantは、植物トランスクリプトームの最も明確で完全なビューを提供します。これらのキットオプションには、細胞質、ミトコンドリア、および葉緑体リボソームRNAのサンプルを枯渇させるRibo-Zero Plantが含まれます。

LT HT

詳細についてはデバイスを回転させてください

プロジェクトの推奨事項*
種の 互換性 プラント
推奨イルミナ装置 NextSeq 500 HiSeq 2500(デュアルフローセル) NovaSeq 6000(デュアルフローセル)
ランごとの推奨サンプル(RNAプロファイリング/トランスクリプトーム解析) 6~20 / 2~8 30~300 / 12~80 160 / 64 320 / 128 768 / 400
ランモード 中出力 高出力 ラピッドラン 高出力 S1§ S2 S4
最大推奨リード長 2×75 bp 2×75 bp 2×75 bp 2×75 bp ≤ 2×100 bp
推奨される二次解析
  • TopHat Alignment BaseSpaceアプリ
  • Cufflinks Assembly & DE BaseSpaceアプリ
  • RNA Express v1.0 BaseSpaceアプリ
推奨されるダウンストリーム解析
  • Genomatixパスウェイ
  • iPathwayガイド

* ライブラリー調製は、すべてのイルミナ装置に対応しています。一般的な出力と選択したアプリケーションに必要な解析に基づいて選択された推奨装置。

† インデックスの組み合わせ(HT)によって制限されます。20M/50Mリードに基づく。

‡ RNAプロファイリングではサンプルあたり20Mリード、トランスクリプトーム解析ではサンプルあたり50Mリードに基づきます。FFPEサンプルまたは分解サンプルには2倍のリード数を使用します。

§ NovaSeq S1 Reagent Kitは現在利用できません。