Texas A&M、DRAGENを導入

2010年に設立されたゲノミクスおよびバイオインフォマティクスサービスは、テキサスA&M大学システムプラントや動物研究コミュニティなど、最新のゲノミクステクノロジーへのアクセスを改善するという使命を果たしてきました。このチームは、何千ものサンプルを解析し、何百万ものシーケンスリードを生成し、農業育種サイクルの季節的な性質から生じるサンプル提出のピークをうまく管理してきました。サンプルは迅速に処理し、育種者が育種プログラムで何を進めるべきかをタイムリーに決定できるようにする必要があります。

新しいDRAGENサーバーをインストールし、これまで直面している多くの解析問題が解決すると予測できることを嬉しく思います。Texas A&M AgriLife Researchのゲノミクスおよびバイオインフォマティクスサービス担当ディレクター、Charles D. Johnson, Ph.D.は述べました。“イルミナ製品のユーザーとして、当社はその革新的なテクノロジーのレベルを、市場の他の製品と比較して前例のないレベルと捉えています。”

Illumina DRAGEN Bio-IT Platformは、シーケンスデータの正確な超高速二次ゲノム解析を実行します。最新リリースのv3.4では、このプラットフォームはRNA遺伝子融合の検出と定量化の精度と速度を向上させ、小型バリアントコーラーと構造バリアントコーラーに機能性と精度を強化しました。

DRAGENの農業分野の顧客による初期評価では、アッシュツリーゲノムに対するマッピングは、処理コアあたりローカルHPCシステムよりも177倍高速で、大きなデータセットの1つで3時間ではなく7分しかかかりませんでした。アラインメントは、HPCサーバーで約2時間かかりますが、DRAGENではわずか3分しかかかりません。

“Texas A&M AgriLifeとのコラボレーションは、農業コミュニティにおけるゲノミクスへのアクセスを改善するという共通の目標を支援しています”と、イルミナの農業市場セグメントのアソシエイトディレクターであるLisa Eldridge氏は述べました。DRAGENサーバーをワークフローに追加すると、データターンアラウンドが速くなり、研究者がこのデータを使用して重要な研究を進める能力が加速します。

イルミナの農業向け製品の詳細については、ここをクリックしてください。詳細については、DRAGENウェブページをご覧ください。