イルミナでは、臨床研究エクソーム解析に特化したTruSight One、がんや遺伝性疾患研究にご利用いただけるエクソームキットなど、幅広いアプリケーションに対応したライブラリー調製キットをご用意しています。
イルミナとIDTは高品質で高効率なエクソームライブラリー調製を実現するため協力することになりました。イルミナから専用のTruSeqおよびNexteraライブラリー調製キットと、IDTからXGen Exome Research Panelおよび Enrichment Reagentsが提供されます。
詳細はこちらTruSight One Expanded シーケンスパネル | TruSight Oneシーケンスパネル | TruSeq DNA Exome ライブラリー調製キット | Nextera DNA Exomeライブラリー調製キット | |
特長 |
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ターゲット領域 | 16.5Mb | 12Mb | 45Mb | 45Mb |
ターゲット領域詳細 | 疾患関連6704遺伝子 | 疾患関連4813遺伝子 | RefSeq の99.45% CCDS の>98.83% Ensemble の99.68% GENCODE v19 の99.68% |
RefSeq の99.45% CCDS の>98.83% Ensemble の99.68% GENCODE v19 の99.68% |
インプット量 | 50ng | 50ng | 100ng | 50ng |
FFPEサンプル | 不可 | 不可 | 対応 | 不可 |
アッセイ時間 | 1.5日 | 1.5日 | 2.5日 | 1日 |
ハンズオン時間 | 5時間 | 5時間 | 6時間 | 3時間 |
キットサイズ | 36サンプル | 9, 36サンプル | 24, 96サンプル | 24, 96サンプル |
キャプチャー前のサンプルプール | <12サンプル | <12サンプル | <12サンプル | <12サンプル |
推奨リード長 | 150bp x 2 | 150bp x 2 | 75bp x 2 | 75bp x 2 |
MiSeq 1ランあたりのサンプル数 | - | 3サンプル | - | - |
NextSeq 1ランあたりのサンプル数 | 24サンプル(高出力) | 12サンプル(中出力) 36サンプル(高出力) |
2サンプル(中出力) 6サンプル(高出力) |
2サンプル(中出力) 6サンプル(高出力) |
HiSeq 1ランあたりのサンプル数 | 18サンプル(Rapid) | 36サンプル(Rapid) | 6サンプル(Rapid) 28サンプル(中出力) 36サンプル(中出力) |
6サンプル(Rapid) 28サンプル(中出力) 36サンプル(中出力) |
BaseSpaceデモデータ | Coming Soon | ランデータ > プロジェクトデータ > |
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TruSight One、TruSeq DNA Exome をお使いいただいたお客様の声をご紹介します。
「臨床に関与した主要な遺伝子を網羅していることから、疾患や症状から責任遺伝子候補が複数想定される場合など、簡便にスクリーニングしてシークエンスできる。」
徳島大学大学院
ヘルスバイオサイエンス研究部人類遺伝学分野 教授
井本逸勢 先生
「TruSight One 以前に採用していたパネル解析が臨床研究の現場できわめて有用であることを経験していたので、パネル解析の拡張版として採用した。」
地方独立行政法人神奈川県立病院機構
神奈川県立こども医療センター 遺伝科
黒澤 健司 先生
「Biopsy サンプルなどゲノム量が限られるようなサンプルの場合に は少量インプットからスタートできることは大きなメリット だと感じます。」
浜松医科大学
医化学講座 教授
才津 浩智 先生
BaseSpace Sequence Hub のアプリを利用すれば、アライメントから変異コールまで簡単に実施することができます。 しかしながら、エクソーム解析では一般的に約30,000の変異が検出されるため、この中から『意味のある変異』を見つけ出すことが重要になります。 イルミナでは、世界中の公開データベースの情報を付加し、変異の絞込みを行うことができる ソフトウェア Variant Interpreter(ベータ版)もご提供しています。今すぐ、Variant Interpreter(ベータ版:無償)に登録して、ゲノムデータの解釈を迅速に行ってみませんか?