TruSight One Sequencing Panel

高い解析感度と特異性でエクソームの疾患関連領域をターゲットにする包括的なシーケンス研究パネルです。

6.5時間

アッセイ時間

約2時間

ハンズオンタイム

DNA 50 ng

インプット量

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TruSight OneおよびTruSight One Expandedエンリッチメントオリゴは、Illumina DNA Prep with Enrichment に使用できるよう別途ご購入いただけるようになりました。TruSight One(カタログ番号FC-141-1006およびFC-141-1007)およびTruSight One Expanded(カタログ番号FC-141-2007)用のライブラリー調製の製造は中止されました。 

概要

TruSight One Sequencing Panelは、複数のゲノムデータベースと業界の専門家からのガイダンスに基づいて、疾患関連遺伝子の幅広いコンテンツと高いカバレッジを提供します。 

  • ヒト疾患に関連する最大6,700遺伝子をターゲットとし、20倍以上のカバレッジを実現

  • シングルアッセイで、既存メニューの拡張、ワークフローの合理化、またはシーケンスのオプションの全ポートフォリオの作成が可能

  • ユーザー定義の遺伝子フィルタリングとレポート作成により解釈を簡素化

2つのパネルで、多様なアッセイポートフォリオを管理するためのソリューションを手頃な価格で基礎研究室に提供します。

TruSight One Sequencing Panel

このパネルは、特定の臨床表現型にリンクした4,800を超える疾患関連遺伝子を含む12 Mbのゲノムコンテンツの包括的カバレッジを提供するため、研究者は既知の既知の疾患関連性を持つ遺伝子に集中することができます。 

TruSight One拡張シーケンスパネル

このパネルは、通常パネルをさらに最適化し、より幅広いカバレッジを提供します。拡張パネルは、元の4,800の遺伝子に加え、約1,900の遺伝子をターゲット化し、合計で16.5 Mbのゲノムコンテンツを提供します。 


仕様


必要な製品

以下のいずれかが必要です。 

  • TruSight One Sequencing Comboバンドルソリューションの購入(15のサンプルをサポートし、TruSight One – Enrichment Oligosキット1つ、Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples) 1つ、MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle) 5つが含まれます)、または

  • 各パネルの濃縮オリゴ、16または96サンプル用の濃縮ありまたはなしのイルミナDNA Prep、およびシステム用のシーケンス試薬の別途購入 

コンボバンドルソリューションを選択するか、濃縮とライブラリー調製を別々に購入するかにかかわらず、IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes(A–D)を別途購入する必要があります。  

/ 結果

アプリケーション

TruSight One Sequencing Panelは、疾患関連のターゲット領域の幅広いカバレッジを提供し、既存のメニューの拡張、ワークフローの合理化を実現しつつ、反復検査をシングルアッセイに置き換えることができます。 

ワークフローの例


プロジェクトの推奨事項

装置 Recommended number of samples Read length
MiSeq System

TruSight One: 3 samples per run with v3 reagents

最大2 × 150 bp 

NextSeq 550 System

TruSight One (samples per run): mid output: 12, high output: 36  

TruSight One Expanded: 24 samples per run (high output) 

最大2 × 150 bp 

最大2 × 150 bp 

NextSeq 2000 System

TruSight One: 96 samples per run (P3 flow cell) 

TruSight One Expanded: 66 samples per run (P3 flow cell) 

最大2 × 150 bp 

最大2 × 150 bp

NovaSeq 6000 System

TruSight One Expanded: 96 samples per run (S1 flow cell) 

最大2 × 150 bp

推奨サンプル数は、ターゲットコンテンツの平均カバレッジの100倍に基づきます。


関連するアプリケーションとメソッド

本製品の用途例

ドキュメント

製品資料

比較する

TruSight One Sequencing Panel Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
アッセイ時間 6.5時間 6.5時間
コンテンツ仕様 TruSight One:約12 Mbのゲノムコンテンツ(約4,800遺伝子)
TruSight One Expanded:約16.5 Mbのゲノムコンテンツ(約6,700遺伝子)

37.5 Mbのコーディングコンテンツ(RefSeq、CCDS、ClinVarおよびACMG病原性/病原性の可能性の高いバリアントの99%以上、COSMIC Cancer Gene Census)、OMIM

ハンズオンタイム 約2時間 約2時間
インプット量 DNA 50 ng 50~1,000 ngの高品質ゲノムDNA(直接血液および唾液については、リファレンスガイドを参照)
システム MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
手法 Targeted DNA sequencing, Target enrichment Targeted DNA sequencing, Exome sequencing, Target enrichment
マルチプレックス 最大96プレックス 最大12プレックスの濃縮前プーリングをテスト。キット構成は、最大192サンプルのマルチプレックスをサポートします。最大384まで可能です。
Nucleic acid type DNA DNA
サンプルタイプ Not FFPE-compatible Blood, Saliva
Species category ヒト ヒト
テクノロジー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー
バリアントクラス Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Germline variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)

選択ツール:

TruSight One Sequencing Panelグローバル遺伝子コンテンツ貢献者

TruSight Oneパネルは、既知の疾患関連バリアントを持つゲノムのエクソン領域に焦点を当てています。複数の公開された情報源からのデータを組み合わせることで、パネルが臨床研究環境で現在レビューされているすべての遺伝子をカバーしていることを確認できます。

TruSight Oneとイルミナのタグメンテーションケミストリー

TruSight One 濃縮オリゴは、イルミナのオンビーズタグメンテーションケミストリーと連携し、ターゲット遺伝子のエンリッチメントのための迅速でシンプルなメソッドを提供します。このワークフローでは、ライブラリー調製とターゲット濃縮のステップを組み合わせ、1.5時間で完了できます。

リソース

TruSightのコンテンツセットの開発に対する提携アプローチについてぜひお聞きください。

バンドルソリューション (1)

TruSight One Sequencing Combo (15 Samples)

20042621

15サンプルに十分で、TruSight One – Enrichment Oligos(カタログ:20029227)、Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)(カタログ:20025523)、およびMiSeq Reagent Kits v3(600サイクル)(カタログ: MS-102-3003)。IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexesは別途購入してください。

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エンリッチメントパネル (2)

TruSight One – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)

20029227

Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentationと組み合わせると、6つのエンリッチメント反応に十分です。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびインデックスアダプターは別売りです。

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TruSight One Expanded – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)

20029226

Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentationと組み合わせると、6つのエンリッチメント反応に十分です。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびインデックスアダプターは別売りです。

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ライブラリー調製 (4)

Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025523

16のライブラリー(16、1プレックスエンリッチメント反応)を調製および濃縮するための試薬が含まれます。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025519

16ライブラリー調製用試薬が入っています。濃縮試薬は含まれていません。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。濃縮試薬は、ライブラリー調製試薬[Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 samples)]でのみ注文が可能です。

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025520

96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。濃縮試薬は含まれていません。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。濃縮試薬は、ライブラリー調製試薬[(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 samples)]でのみ注文が可能です。

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025524

96ライブラリー(8、12プレックスエンリッチメント反応)を調製および濃縮するための試薬が含まれます。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。

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インデックスアダプター (8)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042666

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042667

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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選択中の製品一覧

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よくある質問(FAQ)

イルミナでは、QuantiFluorやPicoGreenなどの二本鎖DNAに特異的な蛍光定量を使用した手法の使用を推奨しています。詳細については、TruSight One ライブラリー調製ガイドのインプット量の推奨事項を参照してください。

イルミナでは、タグメンテーションおよび濃縮洗浄ステップ中にマイクロヒーティングシステムを使用することを推奨します。マイクロヒーティングシステムが利用できない場合は、サーマルサイクラーを使用できます。使用説明に従い96ウェルのハードシェルプレートを使用して、タグメンテーション反応を設定します。濃縮洗浄ステップでは、サンプル量が多いため、プロトコールを調整して安定した性能を得る必要があります。詳細については、TruSight One Sequencing Panelリファレンスガイドの付録Aを参照してください。

TruSight One Sequencing Panelはコーディング領域のみをターゲットとし、UTRまたはプロモーター領域は含まれません。
/ 結果

NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

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