TruSeq Stranded mRNA + Ribo-Zero酵母

TruSeq Stranded mRNA + Ribo-Zero酵母

酵母トランスクリプトームサンプルを調製するには、TruSeq鎖mRNAキットと組み合わせて、酵母用に設計されたRibo-Zero rRNA Removal Kitを推奨します。

出発物質:1~5ugのトータルRNAでRiboZeroを開始し、10~100ngのRiboZero産物をTruSeqプロトコールに取り込みます(ユーザーガイドの"PurifyおよびFragment mRNA"セクションの2番目の注記を参照)。

LT HT

詳細についてはデバイスを回転させてください

* ライブラリー調製は、すべてのイルミナ機器に対応しています。一般的な出力と選択したアプリケーションに必要な解析に基づいて選択された推奨装置。
† RNAプロファイリングではサンプルあたり20Mリード、トランスクリプトーム解析ではサンプルあたり50Mリードに基づきます。FFPEサンプルまたは分解サンプルには2倍のリード数を使用します。
プロジェクトの推奨事項
種の 互換性 シトシンメチル化を使用するすべての種に対応
推奨イルミナ装置* NextSeq 500 HiSeq 2500(デュアルフローセル)
ランごとの推奨サンプル RNAプロファイリング:6~20歳
トランスクリプトーム解析:2~8
RNAプロファイリング:30~200
トランスクリプトーム解析:12~80歳
ランモード 中出力 高出力 ラピッドラン 高出力
最大推奨リード長 2x75 bp 2x75 bp 2x75 bp 2x75 bp
推奨される二次解析
  • TopHat Alignment BaseSpaceアプリ
  • Cufflinks Assembly & DE BaseSpaceアプリ
  • RNA Express v1.0 BaseSpaceアプリ
推奨されるダウンストリーム解析
  • Genomatixパスウェイ
  • iPathwayガイド