酵母トランスクリプトームサンプルを調製するには、TruSeq鎖mRNAキットと組み合わせて、酵母用に設計されたRibo-Zero rRNA Removal Kitを推奨します。
出発物質:1~5ugのトータルRNAでRiboZeroを開始し、10~100ngのRiboZero産物をTruSeqプロトコールに取り込みます(ユーザーガイドの"PurifyおよびFragment mRNA"セクションの2番目の注記を参照)。
詳細についてはデバイスを回転させてください
* ライブラリー調製は、すべてのイルミナ機器に対応しています。一般的な出力と選択したアプリケーションに必要な解析に基づいて選択された推奨装置。 † RNAプロファイリングではサンプルあたり20Mリード、トランスクリプトーム解析ではサンプルあたり50Mリードに基づきます。FFPEサンプルまたは分解サンプルには2倍のリード数を使用します。 |
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プロジェクトの推奨事項 | ||||
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種の 互換性 | シトシンメチル化を使用するすべての種に対応 | |||
推奨イルミナ装置* | NextSeq 500 | HiSeq 2500(デュアルフローセル) | ||
ランごとの推奨サンプル† | RNAプロファイリング:6~20歳 トランスクリプトーム解析:2~8 |
RNAプロファイリング:30~200 トランスクリプトーム解析:12~80歳 |
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ランモード | 中出力 | 高出力 | ラピッドラン | 高出力 |
最大推奨リード長 | 2x75 bp | 2x75 bp | 2x75 bp | 2x75 bp |
推奨される二次解析 |
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推奨されるダウンストリーム解析 |
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