Illumina DRAGEN二次解析は、あらゆる規模と分野のラボが、ゲノムの価値を最大化することを可能にします。また、オンボードまたはクラウドでのパワフルで直感的な解析、幅広いアプリケーション、直感的ですぐに使用できるパイプラインセットを提供します。
オンボードやクラウドでのユーザーフレンドリーなデータ解析
最適化されたソフトウェアによるデータ解析の簡素化でインフォマティクスのスペシャリストへの依存を軽減
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Illumina DRAGEN二次解析は、あらゆる規模と分野のラボが、ゲノムの価値を最大化することを可能にします。また、オンボードまたはクラウドでのパワフルで直感的な解析、幅広いアプリケーション、直感的ですぐに使用できるパイプラインセットを提供します。
DRAGEN二次解析は、データプライバシーと保護に関する高い基準に基づいて構築されており、バイオインフォマティクスの専門知識の必要性を最小限に抑えます。
MiSeq i100シリーズに搭載されたDRAGEN二次解析は、迅速で超効率的、かつ使いやすい解析を提供します。またデータのボトルネックを克服して、インフォマティクスのスペシャリストへの依存を軽減します。
オンボードパイプラインに加えて、MiSeq i100シリーズのデータは、簡素化されたランセットアップ、モニタリング、解析を提供するユーザーフレンドリーなゲノミクスクラウドコンピューティング環境であるBaseSpace Sequence Hubにストリーミングすることができます。ユーザーはそこで、NGSデータの正確な二次解析と可視化のためのDRAGENパイプラインの幅広いスイートにアクセスし、意味のある生物学的結果を得ることができます。
スケーラビリティとカスタムソリューションに関心のあるラボでは、MiSeq i100シリーズから、より幅広いパイプラインと高度に設定可能でスケーラブルな解析をサポートする柔軟なクラウドバイオインフォマティクスプラットフォームであるIllumina Connected Analyticsにデータをストリーミングすることができます。
DRAGEN二次解析は、受賞歴のあるバリアントコール精度を提供します。DRAGENにおけるマルチゲノム(グラフ)リファレンスとイルミナの機械学習により、PrecisionFDAベンチマークデータを用いた卓越した精度が実現します。1
DRAGENアプリは、MiSeq i100シリーズまたはBaseSpace Sequence Hub内で利用でき、データ解析をシンプルにします。
原核生物の16S小サブユニットrRNA遺伝子のアンプリコンシーケンスからDNAを解析し、分類学的手法の視覚的に表示します。
DNAまたはRNAアンプリコンデータのマッピング、アライメント、および生殖細胞系列や体細胞バリアントコーリングを実行します。
DRAGENプラットフォームのハードウェアアクセラレーションを使用して、イルミナシーケンスシステム(BCL)のネイティブ出力フォーマットを、サンプル分離FASTQファイルに変換します。オンボードで利用可能です。
全エクソームおよびターゲットパネルNGSデータで、生殖細胞系列および体細胞バリアントコールを実行します。
ハイスループットシーケンスデータの品質管理に使用される、一般的なメトリクスを計算します。オンボードで利用可能です。
単一サンプルおよび凝集体レポートを含む、複雑な微生物サンプルの分類学的手法を提供します。
タイル状のアンプリコンNGSパネルから、ウイルスの全ゲノムを解析します。
DRAGEN Microbial Enrichment Plus
エンリッチメントベースのNGSパネルから、ウイルス同定のためのコンセンサス配列を生成し、病原性微生物や抗菌薬耐性マーカーを検出します。オンボードで利用可能です。
DRAGEN Small WGS
全ゲノムシーケンスデータについて体細胞バリアントコーリングを実行します。オンボードで利用可能です。
Takara SMARTer Human TCR a/b Profiling
B細胞またはT細胞受容体の多様性とクローンの増殖を分析して、適応免疫系への洞察を得ます。
DRAGENデータ解析アプリは、さまざまなアプリケーションで使用可能なサンプルから解析までのNGSワークフローの一部です。
Illumina Connected Software のポートフォリオは、サンプル取り込みから洞察の探索まで、あらゆるワークフロー段階に対応するソリューションを提供する包括的なソフトウェアスイートです。
高度にカスタマイズ可能なラボ情報管理システム(LIMS)を使って、サンプルを追跡し、手順とワークフローを最適化し、ルーチンタスクの自動化を行います。
直感的なクラウドベースのランのセットアップとモニタリングに加え、データ解析を簡素化する幅広いバイオインフォマティクスアプリ。
シーケンサーの統合、カスタマイズ可能なワークフローの自動解析、またはすぐに使えるDRAGENパイプラインにより、バイオインフォマティクスワークフローを運用可能にします。
希少疾患や遺伝性疾患、遺伝性がんリスク、その他の遺伝子スクリーニングアプリケーション、細胞ゲノム、および大規模コホート研究のための、生殖細胞系列バリアントの解釈と研究レポートの作成を合理化します。
体細胞腫瘍学研究アプリケーションにおけるバリアント解釈とレポート作成を合理化します。
統計解析を実行し、インタラクティブでカスタマイズ可能、かつ出版向けのビジュアルでデータを探索します。
NGSプロジェクトの始め方を学び、革新的な発見力を活用しましょう。
NGSの基本を学び、始めるためのヒントを見つけましょう。
参考文献