MiSeq i100シリーズ仕様

迅速で柔軟性のあるシーケンス

短いランタイム、スケーラブルなアウトプット、卓越したデータ品質

ベンチトップ型のMiSeq i100システム

さまざまなリード長におけるフローセルあたりのアウトプット^a,c

リード長とは？ シーケンスリード長とは、シーケンスされた各DNA断片の長さを指し、片方の端または両端からシーケンスされるかによって異なります。たとえば、2 x 150 bpランでは、各DNA断片に対し、150塩基対の2つのリード（フォワードとリバース）が生成されます。長いリード長は、DNAシーケンス中のリピート領域をカバーする可能性が高くなりますが、短いリード長は、広範囲なゲノムカバレッジが必要ないカウント手法においてコスト効率が良い場合があります。

リード長の詳細

フローセルタイプ	5M	25M	50M^b	100M^b
1 x 100 bp	—	2.5 Gb	5 Gb	10 Gb
2 x 150 bp	1.5 Gb	7.5 Gb	15 Gb	30 Gb
2 x 300 bp	3 Gb	15 Gb	30 Gb	—
2 x 500 bp	—	25 Gb	—	—

サポートされているクラスター密度でイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づいた仕様。
50Mおよび100Mのフローセルは、MiSeq i100 Plusシステムでのみ利用可能です。
MiSeq i100シリーズソフトウェアv1.1.0以降は、MiSeq i100 25M Reagent Kit（1000サイクル）、すべてのMiSeq i100 Plus 50M Reagent Kit、すべてのMiSeq i100 Plus 100M Reagent Kitと併用する必要があります。
Software Managerのアップグレード

フローセルあたりのパスフィルターのリード数

パスフィルターリードとは何ですか？ クラスターのうち、Chastity^aフィルタリングを通過した割合を示します。各パスフィルタークラスタは、1リード（シングルエンドリードの場合）または2リード（ペアエンドリードの場合）を提供します。最初の25サイクルのうち、Chastity値が0.6未満のベースコールが1つ以下であった場合、そのクラスターはフィルターを通過します。シングルエンドランでは、一端からのみDNAをシーケンスするため経済的です。ペアエンドランは、DNAの両端をシーケンスするため、再配列や新規転写産物などの解析が容易になります。

リードパスフィルターの詳細

フローセルタイプ	5M	25M	50M^b	100M^b
シングルリード	5M	25M	50M	100M
ペアエンドリード	10M	50M	100M	200M

Chastityは、最も明るい塩基強度の比率を、最も明るい塩基強度と2番目に明るい塩基強度の合計で割った値として定義されます。
50Mおよび100Mのフローセルは、MiSeq i100 Plusシステムでのみ利用可能です。

クオリティスコア^a

クオリティスコアとは？ クオリティスコアまたはQスコアとは、ベースコーリングにおけるエラーの発生率の予測です。Qスコアが高いほど、エラーが起きる確率が低いことを示します。品質スコアが30なら、エラー率は1000分の1で、対応するコール精度は99.9%です。

シーケンスクオリティスコアの詳細はこちらこちらの

フローセルタイプ	5M	25M	50M^b	100M^b
1 x 100 bp	Q30以上の塩基が90%以上
2 x 150 bp	Q30以上の塩基が90%以上
2 x 300 bp	Q30以上の塩基が85%以上
2 x 500 bp	Q30以上の塩基が85%以上

Q30以上の塩基の割合は、シーケンスラン全体にわたって平均化されます。クオリティスコアは、イルミナのPhiXコントロールライブラリーを使用したMiSeq i100シリーズ試薬に基づきます。
50Mおよび100Mのフローセルは、MiSeq i100 Plusシステムでのみ利用可能です。

ランタイム

ランタイムとは？ ランタイムのシーケンスには、クラスター形成、オンボード変性、シーケンス、ベースコーリング、装置上のクオリティスコアリングが含まれます。

フローセルタイプ	5M	25M	50M^a	100M^a
1 x 100 bp	—	～4時間	～4.5時間	～5時間
2 x 150 bp	～7時間	～7時間	～７.5時間	～8時間
2 x 300 bp	～15時間	～15時間	～15.5時間	—
2 x 500 bp	—	約24時間	—	—

50Mおよび100Mのフローセルは、MiSeq i100 Plusシステムでのみ利用可能です。

主要アプリケーションの予想サンプルスループット

サンプルスループットとは？ サンプルスループットとは、フローセルごとに1回のランでシーケンスできるサンプルの数です。

トランスクリプトミクス
		フローセルあたりのサンプルの数
アプリケーション	サンプルあたりリード数	5M	25M	50M^a	100M^a
3’遺伝子発現	1～5M	1～5	5～25	10～50	25～100
ターゲットRNAパネル	1～5M	1～5	5～25	10～50	25～100
mRNA-Seq	10～25M	—	1～2	1～5	1～10
トータルRNA-Seq	50M	—	—	1	1～2
微生物ゲノム
病原体の検出	0.5～1M	1～10	1～50	1～100	1～200
16S アンプリコンシーケンス	0.1～0.2M	1～50	1～250	1～384	1～384
シャローショットガンメタゲノミクス	0.5～10M	1～10	1～12	1～25	1～50
ショットガンメタゲノミクス	10～25M	—	1～2	1～5	1～10
小規模全ゲノムシーケンス（WGS）^b	0.5M	1～10	1～50	1～100	1～200
ターゲット遺伝子シーケンス
アンプリコンベース	0.1～50M	1～5	1～250	1～384	1～384
エンリッチメントベース	0.1～50M	1～50	1～250	1～384	1～384
ゲノム編集	0.1～50M	1～50	1～250	1～384	1～384
免疫レパートリー	2～25M	—	1～12	1～25	1～50
品質管理
	ライブラリー QC	> 0.02M	最大384-プレックス	最大384-プレックス	最大384-プレックス

50Mおよび100Mのフローセルは、MiSeq i100 Plusシステムでのみ利用可能です。
平均5MBの細菌ゲノムの最低30×カバレッジに基づく、サンプルあたりの推定リード数。

装置の仕様

MiSeq i100 specifications

MiSeq i100シリーズ仕様^a

出力範囲^b
1.5～30 Gb
ラン1回あたりのペアエンドリード
10～200M
最大リード長
2 × 500 bp
ランタイム
約4～24時間

サポートされているクラスター密度でイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づいた仕様。
100Mフローセルの仕様に基づく最大範囲。 100Mフローセルは、MiSeq i100 Plusシステムでのみ利用可能です。

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主要なテクノロジー

室温の試薬

試薬は室温で出荷および保管され、すぐに使用できる状態であるため、シーケンス試薬のセットアップの時間が短縮されます。

インデックスファーストシーケンス

インデックスファーストシーケンシングにより、迅速なデマルチプレックスとリアルタイムラン管理を体験できます。

XLEAP-SBSのケミストリー

XLEAP-SBS ケミストリーは、これまでで最も高速で、最も堅牢、かつ最高品質のシーケンスケミストリーです。　　　

そのまますぐに使えるカートリッジ

フローセルとフルイディクスを単一のカートリッジに統合することで、セットアップが簡素化され、洗浄が不要になります。

合理化したバイオインフォマティクス

MiSeq i100シリーズとクラウドでの事前設計されたDRAGENパイプラインにより、データ解析が合理化されます。