MiSeq i100シリーズのアプリケーションと手法

最もシンプルなワークフローで最速の結果

初心者向けに最適化された柔軟な出力と、すぐに使えるワークフロー。当社最速で最もシンプルなベンチトップシーケンサーで、幅広いアプリケーションを実行

Scientist starting a sequencing workflow on MiSeq i100 System

主要なアプリケーションと手法

事前に設計されたサポートワークフローを使用するか、独自にワークフローを構築するかにかかわらず、当社はワークフローのあらゆるステップをサポートするオプションを提供します。

サポートされている試料解析のワークフロー:MiSeq i100およびMiSeq i100 Plusシステムは、さまざまな手法に対応する試料解析のワークフローを提供します。これらのワークフローは、ライブラリー調製キット、パネル、MiSeq i100シリーズのシーケンス、DRAGEN二次解析、およびデータ解釈(該当する場合)を含みます。今後、追加のワークフローにサポートサービスが提供される予定です。

微生物叢と病原体の探索

微生物コミュニティに存在する細菌タクサを同定し比較するための、複雑な生物学的サンプルのターゲット化された無培養シーケンス。

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

複雑なサンプル中の微生物を同定する無培養NGS法。従来の手法を使っていたなら見つからなかった細菌株を、費用対効果の高い培養不要の方法で同定します。

16S アンプリコンシーケンス

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データ解析および解釈

ショットガン DNAシーケンス

複雑なサンプル中に存在する、すべての微生物ゲノムの機能特性。迅速な統合ライブラリー調製は、最小限のハンズオンタイムで4時間以内に完了します。

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ライブラリー調製
3
データ解析および解釈

ショットガンRNAシーケンス

複雑なサンプル中に存在するすべてのコーディングRNAと、ノンコーディングRNAの機能定量化。リボソームRNAとヒトグロビンmRNAを、複数の種やサンプルタイプで効率的に枯渇させます。

シングルセルゲノム解析

分離され培養された細菌コロニーから、または特定した対象病原体のサーベイランス対象の一次サンプルから、既知の単一生物の微生物シーケンスと解析。

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

微生物全ゲノムシーケンス(WGS)

微生物ゲノムのマッピング、フィニッシング、または比較による深い洞察を得るための包括的な手法。迅速な統合ライブラリー調製は、最小限のハンズオンタイムで4時間以内に完了します。

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ライブラリー調製
3
データ解析および解釈

DRAGEN sWGS オンボードMiSeq i100

結核同定および薬剤耐性の特性評価

Mycobacterium tuberculosis complex株を同定するためのターゲットNGSパネル。わずか 9 pgのDNAから、シーケンスライブラリーを調製します。

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ライブラリー調製

パネルとライブラリー調製

3
データ解析および解釈

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

SARS-CoV-2 シーケンス

SARS-CoV-2ウイルスの特性評価のための、包括的なアンプリコンベースのアッセイ。ロースループットからミッドスループットのNGSアッセイにより、すべての規模のラボで新しいSARS-CoV-2バリアントを調査できます。

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ライブラリー調製

パネル

ライブラリー調製

3
データ解析および解釈

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

インフルエンザのシーケンス

公衆衛生サーベイランスおよび研究のための、インフルエンザA/BウイルスのWGSのためのマルチプレックスアンプリコンベースのアッセイ。インフルエンザA/B解析用の自動化しやすいRT-PCRとタグメンテーションベースのワークフロー。

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ライブラリー調製

パネルとライブラリー調製

3
データ解析および解釈

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

柔軟な微生物シーケンス

特定の対象微生物の同定と特性評価のための、カスタムでユーザー定義のターゲットシーケンス。目的の微生物をターゲットとするカスタムで公開済み、または市販のプライマーセットと互換性があります。

1
ライブラリー調製
3
データ解析および解釈

マルチ病原体シーケンス

アンプリコンベースのNGSによるマルチ病原体シーケンスには、PCRアンプリコンの超ディープシーケンスによるゲノム領域の関心領域の解析が含まれます。完全なウイルス特性評価を可能にします。

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

公衆衛生へのウイルスの脅威のシーケンス

SARS-CoV-2、インフルエンザ、ポリオウイルスなどの幅広いウイルスの特性評価のためのWGSデータを取得します。さまざまなサンプルタイプに対応するRNAウイルスとDNAウイルスを同時に解析します。

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ライブラリー調製

パネルとキット

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データ解析および解釈

DRAGEN Microbial Enrichment Plus オンボードのMiSeq i100

一般的な、呼吸器系ウイルスシーケンス

SARS-CoV-2やインフルエンザA/Bなどの一般的な呼吸器系ウイルスをターゲットとした効率的な検出。 ハイブリッドキャプチャー手法によるターゲットエンリッチメントは、高いリード深度を必要とせずに高感度な検出を実現します。

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ライブラリー調製
3
データ解析および解釈

DRAGEN Microbial Enrichment Plus オンボードのMiSeq i100

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

呼吸器病原体とAMR(薬剤耐性)シーケンス

合理化されたサンプルから結果までのワークフローにより、> 280の呼吸器病原体、および > 2000の抗菌薬耐性マーカーをターゲットとするNGSベースのパネル。

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ライブラリー調製
3
データ解析および解釈

DRAGEN Microbial Enrichment Plus オンボードのMiSeq i100

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

尿路病原体を調べるAMRシーケンス

合理化されたサンプルから結果までのワークフローにより、> 170の尿路病原体および > 3700の抗菌薬耐性マーカーをターゲットとするNGSベースのパネル。

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ライブラリー調製

パネルとキット

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データ解析および解釈

DRAGEN Microbial Enrichment Plus オンボードのMiSeq i100

ターゲットがんシーケンス

特定のがんタイプやパスウェイに関連する遺伝子について、焦点を合わせた選択により構成されるターゲットがんシーケンスは、より広範なゲノムプロファイリングアプローチを補完し、がん生物学を精査し理解するための複数のオプションをユーザーに提供します。

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

マルチがんCNV(コピー数多型)および融合解析

CNVや遺伝子融合を含む、複数のバリアントのターゲット検出。シングルチューブのSLIMampワークフローにより、迅速なライブラリー調製とターンアラウンドタイムが短縮されます。

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ライブラリー調製

ライブラリー調製

SLIMampアンプリコン調製

3
データ解析および解釈

データ解析

アンプリコンピラー PiVAT

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

骨髄がん遺伝子の検出

骨髄がんに高度に関連する58の関心遺伝子をターゲットにした、インテロゲーション。シングルチューブのSLIMampワークフローにより、迅速なライブラリー調製とターンアラウンドタイムが短縮されます。

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ライブラリー調製

ライブラリー調製

SLIMampアンプリコン調製

3
データ解析および解釈

データ解析

DRAGENのDNA

アンプリコンピラー PiVAT

リソース

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

固形腫瘍の融合遺伝子検出

固形腫瘍タイプ全体にわたり、関心のある複数の遺伝子再構成領域の集中的な検出。シングルチューブのSLIMampワークフローにより、迅速なライブラリー調製とターンアラウンドタイムが短縮されます。

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ライブラリー調製

パネル

Pillar oncoReveal マルチがんRNA融合v2パネル

ライブラリー調製

SLIMampアンプリコン調製

3
データ解析および解釈

データ解析

DRAGENのDNA

アンプリコンピラー PiVAT

がん遺伝子発現と融合遺伝子検出

1385のがん関連RNA転写産物についての包括的評価。FFPEサンプルを含むほとんどのサンプルタイプにわたる、がん関連転写産物の綿密で費用対効果の高い評価。

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ライブラリー調製

ライブラリー調製

SLIMampアンプリコン調製

3
データ解析および解釈

データ解析

アンプリコンピラー PiVAT

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

BRCA 遺伝子シーケンス

BRCA1/2変異およびコピー数バリエーションのターゲットシーケンスパネル。シングルチューブのSLIMampワークフローにより、迅速なライブラリー調製とターンアラウンドタイムが短縮されます。

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ライブラリー調製

ライブラリー調製

SLIMampアンプリコン調製

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データ解析および解釈

データ解析

データ解釈

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

遺伝性がんの遺伝子シーケンス

Targeted sequencing panel that assesses germline mutations across 113 genes and 125 SNPs associated with genetic cancer risk predispostion. 主要なオピニオンリーダーからのインプットにより開発され、専門家が定義したコンテンツ。

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ライブラリー調製
3
データ解析および解釈

データ解析

データ解釈

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

B細胞および/またはT細胞受容体多様性解析

B細胞またはT細胞受容体の多様性とクローンの増殖を分析して、適応免疫系への洞察を得ます。わずか10 ngから最大3 μgまでのRNAの幅広いRNAインプット量から、柔軟なライブラリー調製が可能です。

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データ解析および解釈

タカラのデータ解析

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