MiSeq i100シリーズのアプリケーションと手法

最もシンプルなワークフローで迅速な結果を提供

当社の最速かつ最もシンプルなベンチトップシーケンサーで、幅広いアプリケーションに対応。初心者向けに最適化された柔軟な出力と、すぐに使えるワークフロー。

MiSeq i100システムでシーケンスワークフローを開始するサイエンティスト

主なアプリケーションリソース

Benchtop applications ebook

このeBookをダウンロードして、ベンチトップシーケンサーが幅広いアプリケーションをサポートしながら優れたデータ品質と精度を実現方法をご覧ください。

NGS workflow finder

NGS Workflow Finderを使用して、目的のアプリケーションワークフローの推奨事項を入手すると、安心してシーケンスを行うことができます。

NGS library prep

MiSeq i100シリーズの製品発表ウェビナーをご覧ください。腫瘍、微生物、感染症のアプリケーションデータを紹介し、早期アクセスユーザーの洞察をご覧いただけます。

主要なアプリケーションと手法

事前に設計されたサポートワークフローを使用するか、独自にワークフローを構築するかにかかわらず、ワークフローのすべてのステップをサポートするオプションをご用意しています。

サンプルから解析までをサポートするワークフロー:MiSeq i100およびMiSeq i100 Plusシステムは、さまざまな手法に対応するサンプルから解析までのワークフローを提供します。これらのワークフローは、ライブラリー調製キット、パネル、MiSeq i100シリーズのシーケンス、DRAGEN二次解析、およびデータ解釈(該当する場合)が含まれます。今後、さらなるワークフローの対応も予定しています。

マイクロバイオームと病原体の探索

複雑な生体サンプルを対象とした、培養不要のターゲットシーケンスにより、微生物群集内の細菌分類群を同定・比較します。

サンプルから解析までをサポートするワークフロー

16S アンプリコンシーケンス

培養不要のNGS手法で、複雑なサンプル中の微生物を同定。従来の方法では検出できない細菌株を同定する、低コストかつ培養不要の手法です。

3
データ解析および解釈

ショットガンDNAシーケンス

複雑なサンプル中に存在する、すべての微生物ゲノムの機能特性。迅速かつ統合されたライブラリー調製により、4時間以内に完了し、ハンズオンタイムを最小限に抑えます。

1
ライブラリー調製
3
データ解析および解釈

ショットガンRNAシーケンス

複雑なサンプル中に存在するすべてのコーディングRNAと、ノンコーディングRNAの機能定量化。複数の種やサンプルタイプにわたり、リボソームRNAやヒトグロビンmRNAを効率的に除去します。

単一微生物のゲノムシーケンシング

分離され培養された細菌コロニーから、または特定した対象病原体のサーベイランス対象の一次サンプルからの、既知の単一生物の微生物のシーケンスと解析。

サポートされているサンプルから解析までのワークフロー

微生物全ゲノムシーケンス(WGS)

微生物ゲノムのマッピング、フィニッシング、または比較による深い洞察を得るための包括的な手法。迅速かつ統合されたライブラリー調製により、4時間以内に完了し、ハンズオンタイムを最小限に抑えます。

1
ライブラリー調製
3
データ解析および解釈

DRAGEN sWGS onboard MiSeq i100

結核の同定および薬剤耐性の特性評価

Mycobacterium tuberculosis(結核菌) 複合体株を同定するためのターゲットNGSパネル。わずか 9 pgのDNAから、シーケンスライブラリーを調製できます。

1
ライブラリー調製

パネル + ライブラリー調製

3
データ解析および解釈

サポートされているサンプルから解析までのワークフロー

SARS-CoV-2 シーケンス

SARS-CoV-2ウイルスの特性評価のための、包括的なアンプリコンベースのアッセイ。ロースループットからミッドスループットのNGSアッセイにより、あらゆる規模のラボで新しいSARS-CoV-2バリアントの監視ができます。

1
ライブラリー調製

パネル

ライブラリー調製

3
データ解析および解釈

サポートされている試料解析のサンプルから解析までのワークフロー

インフルエンザのシーケンス

公衆衛生サーベイランスおよび研究用のインフルエンザA/BウイルスのWGSを対象としたマルチプレックスのアンプリコンベースアッセイ。インフルエンザA/B解析用の自動化に対応したRT-PCRとタグメンテーションベースのワークフロー。

1
ライブラリー調製

パネル + ライブラリー調製

3
データ解析および解釈

サポートされているサンプルから解析までのワークフロー

柔軟な微生物シーケンス

特定の微生物の同定と特性評価のための、カスタム可能なユーザー定義のターゲットシーケンス。目的の微生物をターゲットとしたカスタム、公開済み、または市販のプライマーセットに対応。

1
ライブラリー調製
3
データ解析および解釈

マルチ病原体シーケンス

アンプリコンベースのNGSによるマルチ病原体シーケンスは、PCRアンプリコンの超ディープシーケンスを用いた特定のゲノム領域の解析を含みます。ウイルスの完全な特性評価を可能にします。

サポートされているサンプルから解析までのワークフロー

公衆衛生上の脅威となるウイルスシーケンス

SARS-CoV-2、インフルエンザ、ポリオウイルスなどの幅広いウイルスの特性評価のためのWGSデータを取得します。さまざまなサンプルタイプに対応し、RNAウイルスとDNAウイルスを同時に解析します。

1
ライブラリー調製

パネル + キット

3
データ解析および解釈

DRAGEN Microbial Enrichment Plus onboard MiSeq i100

一般的な呼吸器系ウイルスのシーケンス

SARS-CoV-2やインフルエンザA/Bなどの一般的な呼吸器系ウイルスをターゲットとして、効率的に検出します。 ハイブリッドキャプチャー手法によるターゲットエンリッチメントにより、高いリード深度を必要とせずに高感度な検出を実現します。

1
ライブラリー調製

パネル + キット

3
データ解析および解釈

DRAGEN Microbial Enrichment Plus onboard MiSeq i100

サポートされているサンプルから解析までのワークフロー

呼吸器病原体とAMR(薬剤耐性)シーケンス

合理化されたサンプルから結果までのワークフローにより、> 280の呼吸器病原体、および > 2000の抗菌薬耐性マーカーをターゲットとするNGSベースのパネル。

1
ライブラリー調製
3
データ解析および解釈

DRAGEN Microbial Enrichment Plus onboard MiSeq i100

サポートされているサンプルから解析までのワークフロー

尿路病原体を調べるAMRシーケンス

合理化されたサンプルから結果までのワークフローにより、> 170の尿路病原体および > 3700の抗菌薬耐性マーカーをターゲットとするNGSベースのパネル。

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ライブラリー調製
3
データ解析および解釈

DRAGEN Microbial Enrichment Plus onboard MiSeq i100

ターゲットがんシーケンス

特定のがんタイプやパスウェイに関連する遺伝子を集中的に選択するターゲットがんシーケンスは、より広範なゲノムプロファイリングアプローチを補完し、がんの生物学を精査し理解するための多様な選択肢をユーザーに提供します。

サポートされているサンプルから解析までのワークフロー

マルチがんCNV(コピー数多型)および融合解析

CNVや遺伝子融合を含む、複数のバリアントのターゲット検出。シングルチューブのSLIMampワークフローにより、迅速なライブラリー調製とターンアラウンドタイムの短縮が実現します。

1
ライブラリー調製

ライブラリー調製

SLIMamp Amplicon Prep

3
データ解析および解釈

データ解析

Amplicon Pillar PiVAT

サポートされているサンプルから解析までのワークフロー

骨髄がん遺伝子の検出

骨髄がんに関連性の高い58の関心遺伝子をターゲットにした調査。シングルチューブのSLIMampワークフローにより、迅速なライブラリー調製とターンアラウンドタイムの短縮が実現します。

1
ライブラリー調製

ライブラリー調製

SLIMamp Amplicon Prep

3
データ解析および解釈

データ解析

DRAGEN DNA

Amplicon Pillar PiVAT

リソース

サポートされているサンプルから解析までのワークフロー

固形腫瘍の融合遺伝子検出

固形腫瘍タイプ全体にわたり、注目すべき複数の遺伝子再構成領域を集中的に検出。シングルチューブのSLIMampワークフローにより、迅速なライブラリー調製とターンアラウンドタイムの短縮が実現します。

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ライブラリー調製

パネル

Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel

ライブラリー調製

SLIMamp Amplicon Prep

3
データ解析および解釈

データ解析

DRAGEN DNA

Amplicon Pillar PiVAT

がん遺伝子発現と融合遺伝子検出

1385のがん関連RNA転写産物についての包括的評価。FFPEサンプルを含むほとんどのサンプルタイプに対応し、がん関連転写産物の詳細かつ費用対効果の高い評価。

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ライブラリー調製

ライブラリー調製

SLIMamp Amplicon Prep

3
データ解析および解釈

データ解析

Amplicon Pillar PiVAT

サポートされているサンプルから解析までのワークフロー

BRCA 遺伝子シーケンス

BRCA1/2変異およびコピー数バリエーションのターゲットシーケンスパネル。シングルチューブのSLIMampワークフローにより、迅速なライブラリー調製とターンアラウンドタイムの短縮が実現します。

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ライブラリー調製

ライブラリー調製

SLIMamp Amplicon Prep

3
データ解析および解釈

データ解析

データ解釈

サポートされているサンプルから解析までのワークフロー

遺伝性がん遺伝子シーケンス

遺伝的がんリスク素因と関連する113遺伝子と125のSNPにわたる生殖細胞系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。キーオピニオンリーダーからの意見を取り入れて開発された、専門的に設計されたコンテンツ。

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ライブラリー調製
3
データ解析および解釈

データ解析

データ解釈

サポートされているサンプルから解析までのワークフロー

B細胞および/またはT細胞受容体多様性解析

B細胞またはT細胞受容体の多様性とクローンの増殖を分析して、適応免疫系への洞察を得ます。わずか10 ngから最大3 μgまでのRNAの幅広いRNAインプット量から、柔軟なライブラリー調製が可能です。

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データ解析および解釈

Takara Data Analysis

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