NGSによる悪性血液腫瘍のプロファイリング
血液がんの分子プロファイリング
血液悪性腫瘍は、米国で毎年診断される新規がん症例の9.5%を占めます。1造血分化の多くの段階は、異なる腫瘍サブタイプを引き起こす変異の複数の機会を提供します。2悪性腫瘍細胞のゲノム特性評価により、血液学の研究者らは、疾患の病因や、がんのサブタイプと治療選択肢との関連性についての洞察を得ることができます。
従来の単一遺伝子方法とは対照的に、次世代シーケンサー（NGS）は、感度と規模という点で大きな進展を遂げ、血液悪性腫瘍の重要なドライバー遺伝子に対する可視性を高めています。骨髄腫、リンパ腫、および白血病関連遺伝子をターゲットにしたNGSパネルにより、迅速かつ正確な分子プロファイリング研究が実現します。
血液悪性腫瘍のターゲットNGSパネル
幅広いNGS方法の中でも、ターゲットシーケンスは、がんゲノム研究への容易かつ費用対効果の高い参入方法といえます。骨髄性白血病、リンパ腫、および／またはその他の悪性血液疾患に関連する遺伝子に焦点を当てたターゲットNGSパネルは、全ゲノムシーケンスまたはエクソームシーケンスといったより幅広い方法と比べて、より小さく管理しやすいデータセットを生成します。
ターゲットNGSを使用した血液悪性腫瘍のプロファイリングは、研究者が何百ものサンプル分析を行うのに簡単に拡張できる、迅速でシンプルなワークフローに従います。多くのサンプルをまとめてプールし、同時に配列決定できるため、ラボでの検証手順が簡素化され、サンプルのスループットが大幅に向上します。
骨髄異形成症候群研究のNGS
骨髄異形成症やその他の困難な新生物の研究にあたりNGSが従来の細胞遺伝学的手法を補完する方法についての詳細はこちらから。
NGS、白血病やリンパ腫に対する洞察を提供
ミュンヘン白血病研究所のTorsten Haferlach博士が、さまざまな種類の白血病やリンパ腫を患う個人からのサンプル5,000個についてシーケンスを行う研究計画について語ります。その目標は、白血病やリンパ腫に対する理解をより深め、新しい治療法の可能性を発見することです。
血液悪性腫瘍研究用製品
骨髄性悪性腫瘍、リンパ腫およびその他の血液疾患用に専門家が選定したNGSパネルが、がん関連遺伝子の迅速な解析を実現します。これらのパネルは、異なるサンプルタイプの同一アッセイでの評価を可能にする、合理化されたワークフローを提供します。
イルミナのシーケンサーは、業界をリードする正確さを提供し、世界中のシーケンスデータの約90%を生成しています。* 効率的なレポート作成能力により、研究者らは重要な所見を、データ解析や傾向決定を促進する標準形式でアノテーションし、分類し、情報を伝えることができます。
以下のをクリックしてワークフローの各ステップに対応する製品をご覧ください。
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel
骨髄性悪性腫瘍や疾患に関連する40種のDNA遺伝子、29種のRNA融合ドライバー遺伝子、5種の遺伝子発現レベルを調べるターゲットパネル。
TruSight RNA Fusion多くのがんタイプにおいて融合遺伝子をターゲットにした遺伝子融合検出パネル。既知および新規の融合遺伝子パートナーを検出する能力があります。
TruSight RNA Pan-CancerFFPEを含む大半のがん研究サンプルタイプでの遺伝子発現、バリアントおよび融合遺伝子検出のために1385種のがん関連遺伝子をターゲットにしています。
AmpliSeq for Illumina Sequencing Solution
一回の実行で数種～数百種の遺伝子を範囲とするターゲットに使用するための、高度にマルチプレックス化されたポリメラーゼ連鎖反応（PCR）に基づくワークフロー
TruSight Myeloid Sequencing Panelがん遺伝子のエクソンと骨髄がんに関連するがん抑制遺伝子をターゲットにした、専門家が選定したDNA解析パネル。
TruSight Oncology UMI ReagentsTruSight Oncology UMI ReagentsとUMI Error Correction Appは、サンプルのエラー率を≦0.007%まで低減し、頻度の低いバリアントの検出を可能にします。
MiniSeqシステム
血液がんについての信頼できるロースループットのターゲットシーケンスのための小型かつ経済的なベンチトップ型シーケンサー。
MiSeqシステムシンプルなNGSワークフロー、統合されたデータ解析ソフトウェア、および比類のない精度を備えたデスクトップシーケンサー。
MiSeqDxシステム
FDA認証の体外診断NGSシステム。研究（RUO）モードでは高精度な信頼性の高いデータを生成することもできます。
NextSeq 550システムターゲットプロファイリングから全ゲノムシーケンスまでの複数のアプリケーションを支援する柔軟なデスクトップ型シーケンサー。
BaseSpace Sequence Hub
NGSデータ解析と管理を行うイルミナのゲノミクスコンピューティング環境。
Local Run Manager装置上でデータ解析を自動的に実行する、使いやすいソフトウェア。
BaseSpace Variant Interpreter
ゲノムバリアントのデータに対する生物学的洞察を提供するパワフルな解析／レポート作成ツール。
MiSeq ReporterMiSeqシステムでの解析とバリアントコールのための使いやすいソフトウェア。
ウェビナー：骨髄性悪性腫瘍におけるクローン進化のモデル化に対する遺伝学手法およびゲノム手法
この有益なウェビナーでは、Bobby Bowman博士が、骨髄性悪性腫瘍におけるクローン進化をモデル化するアプローチについて説明します。Bowman医学博士は、クローンレベルで同時に起こる変異を詳しく説明し、骨髄性疾患において31種の最も高率に変異が再発する遺伝子をクエリーするためのカスタム化したアンプリコンパネルの使用などについて語ります。これらの研究により、悪性化の段階、クローンの多様性、がん遺伝子と分化状態の関係などについて、新たな知見が得られています。
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参考文献
- Leukemia & Lymphoma Society (www.lls.org)
- Staudt LM. Molecular diagnosis of the hematologic cancers. N Engl J Med. 2003;348:1777-1785.
社内計算データにより Illumina, Inc. 2015.