TruSight Oncology UMI Reagents

次世代シーケンスライブラリー用の固有の分子識別子(UMI)によるエラー修正。 続きを読む...
製品の選択

TruSight Oncology UMI Reagents(16インデックス、48サンプル)

20024586

価格
 
 
Accessory Products
どのアクセサリーが必要ですか?

TruSight® Tumor 170コンテンツセット

20010188

価格
 
 

製品のハイライト

これらの試薬はシーケンスデータのバックグラウンドノイズを低減し、セルフリーDNA(cfDNA)に見られるような低頻度バリアントの検出を可能にします。

エラー率の低下

循環腫瘍DNA(ctDNA)は、次世代シーケンサー(NGS)の検出限界に近い、ごくわずかなcfDNAの割合を示す可能性があります。TruSight Oncology UMI Reagentsは、UMIとエラー修正ソフトウェアを使用してこの課題に対処し、エラー率を< 0.007%に低減し、低頻度バリアントの検出を可能にします。エラー率が低いと、解析の特異性が高まり、NGSデータの信頼性が高まります。

ワークフローの統合

TruSight Oncology UMI Reagentsには、UMIアダプターとインデックス、DNAライブラリー調製試薬と濃縮試薬が含まれます。これらの試薬は、TruSight Tumor 170 DNAオリゴと組み合わせることもできます。UMIを統合しても、ライブラリー調製ワークフローに余分なステップは作成されません。

エラー修正のための直感的ソフトウェア

UMIエラー修正アプリはリードをアライメントし、その後、UMIを使用して偽陽性を除外し、バリアントコーリングエラーを減らします。UMIエラー修正アプリは、クラウドベースのBaseSpace Sequence Hubまたはローカルインストールで利用できます。

TruSight Oncology製品ファミリー全体を見る

よく一緒に購入される製品

仕様

メソッドごとのワークフロー例

 

サポートデータと図

バックグラウンド低減により、正確なバリアントコーリングを促進
バックグラウンド低減により、正確なバリアントコーリングを促進

希少バリアントの正確な検出を可能にするために、UMIはエラー修正ソフトウェアと統合されており、真の変異をバックグラウンドノイズと区別することができます。下のパネルは、偽陽性につながる固有のエラーを除去することで、エラー率の低下によって真の変異(赤色の点)をバックグラウンドノイズ(灰色の点)と区別する方法を示しています。

 
UMIによるエラー率の削減
シーケンスラン 平均エラー率(未折り畳みリード) 平均エラー率(Collapsed Read)
1 0.038% 0.0023%
2 0.043% 0.0024%
3 0.035% 0.0024%
4 0.084% 0.0019%

ライブラリー調製は、TruSight Tumor 170 DNAアッセイのDNA含有量とペアになったTruSight Oncology UMI Reagentsを使用して行われ、31サンプルがHiSeq 4000システム上で4回の独立したシーケンスランに分配されました。平均エラー率は、UMIエラー修正アプリを使用して、折りたたまれたリードの有無で表示されます。

関連製品

TruSight Oncology 500

腫瘍変異負荷(TMB)やマイクロサテライト不安定性(MSI)など、複数のバリアントタイプをターゲットにしたアッセイ。


TruSight Tumor 170

同じホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルのDNAおよびRNAバリアントをターゲットにした包括的な次世代シーケンサー(NGS)アッセイ。


BaseSpace Sequence Hub

次世代シーケンサー(NGS)の運用を開始し、急速に拡大するラボのためのデータ管理および簡素化されたバイオインフォマティクス。


* NovaSeq 6000システムの性能は実証されましたが、広範囲にわたるテストは行われませんでした。