がん細胞学と NGS を通した、染色体変化の全体像

次世代シーケンサーとイクロアレイを使った、染色体異常に対するより深い理解

がん細胞遺伝学ソリューション

がん細胞でよく見られる染色体変化には、融合遺伝子、大規模染色体再配列、コピー数変異(CNV)が含まれます。がんに関与する染色体異常は、しばしば、細胞遺伝学解析を通して評価され、これは、現在ゲノム臨床研究の必須部分です。

細胞遺伝学では現在、がんにおける染色体異常について綿密な解析を行って、大規模および小規模の両方のゲノム変異の全体像を入手するために、補完的マイクロアレイと次世代シーケンサー(NGS)技術を利用できます。

腫瘍学

多くのサイエンティストは現在、がん細胞遺伝学の理解を深めるために、マイクロアレイをスクリーニングツールとして使います。蛍光 in situ ハイブリダイゼーション(FISH)と核型分析を含む、従来の染色体異常の評価法は、一般的に解像度が低く、限られたデータしか得られません。1 アレイは、高解像度とハイスループットで、コピー数の変化と不均衡な転座を同定するために、簡易で信頼性のおける方法を提供します。

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NGSは、ゲノム全体を塩基レベルで見ることによって、点変異、小さな挿入欠失、融合遺伝子のブレークポイントを同定することができます。この情報は、分子サブタイプ、予後のバイオマーカー、治療方針を提供するその他の指標を同定するのに役立ちます。

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細胞遺伝学でFISHと共にNGSが利用される理由

研究室には大量のサンプルがあるため、効率を上げることは非常に重要です。NGSはFISHを補完し、時間とコストを削減するとともに、未知の異常を有するサンプルを解析するためのベストプラクティスを満たすことができます。

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臨床研究者は、NGSとマイクロアレイを組み合わせることによって、がん細胞遺伝の全体像を入手することができます。

イルミナ製品は、専門家が選定した遺伝子構成2,3,4、正確なデータ、シンプルな分析、レポート作成の選択肢を提供して、臨床がん研究を促進します。

以下のをクリックしてワークフローの各ステップで使用する製品をご覧ください。

Infinium CytoSNP-850K BeadChip

がん研究で細胞遺伝学的に関連する遺伝子を最も包括的に網羅するよう、国際的コンソーシアムによって設計されました。

シーケンスシステム
NextSeq 550システム

シーケンスと高品質細胞遺伝アレイのスキャニングすべてを単一システムで実施。

シーケンスキット
TruSight RNA Fusion

多くのがんタイプにおいて融合遺伝子をターゲットにした遺伝子融合検出パネル。既知および新規の融合遺伝子パートナーを検出する能力があります。

TruSight Tumor 15

関連する固形腫瘍の体細胞バリアントを、サンプルからデータまでのシンプルなワークフローで評価する、焦点を絞ったパネル。

TruSight Myeloid Sequencing Panel

骨髄悪性腫瘍のがん遺伝子エクソンと、がん抑制遺伝子を標的とする専門家が選定したパネル*

TruSight Cancer Sequencing Panel

がん研究機関の協力で設計されたパネルで、がんの素因となる94の遺伝子と284のSNPをターゲットとします。

* 社内資料の専門家リスト。

BlueFuse Multi Software

単一構成で分子細胞遺伝学と着床前遺伝子検査(PGS)データ解析を提供する直感的ソフトウェア。

Local Run Manager

装置上でデータ解析を自動的に実行する、使いやすいソフトウェア。

MiSeq Reporter

MiSeq システムでの解析とバリアントコールのための使いやすいソフトウェア。

BaseSpace Sequence Hub

NGSデータの解析と管理を行うイルミナのゲノミクスコンピューティング環境。

ゲノム解析技術に関する最新のニュース、事例研究、情報を提供します。ぜひご登録ください。電子メールアドレスを入力してください。
がんにおける新規融合遺伝子とファーマコゲノミクスターゲット
がんにおける新規融合遺伝子とファーマコゲノミクスターゲット

市販の臨床NGSアッセイの最適化とバリデーションについて学びます。

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NGSは従来の細胞遺伝学的手法を補完する
次世代シーケンサー(NGS)は従来の細胞遺伝学的手法を補完します

腫瘍のゲノム解析は、遺伝子異常を網羅的に検出することができます。

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血液がんを検出するNGS
血液がんを検出するNGS

ターゲットNGSは、サンガーシーケンスまたは細胞遺伝学的方法よりも優れた感度で、骨髄関連遺伝子を同定できます。

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遺伝子融合を検出する包括的なパネル
遺伝子融合を検出する包括的なパネル

Ravindra Kolhe医学博士が、がんの遺伝子融合を調べるTruSight RNA Fusion Panelの使用について語ります。

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細胞遺伝学の専門家インタビュー

Trilochan Sahoo博士(Combimatrix の細胞遺伝学ディレクター)が、アレイベースのがん細胞遺伝解析についてお話しします。

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細胞遺伝学的解析:アレイからNGSまで
アレイ + NGS染色体研究

染色体異常や疾患との関連性を分析する研究室。

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がん細胞遺伝学研究が、髄膜腫のサブタイプを同定します

Ho氏らが、マイクロアレイを用いた遺伝子プロファイリングを介して、眼窩髄膜腫の3種類の異なるサブタイプを同定します。

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参考文献
  1. PROFOUND. Molecular Cytogenetics (FISH, Fluorescent In Situ Hybridization, Array-Based). Rep. no. 271067. N.p.: Global Industry Analysts, 2016. Print.
  2. International Collaboration for Clinical Genomics
  3. Cancer Genomics Consortium
  4. Conlin LK, Thiel BD, Bonnemann CG, et al. Mechanisms of mosaicism, chimerism and uniparental disomy identified by single nucleotide polymorphism array analysis. Hum Mol Genet. 2010;19(7):1263-75. doi: 10.1093/hmg/ddq003.