がん細胞遺伝学ソリューション
がんの細胞遺伝研究
がん細胞でよく見られる染色体変化には、融合遺伝子、大規模染色体再配列、コピー数変異（CNV）が含まれます。がんに関与する染色体異常は、しばしば、細胞遺伝学解析を通して評価され、これは、現在ゲノム臨床研究の必須部分です。
細胞遺伝学では現在、がんにおける染色体異常について綿密な解析を行って、大規模および小規模の両方のゲノム変異の全体像を入手するために、補完的マイクロアレイと次世代シーケンサー（NGS）技術を利用できます。
アレイ：がん細胞遺伝スクリーニングのための効果的な研究ツール
多くのサイエンティストは現在、がん細胞遺伝学の理解を深めるために、マイクロアレイをスクリーニングツールとして使います。蛍光 in situ ハイブリダイゼーション（FISH）と核型分析を含む、従来の染色体異常の評価法は、一般的に解像度が低く、限られたデータしか得られません。1 アレイは、高解像度とハイスループットで、コピー数の変化と不均衡な転座を同定するために、簡易で信頼性のおける方法を提供します。
詳細はこちらNGS: がん細胞遺伝の全体像
NGSは、ゲノム全体を塩基レベルで見ることによって、点変異、小さな挿入欠失、融合遺伝子のブレークポイントを同定することができます。この情報は、分子サブタイプ、予後のバイオマーカー、治療方針を提供するその他の指標を同定するのに役立ちます。
詳細はこちら細胞遺伝学でFISHと共にNGSが利用される理由
研究室には大量のサンプルがあるため、効率を上げることは非常に重要です。NGSはFISHを補完し、時間とコストを削減するとともに、未知の異常を有するサンプルを解析するためのベストプラクティスを満たすことができます。
インフォグラフィックはこちら
イルミナ製品
臨床研究者は、NGSとマイクロアレイを組み合わせることによって、がん細胞遺伝の全体像を入手することができます。
イルミナ製品は、専門家が選定した遺伝子構成2,3,4、正確なデータ、シンプルな分析、レポート作成の選択肢を提供して、臨床がん研究を促進します。
以下のをクリックしてワークフローの各ステップで使用する製品をご覧ください。
Infinium CytoSNP-850K BeadChip
がん研究で細胞遺伝学的に関連する遺伝子を最も包括的に網羅するよう、国際的コンソーシアムによって設計されました。
シーケンスキット
TruSight RNA Fusion多くのがんタイプにおいて融合遺伝子をターゲットにした遺伝子融合検出パネル。既知および新規の融合遺伝子パートナーを検出する能力があります。
TruSight Tumor 15関連する固形腫瘍の体細胞バリアントを、サンプルからデータまでのシンプルなワークフローで評価する、焦点を絞ったパネル。
TruSight Myeloid Sequencing Panel骨髄悪性腫瘍のがん遺伝子エクソンと、がん抑制遺伝子を標的とする専門家が選定したパネル*。
TruSight Cancer Sequencing Panelがん研究機関の協力で設計されたパネルで、がんの素因となる94の遺伝子と284のSNPをターゲットとします。
* 社内資料の専門家リスト。
BlueFuse Multi Software
単一構成で分子細胞遺伝学と着床前遺伝子検査（PGS）データ解析を提供する直感的ソフトウェア。
Local Run Manager装置上でデータ解析を自動的に実行する、使いやすいソフトウェア。
MiSeq Reporter
MiSeq システムでの解析とバリアントコールのための使いやすいソフトウェア。
BaseSpace Sequence HubNGSデータの解析と管理を行うイルミナのゲノミクスコンピューティング環境。
ゲノム解析技術に関する最新のニュース、事例研究、情報を提供します。ぜひご登録ください。電子メールアドレスを入力してください。
詳細はこちら
参考文献
- PROFOUND. Molecular Cytogenetics (FISH, Fluorescent In Situ Hybridization, Array-Based). Rep. no. 271067. N.p.: Global Industry Analysts, 2016. Print.
- International Collaboration for Clinical Genomics
- Cancer Genomics Consortium
- Conlin LK, Thiel BD, Bonnemann CG, et al. Mechanisms of mosaicism, chimerism and uniparental disomy identified by single nucleotide polymorphism array analysis. Hum Mol Genet. 2010;19(7):1263-75. doi: 10.1093/hmg/ddq003.