DNAとRNAのコンテンツを組み合わせた汎がんパネルで、シングルチューブのSLIMamp−(*ワークフローを利用して、ライブラリー調製とターンアラウンドタイムを高速化します。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
oncoReveal™ Multi-Cancer with CNV and RNA Fusion Panelは、DNA/RNAマルチがんパネルを組み合わせたパネルです。このアッセイでは、CNV Panelを備えたDNAベースのONCO/Reveal Multi-Cancer v4とONCO/Reveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panelとを組み合わせたジョイントシーケンスを可能にします。このアッセイは、効率的なシングルチューブターゲット濃縮用タイル状アンプリコンベースのライブラリー調製ケミストリーである独自のStem-Loop Inhibition-Mediated増幅（SLIMamp®）テクノロジーを使用しています。
| アッセイ時間 | 約6.5時間 |
|---|---|
| がんの種類 | 汎がん (Pan-cancer), 固形腫瘍 |
| コンテンツ仕様 | 78遺伝子小型汎腫瘍用腫瘍学パネル |
| 説明 | DNAおよびRNAのコンテンツ、シンプルなシングルチューブワークフローを備えた78遺伝子アンプリコンベースのパネル |
| ハンズオンタイム | 約3時間 |
| インプット量 | DNA 5～80 ng、RNA 10～50 ng |
| システム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード |
| 作用機序 | タイルアンプリコンを使用したマルチプレックスPCR法 |
| 手法 | ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス |
| 核酸の種類 | DNA, RNA |
| アンプリコン数 | プール1（DNA）：341アンプリコン。プール2（RNA）：<80アンプリコン＋METエクソン14スキッピング |
| 反応数 | 24 DNA/24 RNA |
| オンターゲットリード | 99.5% ± 0.1% |
| 対応サンプルタイプ | 血液, 少量インプットサンプル, FFPE組織 |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| ターゲットインサートサイズ | 平均：120 bp（範囲：86～185 bp） |
| テクノロジー | シーケンス |
| 均一性 | 98.2% ± 0.7% |
| バリアントクラス | 融合遺伝子, 体細胞バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） |
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Pillar® oncoReveal™ Multi-Cancer CNV + RNA Fusion Panel
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進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンスアプリケーションに対応する、高速で、統合されたライブラリー調製のワークフロー。
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